日本産地衣類の総合的なデータベースの整備とウェブ公開

日本産地衣類に関して，証拠標本を千葉県立中央博物館で保管しつつ，（１）ウェブ図鑑，（２）地衣成分（化学成分），（３）DNAの３つからなる総合的なデータベースを整備することを目的として本研究を実施している．4年度は徳島県剣山で野外調査を実施し新規に収集した地衣類標本約200点について画像を取得し，化学成分分析（TLC，LC/MS）を進めデータの解析を進めているところである．更に成分分析のためにアセトン及びメタノール抽出後の残渣（地衣類断片）からDNAの抽出を進め，次世代シーケンサーで の解析の準備を進めた．（１）ウェブ図鑑．徳島県剣山で地衣類標本を採集し，生態写真，撮影装置下および実体顕微鏡下での拡大写真を合わせて，ウェブ図鑑コンテンツ「日本の地衣類（ウェブ図鑑）」を制作し，公開した（で500種以上を掲載）．サブコンテンツとして，「剣山の地衣類」を公開，また市民研究員の協力を得て「上田市（長野県）の地衣類」，「長崎県の地衣類」，「屋久島の地衣類」を整備した．この図鑑を補足する分類等の論文として，９報が公表，５報は投稿中（あるいは受理）である．（２） 地衣成分（化学成分）のデータベース．ウェブコンテンツ「地衣成分」を公開し，地衣成分を紹介する様々な情報に加え，地衣成分データベースを掲載した（R4年度末には文献情報のみを掲載）．（３）DNAデータベース．標本から試料をとりわけ，LC/MS用に地衣成分を抽出後に，DNAを抽出する作業は，約400点実施した．このうち196試料について，リボソームDNA遺伝子のITS領域（ITS1とITS2）を次世代シーケンサーで解析した。各試料を識別したインデックスを付与してITS領域を増幅したのち、配列決定を試みたが、インデックス周辺の配列の品質が悪く、今後、再解析および追加の解析を行う予定である。

日本産地衣類に関して，証拠標本を千葉県立中央博物館で保管しつつ，（１）ウェブ図鑑，（２）地衣成分（化学成分），（３）DNAの３つからなる総合的なデータベースを整備することを目的として本研究を実施している．4年度は徳島県剣山で野外調査を実施し新規に収集した地衣類標本約200点について画像を取得し，化学成分分析（TLC，LC/MS）を進めデータの解析を進めているところである．更に成分分析のためにアセトン及びメタノール抽出後の残渣（地衣類断片）からDNAの抽出を進め，次世代シーケンサーで の解析の準備を進めた．（１）ウェブ図鑑．徳島県剣山で地衣類標本を採集し，生態写真，撮影装置下および実体顕微鏡下での拡大写真を合わせて，ウェブ図鑑コンテンツ「日本の地衣類（ウェブ図鑑）」を制作し，公開した（で500種以上を掲載）．サブコンテンツとして，「剣山の地衣類」を公開，また市民研究員の協力を得て「上田市（長野県）の地衣類」，「長崎県の地衣類」，「屋久島の地衣類」を整備した．この図鑑を補足する分類等の論文として，９報が公表，５報は投稿中（あるいは受理）である．（２） 地衣成分（化学成分）のデータベース．ウェブコンテンツ「地衣成分」を公開し，地衣成分を紹介する様々な情報に加え，地衣成分データベースを掲載した（R4年度末には文献情報のみを掲載）．（３）DNAデータベース．標本から試料をとりわけ，LC/MS用に地衣成分を抽出後に，DNAを抽出する作業は，約400点実施した．このうち196試料について，リボソームDNA遺伝子のITS領域（ITS1とITS2）を次世代シーケンサーで解析した。各試料を識別したインデックスを付与してITS領域を増幅したのち、配列決定を試みたが、インデックス周辺の配列の品質が悪く、今後、再解析および追加の解析を行う予定である。