Funktionelle und strukturelle Charakterisierung von Interaktionen zwischen nicht-kodierenden RNAs und Polycomb repressive complex 2

非编码 RNA 与 Polycomb 抑制复合物 2 之间相互作用的功能和结构表征

• 批准号: 192921366
• 负责人: Dr. Verena Maier
• 金额: --
• 依托单位: Department of Molecular Biology
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Fellowships
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2009-12-31 至 2013-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/192921366?language=en
• 关键词: Funktionelle; und; strukturelle; Charakterisierung; von

Die Aktivität von Genen muss während der Embryonalentwicklung genau abgestimmt werden, um die Differenzierung in verschiedenste Zelltypen zu kontrollieren. Dabei spielt Polycomb repressive complex 2 (PRC2) eine essentielle Rolle. In embryonalen Stammzellen bindet PRC2 an die Promotoren wichtiger Entwicklungsregulatoren. Durch Trimethylierung von H3K27 - eine repressive Histonmodifikation - werden diese Gene stillgelegt, können aber im Laufe der Differenzierung aktiviert werden. Wie PRC2 seine Zielgenen findet ist nicht genau bekannt. Allerdings können einige lange, nicht-kodierende RNAs die Bindung von PRC2 an bestimmte Promotoren bewirken. RepA spielt dadurch beispielsweise eine Schlüsselrolle beim Beginn der X Chromosom Inaktivierung (XCI). Säuger inaktivieren eines der beiden weiblichen X Chromosomen, um gleiche Transkriptmengen in beiden Geschlechtern zu erreichen. Dieser Mechanismus wird durch die nicht-kodierende RNA Xist eingeleitet. RepA, ein nicht-kodierendes Transkript innerhalb Xists, rekrutiert PRC2 zum Xist Promotor. PRC2 katalysiert dann die Trimethylierung von H3K27, was in diesem Fall zur Aktivierung des Xist Gens führt. Wahrscheinlich können auch andere nicht-kodierende RNAs PRC2 zu Promotoren rekrutieren, aber die Prinzipien der zugrundeliegenden Protein-RNA Interaktionen sind wenig erforscht. Ich werde daher weitere RNAs identifizieren, die an PRC2 binden und untersuchen, ob sie PRC2 zu Promotoren leiten können und eine Rolle bei der Differenzierung oder XCI spielen. Außerdem werde ich die Interaktionsdomänen von PRC2 und RepA bestimmen. Die RNA-bindende Domäne von PRC2 wird dann dazu dienen, weitere in vitro interagierende RNA Sequenzen zu ermitteln. Zudem möchte ich herausfinden, ob RepA die katalytische Aktivität von PRC2 beeinflusst. Ich hoffe, sowohl Erkenntnisse über die Mechanismen von XCI und Differenzierung, als auch über strukturelle Voraussetzungen von Wechselwirkungen zwischen Proteinen und nicht-kodierenden RNAs zu gewinnen.

DieAktivitätvonGenen Musswährendder embryonalentwicklung genau abgestimmt werden，um die die dieldenzierung在verschiedenste zelltypen zeltypen zu kontrolllollieren中。 Dabei Spielt Polycomb抑制复合物2（PRC2）Eine Essentielle Rolle。在Embryonalen stammzellen bindet prc2中，一个模具启动子wichtiger entwicklungsnegulatoren。 Durch Trimethylierung von H3K27- Eine抑制性历史模型-Werden Diese Gene PRC2中最好的PRC2是找到最好的地方。 Allertings包括Bindung和Prc2，这是最好的方式。 Chromas和Inaktivierung（XCI）的初学者的repa刺激。 X Chromosomen，Beiden Geschlechtern Zu Erreichen的Um Gleiche Transkriptmengen。 dieser机制wird durch die nicht-kodierende rna xist eingeleitet。 repa，ein nicht-kodierendes transkript innerhalb xists，rekrutiert prc2 zum xist启动子。 Prc2 Katalysiert Dann Die Trimethylierung von H3K27，在Diesem Fall Zur Aktivierung des XistGensFührt中。 wahrscheinlichKönnenauch andere rnas prc2 und prc2 und prc2 und prc2 und prc2 und prc2 und strive and repa bestimmen。在体外，野生舞者和野生舞者和野生舞者在体外和野生舞者和prc2 beeinflusst中死亡。 Ich Hoffe，SowohlErkenntnisseüber模型von Xci von von ud dieldenzierung，我们是AuchüberstrukTurelle voraussetzungen von von von von wechselwirkungen zwischen zwischen zwischen zwischen protineinen und nicht-kodierenden rnas zu gewinenen。

项目成果

Building the Connectivity Map of epigenetics: chromatin profiling by quantitative targeted mass spectrometry.

• DOI: 10.1016/j.ymeth.2014.10.033
• 发表时间: 2015-01-15
• 期刊: METHODS
• 影响因子: 4.8
• 作者: Creech, Amanda L.;Taylor, Jordan E.;Maier, Verena K.;Wu, Xiaoyun;Feeney, Caitlin M.;Udeshi, Namrata D.;Peach, Sally E.;Boehm, Jesse S.;Lee, Jeannie T.;Carr, Steven A.;Jaffe, Jacob D.
• 通讯作者: Jaffe, Jacob D.