Characterisation of epigenetic mechanisms in transcriptional regulation in hypoxia

缺氧转录调控表观遗传机制的表征

• 批准号: 179875606
• 负责人: Dr. Lina Sciesielski
• 金额: --
• 依托单位: Hypoxia Sensing Group (aufgelöst)
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Fellowships
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2009-12-31 至 2011-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/179875606?language=en
• 关键词: Characterisation; epigenetic; mechanisms; transcriptional; regulation

Die Epigenetik umfasst alle Veränderungen der Genexpression, die durch Mitose und Meiose vererbbar sind, nicht aber durch Änderungen der DNA-Sequenz erklärt werden können. Die Expressionsstärke einzelner Gene wird epigenetisch über bestimmte kovalente Chromatinmodifikationen vermittelt, die die Transkription dieser Regionen aktivieren oder inaktivieren. Sauerstoffmangel (Hypoxie) ist ein wichtiger Stimulus in Physiologie und Erkrankung. Die zellulären adaptiven Antworten auf Hypoxie werden vor allem über den Transkriptionsfaktor Hypoxie-induzierbarer Faktor (HIF) vermittelt. Die Korrelation einer Genom-weiten in silico Analyse von HIF-Chromatin-Interaktionen mit hypoxischen Expressionsprofilen zeigte, dass nur 1 % der möglichen HIF-Bindungsstellen in Promotorregionen (sog. HREs) tatsächlich von HIF benutzt wird und entsprechend funktionell relevant sind. Im vorliegenden Forschungsprojekt habe ich vor zu untersuchen, welche Faktoren die HRE-Funktionalität ausmachen, wie epigenetische Modifikationen die HIF-Antwort beeinflussen und welche funktionellen Konsequenzen diese haben. Daher wird die Cytosinmethylierung etablierter HIF-Zielgene untersucht in Krebszellen (a) nach Langzeit-Hypoxie (zur Simulation einer hypoxischen Tumormikroumgebung) und (b) in Krebszellen mit unterschiedlichen pathologischen (angiogenen etc.) Potenzialen. Ein besonderes Augenmerk wird auf die funktionelle Charakterisierung eines Zinkfingerproteins gelegt, das spezifisch mit der Erythropoietin 3’ Enhancer HRE interagiert und in die Pathogenese des Nierenzellkarzinoms involviert ist. Da dieses Protein u.U. CpG-Methyltransferase-Aktivität besitzt, könnte es sogar eine funktionelle Verbindung zur HRE-Funktionalität darstellen.

表观遗传学通过有丝分裂和有丝分裂的方式对基因表达进行验证，但不能通过DNA测序进行韦尔登。Die Expressionsstärke einzelner Gene wird epigenetisch über bestimmte kovalente Chromatinmodifikationen vermittelt，die Transkription dieser Regionen aktivieren or der inaktivieren.在生理学和医学上，缺氧是一种重要的刺激。缺氧韦尔登的适应性改变主要是由于缺氧诱导因子（HIF）的转录。Die correlation einer Genom-weiten in silico Analyse von HIF-染色质-Interaktionen mit hypoxischen Expressionsprofilen zeigte，dass努尔1% der möglichen HIF-Bindungsstellen in Promotorregionen（sog. HREs）tatsächlich von HIF benutzt wird und entsprechend funktionell relevant sind.在以前的研究项目中，我已经了解了HRE功能的影响，如表观遗传学修饰对HIF-Antwort的影响和功能的影响。在Krebszellen（a）通过Langzeit-Hypoxie（模拟一个缺氧肿瘤细胞）和（B）在Krebszellen中通过非特异性的病理学（血管生成等）观察到了胞苷甲基化对HIF-Zielgene的影响。潜力一种特异性的锌指蛋白的功能特性与促红细胞生成素3'增强子HRE的相互作用有关，并参与了Nierenzellkarzinoms的致病过程。蛋白质U. U. CpG-Methyltransferase-Aktivität besitzt，könte es sogar eine funktionelle Verbindung zur HRE-Funktionalität darstellen.