Entwicklung eines Systems zur deklarativen Beschreibung und effizienten Suche hybrider Muster in großen genomischen Datenmengen

论文发表于System entwickelt werden， das Es ermöglicht, grosse Biosequenz-Datenbanken nach komplexen musterauf Nukleinsäure- and Protein-Ebene zu durchsuchen。还记得吗？混合动力发动机，die Sequenzähnlichkeit, strukturelle Ähnlichkeit and weitere, frei definierbare Merkmale, wiz . b . thermodynamicnebenbedingungen, kombinieren。Es wurde begonnen， eine Bibliothek生物学相关的研究与分析Testfälle eine宣言性的mussterbeschreibungssprache zu entwickeln。Die Erstellung der鼓起，Die bisher per Hand鼓起，soll aufbauend aufserer bisherigen erfahung z.T. automatisiert werden, um Die Vervollständigung der Bibliothek von mussterbeschreibungen zu beschleunigen。Parallel dazu wurde begonnen, einen Prototypen des Suchwerkzeugs zu erstellen；基于此算法的优化算法及其实现集成与优化：基于Suchreihenfolge理论的集成与优化。图书馆生物学相关期刊。这是一种可视化的方法，它可以帮助我们更好地理解视觉。Die Erprobung des Werkzeugs and vorliegenden Gendatenbeständen schliesst in ausgewählten Fällen Die labortechnische Überprüfung algorithmisch gewonneer funcktionshypothesen。

Es soll ein System entwickelt werden, das es ermöglicht, grosse Biosequenz-Datenbanken nach komplexen Mustern auf Nukleinsäure- und Protein-Ebene zu durchsuchen. Als Muster sind sog. hybride Muster erlaubt, die Sequenzähnlichkeit, strukturelle Ähnlichkeit und weitere, frei definierbare Merkmale, wie z.B. thermodynamische Nebenbedingungen, kombinieren. Es wurde begonnen, eine Bibliothek biologisch relevanter Muster zu erstellen und anhand dieser Testfälle eine deklarative Musterbeschreibungssprache zu entwickeln. Die Erstellung der Muster, die bisher per Hand erfolgte, soll aufbauend auf unserer bisherigen Erfahrung z.T. automatisiert werden, um die Vervollständigung der Bibliothek von Musterbeschreibungen zu beschleunigen. Parallel dazu wurde begonnen, einen Prototypen des Suchwerkzeugs zu erstellen; einige grundlegende Algorithmen zur effizienten Suche der Muster sind bereits implementiert; ihre Integration und die Optimierung der Suchreihenfolge für einzelne Teilmuster stehen noch aus. Die Bibliothek biologisch relevanter Muster soll inkl. Suchwerkzeug und einer Visualisierungskomponente zur vereinfachten Darstellung der Suchantworten im WWW zur Verfügung gestellt werden. Die Erprobung des Werkzeugs an vorliegenden Gendatenbeständen schliesst in ausgewählten Fällen die labortechnische Überprüfung algorithmisch gewonnener Funktionshypothesen ein.