Komparative und explorative genetische und metabolische Analysen zu den Anforderungen an eine zellfreie Kultivierung der pflanzenpathogenen Phytoplasmen

植物病原植原体无细胞培养要求的比较探索性遗传和代谢分析

• 批准号: 204307631
• 负责人: Professorin Dr. Carmen Büttner
• 金额: --
• 依托单位: Institut für Nutztierwissenschaften (460)
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2010-12-31 至 2014-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/204307631?language=en
• 关键词: Komparative; und; explorative; genetische; metabolische

Im vorliegenden Projekt sollen erstmalig mit Hilfe der Bioinformatik die im Genom kodierten Abhängigkeiten ausgewählter Phytoplasmen an ein zellfreies Kulturmedium umfassend bestimmt werden und den Acholeplasmen gegenübergestellt werden. Diese innovative Strategie geht zunächst von den in axenischen Kulturen vorliegenden Acholeplasmen aus. Hierbei erfolgt eine Genomanalyse der bisher unveröffentlichten Genome von A. palmae und A. brassicae sowie des veröffentlichten Genoms von A. laidlawii. In einer komparativen Analyse wird die umfangreiche genetische Ausstattung dieser nächsten bekannten Verwandten den bisher veröffentlichten kondensierten Genomen der Phytoplasmen gegenüber gestellt. Die so konsequent neu aufgebaute Datenmatrix, die den Prozess der Genomkondensation und des hierin kodierten Stoffwechsels effektiv erfasst, soll dann mit Hilfe von Draftsequenzen von noch nicht analysierten Subgruppen der Phytoplasmen erweitert werden. Die zur Zeit vorliegenden Daten ermöglichen lediglich fragmenthafte Einblicke in die Diversität und die damit verbundene genetische Ausstattung. Unsere gewählte moderne Vorgehensweise ermöglicht in kurzer Zeit einen differenzierten Einblick in die Vielfalt und Spezialisierung der Phytoplasmen. Unterschiede, Gemeinsamkeiten und Defizite in der heterogenen Ausstattung unterschiedlicher Subgruppen werden so zielgerichtet mit bioinformatischen Methoden analysiert. Die Resultate ermöglichen das Ableiten allgemeiner sowie stammspezifischer Abhängigkeiten bzw. Anforderungen der Phytoplasmen an Pflanze und Vektor ebenso wie an ein Kulturmedium. Im Rahmen des Projektes können so vorhandene Kulturmedien abgeändert, die Anforderungen differenziert berücksichtigt und der Fortschritt im Experiment validiert werden. Ziel ist es, die gewonnenen Erkenntnisse für eine Anreicherungskultur oder axenische Kultur zu nutzen.

我的研究项目是关于生物信息学的研究，是基因组研究中的植原体和 Zulturmedium umfassend bestimmt werden 和 Acholeplasmen gegenübergestellt werden。这种创新策略是在 axenischen Kulturen vorliegenden Acholeplasmen aus 中实现的。 Hierbei erfolgt eine Genomanalysis der bisher unveröffentlichten Genome von A. palmae 和 A. brasicae sowie des veröffentlichten Genoms von A.laidlawii.在比较分析中，我们对植原体基因组的基因组进行了比较分析。因此，新的数据矩阵、基因压缩过程和有效成分的进展，将在对植原体亚组的分析中进行。 Die zur Zeit vorliegenden Daten ermöglichen lediglichfrafte in die Diversität und die damit verbundenegenetische Ausstattung。 Unsere gewählte 现代 Vorgehensweise ermöglicht in kurzer Zeit einen diffenzierten Einblick in die Vielfalt und Spezialisierung der Phytoplasmen。生物信息方法分析中的异质子组的Unterschiede、Gemeinsamkeiten 和 Defizite。 Die Resultate ermöglichen das Ableiten allgemeiner sowie stammspezifischer Abhängigkeiten bzw。 Anforderungen der Phytoplasmen an Pflanze und Vektor ebenso wie an ein Kulturmedium。我的项目主要是针对文化媒体的，在实验中进行不同的设计和研究。 Ziel ist es, die gewonnenen Erkenntnisse für eine Anreicherungskultur oder axenische Kultur zu nutzen.

项目成果

Transcriptomics assisted proteomic analysis of Nicotiana occidentalis infected by Candidatus Phytoplasma mali strain AT

• DOI: 10.1002/pmic.201300551
• 发表时间: 2014-08-01
• 期刊: PROTEOMICS
• 影响因子: 3.4
• 作者: Luge, Toni;Kube, Michael;Sauer, Sascha
• 通讯作者: Sauer, Sascha

The AAA+ ATPases and HflB/FtsH proteases of 'Candidatus Phytoplasma mali': phylogenetic diversity, membrane topology, and relationship to strain virulence.

“Candidatus mali”的 AAA ATP 酶和 HflB/FtsH 蛋白酶：系统发育多样性、膜拓扑结构以及与菌株毒力的关系

• DOI: 10.1094/mpmi-09-12-0221-r
• 发表时间: 2013
• 期刊: Molecular plant-microbe interactions : MPMI
• 作者: Seemüller E;Sule S;Kube M;Jelkmann W;Schneider B
• 通讯作者: Schneider B