Pilot study for identification of familial lung cancer susceptible genes

家族性肺癌易感基因鉴定初步研究

• 批准号: 21K07111
• 负责人: 安田 純
• 金额: $ 2.41万
• 依托单位: Miyagi Prefectural Hospital Organization Miyagi Cancer Center
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K07111/
• 关键词: 肺がん; 遺伝性腫瘍; エキソーム解析; がん素因遺伝子; 肺癌; 前向きゲノムコホート

非小細胞肺癌の発生には環境・行動因子の他、遺伝的要因も寄与するとされる。家族発症肺癌症例の全エクソーム解析(WES)を行った報告は世界的にも少ない。宮城県立がんセンター呼吸器外科において家族で肺癌を発症し手術を受けた患者23人の臨床情報と病理標本を収集した。このうち17例について生殖細胞系列と体細胞系列の両方のWESを行った。17例の体細胞系列ではEGFRとTP53遺伝子など頻出の変異が検出された。生殖細胞系列の多くの変異は標準ゲノムと同一であったが、Miller症候群の原因遺伝子であるDHODH遺伝子の非同義変異p.A347Tが同一家系内で共有されていた。今回確認できた変異は本邦の報告からも病的変異とされている。96種類のSNVのパターンの主成分分析 では各家族で体細胞SNVを誘発する独自のメカニズムが示唆された。この統計解析の設計にはchatGPTを採用 した。DHODH変異陽性のペアについて体細胞一塩基置換（SNV）を解析したところ、相同組み換え修復欠損、DNAミスマッチ修復、紫外線曝露を示す変異シグネチャーを検出した。DHODHはde novoピリミジン合成に関与している。この遺伝子の病的変異によりピリミジン合成が低下しDNA修復が阻害され肺癌の発癌に寄与する可能性が示唆された。これは変異シグナチャー解析でこの病的変異を持つ症例においてDNA修復異常と関連する変異シグナチャーが得られたことと一致 する。【結語】家族発症肺癌17症例について生殖細胞、体細胞の両系列においてWESを行いSNVのPCA解析から各家族内においては類似した発癌素因がある可能性が示唆された。また1家系の体細胞系列においてDHODHの病的変異が検出された。この遺伝子変異によりピリミジン供給が不足し遺伝子修復機構が阻害されることで肺癌発癌に影響している可能性が示唆された。

Non-small cell lung cancer is caused by environmental, behavioral factors and other factors. Family Lung Cancer Case Analysis (WES) is a global report. Clinical information and pathological data from 23 patients whose families underwent surgery for lung cancer at the Miyagi Prefectural Department of Ventilator Surgery were collected. 17 cases of germ cell series and somatic cell series 17 cases of somatic cell series were found to be different from EGFR TP53 gene. Germ cell family diversity criteria are common within the same family, Miller syndrome genetic causes, and DHODH genetic diversity. This is to confirm that the report of this country is different from that of the disease. The principal component analysis of SNV of 96 species showed that SNV of each family was induced independently. This statistical analysis is designed for chatGPT. DHODH is positive for Somatic Substitution (SNV) analysis, Somatic Substitution (SNV) repair, DNA repair, UV exposure. DHODH is the first to publish a novel. The difference in DNA synthesis between these genes has been shown to inhibit the development of lung cancer. The difference in DNA repair is the same as the difference in DNA repair. [Conclusion] 17 cases of familial lung cancer include germ cell and somatic cell series, WES and PCA analysis of SNV. The variation of DHODH disease in somatic cell series of 1 family was detected. The possibility of lung cancer development due to insufficient supply of these genes and their repair mechanisms has been demonstrated.

项目成果

家族発症肺癌の臨床および遺伝学的特徴（発がん制御研究部）

家族性肺癌的临床和遗传特征（癌变控制研究部）

HER2 遺伝子変異陽性肺癌に対して免疫組織化学染色を用いた検討

HER2基因突变阳性肺癌的免疫组织化学染色研究

• 发表时间: 2022
• 作者: 鶴見恭士;盛田麻美;鈴木綾;渡邉香奈;伊藤しげみ;伊藤信;安田純;佐藤郁郎;福原達朗
• 通讯作者: 福原達朗

肺扁平上皮癌における免疫チェックポイント阻害薬治療効果予測因子としての核異型の意義

核异型性作为鳞状细胞肺癌免疫检查点抑制剂治疗效果预测因子的意义

• 发表时间: 2021
• 作者: 齊藤 涼子;安田 純;玉井 恵一;岡村 容伸;三木 康宏;阿部 二郎;佐藤 郁郎;笹野 公伸
• 通讯作者: 笹野 公伸

PP6 deficiency in mice with KRAS mutation and Trp53 loss promotes early death by PDAC with cachexia-like features.

• DOI: 10.1111/cas.15315
• 发表时间: 2022-05
• 期刊: Cancer science
• 影响因子: 5.7

一般病院におけるLinuxコマンドを用いたゲノム配列情報へのバッチアノテーション付与のための基盤整備の経験

综合医院使用Linux命令批量注释基因组序列信息的基础设施开发经验

• 发表时间: 2022
• 作者: 安田 純;小川真紀;虻川大樹
• 通讯作者: 虻川大樹