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DENSITY AB INITIO MECHANICS & DYNAMICS TO SIMULATE CHEMICAL BIOMOLECULAR SYSTEMS

DENSITY AB INITIO MECHANICS & DYNAMICS TO SIMULATE CHEMICAL BIOMOLECULAR SYSTEMS
密度从头力学
批准号：
6295147
负责人：
PETER A KOLLMAN
金额：
$1.19万
依托单位：
MELLON PITTS CORPORATION (MPC CORP)
依托单位国家：
美国
项目类别：
财政年份：
1998
资助国家：
美国
项目状态：
已结题
起止时间：
1998-09-30 至 1999-07-31
来源：
https://reporter.nih.gov/project-details/6295147
关键词：
biological products biomedical resource computers drug /agent

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
我们建议继续我们的分子的应用 络合分子的动力学和自由能计算 浓缩相，强调在蛋白质、核酸方面的应用 和电离团。这项研究的目标是开发出 可以正确地表示这样的系统的结构和能量 并将这些模型应用于配体结合、蛋白质和 核酸稳定性、酶催化和药物设计。我们也 建议继续开发和优化琥珀软件以供使用 在共享内存和消息传递并行计算机上。
英文摘要
We propose a continuation of our applications of molecular dynamics and free energy calculations to complex molecules on condensed phases, emphasizing applications to proteins, nucleic acids and ionophores. The goals of this research are to develop models that can correctly represent the structures and energetics of such systems and to apply these models to problems in ligand binding, protein and nucleic acid stability, enzyme catalysis and drug design. We also propose to continue to develop and optimize out AMBER software for use on both shared memory and message passing parallel computers.
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会议论文
SIMULATION OF COMPLEX MOLECULAR SYSTEMS
  • 批准号：
    8364239
  • 项目类别：
  • 资助金额：
    $0.11万
  • 财政年份：
    2011
  • 负责人：
    PETER A KOLLMAN
  • 依托单位：
    CARNEGIE-MELLON UNIVERSITY
Collaboration work with AMBER
COLLABORATION WORK WITH AMBER
NON COVALENT INTERACTIONS IN MOLECULAR DESIGN & PROTEIN FOLDING
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