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自己組織化マップを用いた未病状態の診断と改善食の提示システムの開発

开发一个系统，用于诊断症状前状况并使用自组织图提出改进的饮食

基本信息

批准号：
21K05485
负责人：
増田正人
金额：
$ 2.58万
依托单位：
Toyo University (2022)The University of Tokyo (2021)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K05485/
关键词：
血中アミノ酸プロファイル自己組織化マップ NASH/NAFLD 標準化

项目摘要

本年度では、実験機器や実験回における、アミノ酸測定データの測定誤差について検討を繰り返してきた。同一個体からの血清であっても、測定機器や測定回が異なると測定結果に差異が生じ、その差異がデータ解析において問題となる。それらを解決すべく、データの標準化方法を検討した。特定のアミノ酸で標準化するよりも、数珠繋ぎにアミノ酸同士で除算を繰り返す方が分類結果、予測結果共に向上する傾向が見られることがわかった。これは、アミノ酸の量をデータとして持つことにより、個体ごとの量の増減を大きく反映し、個体間でアミノ酸量が全体的に倍近く異なるケースなどの影響を反映できていないなどから、何かしらの割合にすることで、量よりも各アミノ酸のバランスが重要であると考えられる。ただし、タンパク質を構成するアミノ酸は20種あり、全てのパターン(20の階乗通り(=約243京通り))を検討することは不可能であるため、最適化手法を用いて最適なノーマライズ方法を検討してく必要がある。ラットの動物実験やヒト健康診断データの蓄積も順調に行われており、データ量が増えてきた。これにより、自己組織化マップの計算がボトルネックとなりつつある。アプリケーションはさまざまプラットフォームで利用できるように、Pythonを用いて開発しているが、計算の部分をC言語で記述することにより、計算の高速化が図れる。現在、Pythonコードをベースに自作したC言語ライブラリを呼び出す部分のプログラミングを行なっている。今後は、ヒト健康診断データにおけるアミノ酸データの標準化方法をまとめ、NASH患者の推定を行う。また、アプリケーションの完成を目指す。

This year, the machine will return to the market, and the acid test will determine the difference between the measurement and the return of the machine. In the same body, the serum samples were tested, and the testing machine was used to determine the results of the test. The results showed that the results of the test were different and the problems were analyzed. In this paper, the standard method is used to solve the problem. The specific system standard system, the number of beads, in addition to the results of the classification results, the results show that the results are different from each other. This is the best way to reflect the impact of the whole system on the whole, and to reflect the impact of the whole of the system. It is not possible to use the most efficient method to verify the necessary information of the 20-year-old, 20-year-old (20-year-old, 20-year-old (= about 243 Beijing pass)). The most efficient method is to use the most efficient method to verify the necessary information. Please tell me that you are in good health and that you are in good health. Please do the calculation by yourself. Please do the calculation. In other words, we need to make use of the information system, the Python system, the calculation part of the C language to record the performance, and to calculate the high-speed transmission data. At present, Python has made some mistakes on its own. I don't know what to say. I don't know what to do. In the future, patients with NASH may be presumed to be in line with the standard methods of health and health. Please tell me how to finish your goal.