The complete chloroplast genome of the desert shrub Nitraria sphaerocarpa (Nitrariaceae) and phylogenetic analysis.

The complete chloroplast genome of the desert shrub Nitraria sphaerocarpa (Nitrariaceae) and phylogenetic analysis.
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沙漠灌木白刺 (Nitraria sphaerocarpa) 的完整叶绿体基因组和系统发育分析

DOI:
10.1080/23802359.2021.1934580
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发表时间:
2021-06-14
期刊:
Mitochondrial DNA. Part B, Resources
影响因子:
--
通讯作者:
Feng Y
Feng Y
中科院分区:
其他
文献类型:
--
作者:
Song F;Feng Y

文献摘要

参考文献

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摘要球果白刺是一种典型的沙漠灌木,通常用作固沙剂。在此,我们对N.球果属它的长度为159,369 bp,包含两个反向重复(IR)区域(每个26,566 bp),一个大的单拷贝(LSC)区域(87,854 bp)和一个小的单拷贝(SSC)区域(18,383 bp)。它有114个单基因,包括79个蛋白质编码基因,30个tRNA基因,4个rRNA基因和1个假基因(infA)。系统发育分析表明,N. Sphaerocarpa位于白刺属的基部位置。
Abstract Nitraria sphaerocarpa Maxim. is a typical desert shrub commonly used as a sand binder. Here, we sequenced and characterized the whole plastid genome of N. sphaerocarpa. It is 159,369 bp in length, containing two copies of inverted repeat (IR) regions (26,566 bp, each), a large single-copy (LSC) region (87,854 bp), and a small single-copy (SSC) region (18,383 bp). It has 114 unigenes, including 79 protein-coding genes, 30 tRNA genes, four rRNA genes, and one pseudogene (infA). Phylogenetic analysis shows that N. sphaerocarpa is located at a basal position of the genus Nitraria.
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