Analyse der Interaktionen und Charakterisierung des unkultivierten SM1 Euryarchaeons: Ökologie, Symbiosen, Genom, Metabolismus und Hami

未开垦的 SM1 广古菌的相互作用和特征分析：生态学、共生、基因组、代谢和哈密

• 批准号: 209399240
• 负责人: Professorin Dr. Christine Moissl-Eichinger
• 金额: --
• 依托单位: Universitätsklinik für Innere Medizin - Gemeinsame Einrichtung
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2010-12-31 至 2015-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/209399240?language=en
• 关键词: Analyse; der; Interaktionen; und; Charakterisierung

Das ungewöhnliche und phylogenetisch distinkte SM1 Euryarchaeon bildet im Fließwasser sulfidischer Quellen spezifische Symbiosen mit filamentösen, sulfid-oxidierenden Bakterien (string-of-pearls community), in der Tiefe der Quellen jedoch formt es, Partner-unabhängig, einen nahezu reinen Biofilm. Die weite Verbreitung, sowie das stabile Auftreten in Form von hot spots lassen eine bedeutende ökologische Signifikanz vermuten. Obwohl bislang im Labor nicht kultivierbar, ermöglicht ein in situ Probenahmesystem den direkten Zugriff auf große Biomasse und damit Einblicke in ein natürliches System. Ziel ist dieses Antrags ist es, die Interaktionen und das Archaeon selbst – auf verschiedenen Ebenen, von Ökologie bis Molekularbiologie – systematisch zu verstehen: • Analyse des Genoms in Hinblick auf Stoffwechsel, Genomstruktur und -organisation • Analyse der verschiedenen Lebensweisen und Symbiosen: Diversität der beteiligten Partner (DNA und RNA basierte Analysen mittels PhyloChip-Technologie), Biochemie (SR-FTIR, MS/MS) • Nachweis einer möglichen, gezielten Hemmung von Bakterien durch das SM1 Euryarchaeon • Aufklärung des Stoffwechsels des SM1 Euryarchaeons basierend auf Genomdaten, Substrattests (CTC, NanoSIMS) und Kultivierungsversuchen • Optimierung der rekombinanten Herstellung der besonderen Zellanhänge (Hami) des Archaeons: Nanohaken und Stacheldraht-ähnliche Strukturen für die Nanobiotechnologie

这两种不同的遗传学特征将SM 1 Euryarchaeon bildet在Fließwasser sulfidischer Quellen specizienhe Symbiosen mit sulfid-oxidierenden Bakterien（string-of-pearls community）中区分开来，以Quellen jedoch形式的Tiefe，作为一种新的生物膜。在这种情况下，以热点形式的稳定增长将被视为一种可持续的社会学意义。尽管劳动力并不多，但在自然系统中，Zugriff在大生物量和大建筑物上的原位试验是可行的。Ziel ist dieses Antrags ist es，die Interaktionen und das Dasepeon selbst - auf verbenedenen Ebenen，von Ökologie bis Molekularbiologie - systematisch zu verstehen：· Analyse des Genoms in Hinblick auf Stoffwechsel，Genomstruktur und -organisation · Analyse der verbenedenen Lebensweisen und Symbiosen：Diversität der beteiligten Partner（DNA和RNA分析仪），生物化学（SR-FTIR，MS/MS）·通过SM 1 Euryarchaeon获得了Bakterien的一个完整的、有意义的图像·基于基因组数据和底物测试，对SM 1 Euryarchaeon的Stoffwechsels进行了研究（CTC，NanoSIMS）und Kultivierungsversuchen · Optimierung der rekombinanten Herstellung der besonderen Zellanhänge（Hami）des Nanobiotechnologie：Nanohaken und Stacheldraht-ähnliche Strukturen für die Nanobiotechnologie

项目成果

Archaeelle Symbionten und Parasiten

古菌共生体和寄生虫

• DOI: 10.1007/s12268-012-0168-x
• 发表时间: 2012
• 期刊: BIOspektrum
• 作者: Moissl-Eichinger

Tackling the minority: sulfate-reducing bacteria in an archaea-dominated subsurface biofilm

• DOI: 10.1038/ismej.2012.133
• 发表时间: 2012-11
• 期刊: The ISME Journal
• 作者: Alexander J. Probst;H. Holman;T. DeSantis;G. Andersen;G. Birarda;H. Bechtel;Y. Piceno;M. Sonnleitner;K. Venkateswaran;C. Moissl-Eichinger