Dynamik interner Wassermoleküle im Grün Fluoreszierenden Protein - Untersuchung mit Monte-Carlo-Simulationen im Großkanonischen Ensemble

在蒙特-卡罗-Simulationen durchgeführt韦尔登的项目中，使用内部绿色蛋白质（GFP）的Günstige Wasserstoffbrückennetzwerke进行识别。Dabei soll zunächst lediglich die Anzahl und Position der internen Wassermoleküle im Proteininneren für versedene Protonierungszustände des Proteins optimiert韦尔登.大卡诺尼什河流域的人都很喜欢。Weiterhin soll im Verlauf des Projekts eine Methode entwickelt韦尔登，um neben den erwähnten Freiheitsgraden der Wassermoleküle auch die Protonierungszustände titrierbarer Aminosäurereste zu optieren.所有这些都是韦尔登的结果，即通过一种复杂的染料稳定性韦尔登的不可逆定向作用使GFP-发色团的中性和阴离子形式。这些结果将在蛋白质中用于动态过程。Die im Verlauf des Projekts erarbeitete Method，bei der Protonierungszustände des Proteins in Simulationen variabel sind，wird vielversprechende Einsatzmöglichkeiten，z.B.从而对蛋白质-配体-蛋白质组学进行了研究。

In dem Projekt sollen Monte-Carlo-Simulationen durchgeführt werden, um thermodynamisch günstige Wasserstoffbrückennetzwerke im Inneren des Grün Fluoreszierenden Proteins (GFP) zu identifizieren. Dabei soll zunächst lediglich die Anzahl und Position der internen Wassermoleküle im Proteininneren für verschiedene Protonierungszustände des Proteins optimiert werden. Das Großkanonische Ensemble ist dazu besonders geeignet. Weiterhin soll im Verlauf des Projekts eine Methode entwickelt werden, um neben den erwähnten Freiheitsgraden der Wassermoleküle auch die Protonierungszustände titrierbarer Aminosäurereste zu optimieren. Als konkretes Ziel soll erarbeitet werden, wie die neutralen und anionischen Formen des GFP-Chromophors durch unterschiedliche Orientierungen eines komplexen Wasserstoffbrückennetzwerks stabilisiert werden. Dieses Ergebnis wird allgemein für das Verständnis dynamischer Prozesse in Proteinen wertvoll sein. Die im Verlauf des Projekts erarbeitete Methode, bei der Protonierungszustände des Proteins in Simulationen variabel sind, wird vielversprechende Einsatzmöglichkeiten, z.B. zur Beschreibung der Protein-Liganden-Wechselwirkungen haben.