Analyse der 5` und 3` nicht kodierenden Regionen des Cherry leaf roll virus

樱桃卷叶病毒5`和3`非编码区分析

• 批准号: 115444898
• 负责人: Professorin Dr. Carmen Büttner
• 金额: --
• 依托单位: Fachgebiet Phytomedizin
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2008-12-31 至 2010-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/115444898?language=en
• 关键词: Analyse; der; und; nicht; kodierenden

Die genetische Heterogenität von CLRV-Isolaten wird grundsätzlich, jedoch nicht ausschließlich, durch die Wirtspflanzenart bestimmt. Zum Beispiel deutet die unterschiedliche phylogenetische Gruppierung eines Himbeer-Isolats nach Analyse verschiedener Genombereiche auf genetische Rekombinationen zwischen CLRVIsolaten hin, die möglicherweise eine erhöhte Virulenz von CLRV bedingen. Rekombinationsanalysen sollen Hinweise darauf geben, ob die genetische Organisation des Himbeer-Isolates gegenüber anderen CLRV-Isolaten bzw. die RNA-Population innerhalb dieses Isolates hinsichtlich ihrer Sequenz-Stabilität differiert. Das CLRV besitzt ein bipartites Genom mit zwei RNAs, die 3`polyadenyliert sind und am 5` und 3`Terminus jeweils einen offenen Leserahmen flankieren. Die Translation der beiden RNAs erfolgt Cap-unabhängig, die Regulationsmechanismen sind aber bisher nicht bekannt. Vermutlich spielen hierbei die nicht kodierenden Regionen der beiden RNAs eine wichtige Rolle, die daher auf ihre Sekundärstrukturbildung und auf translationsassoziierte Sequenzmotive, wie sie für andere Viren bekannt sind, untersucht werden sollen, um ein CLRV-Translationsmodell zu erstellen.

CLRV-隔离株的遗传异质性是非常重要的，但并不完全是通过遗传学的方法来实现的。通过对CLRV分离株进行基因组学验证和基因重组分析，发现CLRV的高毒力菌株。Himbeer-Isolates和CLRV-Isolates的遗传学组织对Hinweise进行了重新组合分析。RNA-群体内halb dieses Isolates hinsichtlich ihrer Sequenz-Stabilität differiert. CLRV是一个含有两个RNA的双组分基因组，3 ′端多聚腺苷酸，5 ′端和3 ′端的小分子是一个侧翼的小分子。RNA的翻译没有限制，调控机制并不重要。Vermutlich spielen hierbei die kodierenden Regionen der beiden RNA eine wichtige Rolle，die daher auf ihre Sekundärstrukturbildung und auf problationsassozierte Sequenzmotive，wie sie für andere Viren bekannt sind，untersucht韦尔登sollen，um ein CLRV-Translationsmodell zu erstellen.