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Real-time proteomics on heterogeneous multi-core processors

Real-time proteomics on heterogeneous multi-core processors
异构多核处理器上的实时蛋白质组学
批准号：
327498-2009
负责人：
Green, James
金额：
$1.38万
依托单位：
Carleton University
依托单位国家：
加拿大
项目类别：
Discovery Grants Program - Individual
财政年份：
2011
资助国家：
加拿大
项目状态：
已结题
起止时间：
2011-01-01 至 2012-12-31
来源：
https://www.nserc-crsng.gc.ca/ase-oro/Details-Detailles_eng.asp?id=481751
关键词：
Realtimeproteomicsheterogeneousmulti

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
串联质谱（MS/MS）是一种从未知混合物中鉴定蛋白质的分析技术，已成为现代蛋白质组学的基石。目前，蛋白质鉴定被降级为在数据收集阶段之后离线进行，此时在不明确的鉴定的情况下采取纠正措施为时已晚。通过充分加速数据分析，可以关闭反馈回路并实现真正的假设驱动的数据收集。该研究计划将产生用于光谱处理和蛋白质鉴定的新算法，以实现MS/MS设备的实时控制。
英文摘要
Tandem mass spectrometry (MS/MS) is an analytical technique for identifying proteins from an unknown mixture, and has become a cornerstone of modern proteomics. Currently, protein identification is relegated to take place offline, after the data collection phase, when it is too late to take corrective action in the case of an ambiguous identification. By sufficiently accelerating the data analysis, it becomes possible to close the feedback loop and achieve true hypothesis-driven data collection. This research program will result in new algorithms for spectral processing and protein identification to enable real-time control of a MS/MS device.
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会议论文
Reciprocal Perspective Machine Learning to Identify Relationships in Sparse Biological Networks
  • 批准号：
    RGPIN-2021-04184
  • 项目类别：
    Discovery Grants Program - Individual
  • 资助金额：
    $2.55万
  • 财政年份：
    2022
  • 负责人：
    Green, James
  • 依托单位：
    Carleton University
Metal Mediated and Catalyzed Organic Synthetic Methods
  • 批准号：
    RGPIN-2022-04761
  • 项目类别：
    Discovery Grants Program - Individual
  • 资助金额：
    $1.75万
  • 财政年份：
    2022
  • 负责人：
    Green, James
  • 依托单位：
    University of Windsor
Unobtrusive neonatal patient monitoring using video and pressure data
  • 批准号：
    543940-2019
  • 项目类别：
    Collaborative Research and Development Grants
  • 资助金额：
    $2.48万
  • 财政年份：
    2021
  • 负责人：
    Green, James
  • 依托单位：
    Carleton University
Reciprocal Perspective Machine Learning to Identify Relationships in Sparse Biological Networks
  • 批准号：
    RGPIN-2021-04184
  • 项目类别：
    Discovery Grants Program - Individual
  • 资助金额：
    $2.55万
  • 财政年份：
    2021
  • 负责人：
    Green, James
  • 依托单位：
    Carleton University
国内基金
海外基金
SERS探针诱导TAM重编程调控头颈鳞癌TIME的研究
  • 批准号：
    82360504
  • 项目类别：
    地区科学基金项目
  • 资助金额：
    32万元
  • 批准年份：
    2023
  • 负责人：
    周学军
  • 依托单位：
    海南医学院
华蟾素调节PCSK9介导的胆固醇代谢重塑TIME增效aPD-L1治疗肝癌的作用机制研究
  • 批准号：
    82305023
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    30万元
  • 批准年份：
    2023
  • 负责人：
    王萌
  • 依托单位：
    安徽中医药大学
基于MRI的机器学习模型预测直肠癌TIME中胶原蛋白水平及其对免疫T细胞调控作用的研究
  • 批准号：
    --
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    52万元
  • 批准年份：
    2022
  • 负责人：
    李文政
  • 依托单位：
    中南大学
结直肠癌TIME多模态分子影像分析结合深度学习实现疗效评估和预后预测
  • 批准号：
    62171167
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    57万元
  • 批准年份：
    2021
  • 负责人：
    姜慧杰
  • 依托单位：
    哈尔滨医科大学