Discrimination between primary and metastatic lung tumors by genomic profile

通过基因组谱区分原发性和转移性肺肿瘤

• 批准号: 21K08894
• 负责人: 後藤 太一郎
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Yamanashi Prefectural Hospital Organization
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K08894/
• 关键词: 肺癌; 肺転移; 遺伝子変異; 次世代シーケンサー; 進化系統樹; クローナリティ

他臓器癌(大腸癌、胃癌、乳癌、頭頚部癌、骨肉腫など)の治療歴があり、後に肺腫瘍が出現した患者で、2014年4月から2021年4月の期間に当院において肺腫瘍の摘出手術を施行した症例を対象とした。書面による同意が得られた患者を研究対象とし、本年度計42例での解析を行った。前年度に施行したNGS解析の結果を用いて、遺伝子変異のクラスター解析を行い、他臓器癌と肺腫瘍の遺伝子変異パターンを統計学的に比較検討した。42症例において、遺伝子変異パターンの一致、不一致により、原発性肺癌（7症例）または転移性肺腫瘍（35症例）と診断可能であった。また、Oligometastasisに対する手術治療（局所制御）の意義や長期予後への影響を検討するため、肺転移35症例につき、以下のphylogeny解析を追加した。正常細胞から原発巣、転移巣を生じるまでのphylogeny：原発巣と転移巣の遺伝子変異解析結果を用いて、N-J法によりクラスター解析を行い、phylogenetic解析（‘ape’ and ‘phangon R’, 3.2.3 on linux）を追加した。腫瘍の進化系統樹を作成し、正常細胞から分岐まで、分岐後各成分までの遺伝子学的距離、関連遺伝子変異を推定し、腫瘍の進化過程・病勢進行の機序を検証した。また、Trunk-ratio (正常細胞から分岐までの遺伝子学的距離/全遺伝子学的距離)や付加されるmutationのpattern・個数と術後予後との相関を検証した。以上より、clinical outcomeに影響するmutational factorsが同定された。

The treatment of other organ cancer (colorectal cancer, gastric cancer, breast cancer, head cancer, osteoma, etc.) has been performed in patients with lung cancer since April 2014 to April 2021. Written consent was obtained for the study, and 42 cases were analyzed during the year. The results of NGS analysis conducted in the previous year were analyzed statistically and compared with those of other cancer and lung cancer. 42 cases were diagnosed as primary lung cancer (7 cases) and metastatic lung cancer (35 cases). The significance of surgical treatment (local control) and long-term effects of lung metastasis were discussed. Normal cell origin, migration, generation, phytogenesis: origin, migration, and genetic analysis results were added using the N-J method, and phytogenetic analysis ('ape 'and' phangon R', 3.2.3 on linux). Phylogenetic tree construction of tumor, differentiation of normal cells, genetic distance between components after differentiation, estimation of genetic differences, evolutionary process of tumor, and identification of disease progression mechanisms Trunk-ratio (distance between normal cells and genetic differentiation/distance between complete genetic differentiation), plus mutation pattern, number and correlation after surgery Mutational factors such as the above and clinical outcomes are consistent.