Ab-initio-Vorhersage der Sekundär- und Tertiärstruktur von Polypeptiden aus der Primärstruktur, durch Anwendung hierarchischer evolutionärer Algorithmen im Raum optimierter Sekundärstrukturen, ohne Verwendung von Datenbankinformationen
Ab-initio-Vorhersage der Sekundär- und Tertiärstruktur von Polypeptiden aus der Primärstruktur, durch Anwendung hierarchischer evolutionärer Algorithmen im Raum optimierter Sekundärstrukturen, ohne Verwendung von Datenbankinformationen
批准号:
5439308
负责人:
Professor Dr. Bernd Hartke
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2004
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2003-12-31 至 2008-12-31
中文摘要
Basierend auf ersten,erfolgreichen Vorarbeiten soll in Diesem Projekt ein allgemines Programm zur ab-Initio-Strukturvorhersage von Proteinen Aus ihrer Primärequenz entwickelt wickelt den,Under Verzicht auf Homologie-Informationen Aus Protec-Datenbanken.在进化算法的基础上,我们实现了全球最优算法。我是Gegensatz zu Bisherigen Strategien Dieser Art Wird Net Net Direckt im Raum der Diederwinkel des Proteinrück grats periert,sondern hauptsächlich in einem abstrakteren raum der Sekundärstrukturen。在模型建立和求解过程中,我们发现了一种新的最优的多肽序列分析方法,即多肽序列模型和寡肽模型的关联。从现在起,这些项目的结果都是积极的,因为它们是我们的基础设施,也是最好的基础设施,因此,我们需要更多的产品和服务。
英文摘要
Basierend auf ersten, erfolgreichen Vorarbeiten soll in diesem Projekt ein allgemeines Programm zur ab-initio-Strukturvorhersage von Proteinen aus ihrer Primärsequenz entwickelt werden, unter Verzicht auf Homologie-Informationen aus Protein-Datenbanken. Dabei wird globale Optimierung durch evolutionäre Algorithmen als Hauptinstrument verwendet. Im Gegensatz zu bisherigen Strategien dieser Art wird hier nicht direkt im Raum der Diederwinkel des Proteinrückgrats operiert, sondern hauptsächlich in einem abstrakteren Raum der Sekundärstrukturen. Nach Auswahl der geeignetsten Kraftfelder und Solvatationsmodelle, gegenenfalls auch nach Re-Optimierung der wichtigsten Parameter darin, werden Tertiärstrkturvorhersagen praktisch relevanter Genauigkeit nicht nur für kleinere Modell-Oligopeptide sondern auch für längere reale Polypeptidsequenzen angestrebt. Selbst bei einem Scheitern des Projekts sind positive Resultate zu erwarten: Neben einer fundierten Antwort auf die wichtige offene Frage, inwieweit Proteinfaltung einer Energieminimierung entspricht, auch ein Polymerfaltungs-Optimierungsprogramm, dass sich unschwer von Polypeptiden auch auf ganz andere Polymere übertragen ließe und damit für die Makromolekulare Chemie und Kolloidchemie interessant wäre.
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Global optimization of reactive force fields
-
批准号:245894149
-
项目类别:Research Grants
-
资助金额:$0.0万
-
财政年份:2013
-
负责人:Professor Dr. Bernd Hartke
-
依托单位:
Elucidation of static and dynamic solvent effects by global structure optimization and molecular dynamics of microsolvation clusters
-
批准号:170008408
-
项目类别:Research Grants
-
资助金额:$0.0万
-
财政年份:2010
-
负责人:Professor Dr. Bernd Hartke
-
依托单位:
Gezielte Variation statischer und dynamischer Eigenschaften von Doppelprotonentransferreaktionen mit plateauartigen Energieprofilen
-
批准号:27316451
-
项目类别:Research Grants
-
资助金额:$0.0万
-
财政年份:2006
-
负责人:Professor Dr. Bernd Hartke
-
依托单位:
Magische Zahlen und Clathratstrukturen bei Mikro-Solvatationsclustern einfacher Kationen in der Gasphase
-
批准号:5350719
-
项目类别:Research Grants
-
资助金额:$0.0万
-
财政年份:2001
-
负责人:Professor Dr. Bernd Hartke
-
依托单位:
Structural transitions in small and medium- sized silicon clusters, detected with improved global geometry optimization methods
-
批准号:5276660
-
项目类别:Research Grants
-
资助金额:$0.0万
-
财政年份:2000
-
负责人:Professor Dr. Bernd Hartke
-
依托单位:
Efficient and scalable global structure optimization
-
批准号:280675984
-
项目类别:Research Grants
-
资助金额:$0.0万
-
财政年份:--
-
负责人:Professor Dr. Bernd Hartke
-
依托单位:
国内基金
海外基金
微溶剂效应对 SN2 反应动力学的影响:直接 ab initio 轨线研究
-
批准号:21573052
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:66.0万元
-
批准年份:2015
-
负责人:张家旭
-
依托单位:
有限核对关联和微观对相互作用的研究
-
批准号:11075213
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:30.0万元
-
批准年份:2010
-
负责人:田源
-
依托单位: