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Discrimination between primary and metastatic lung tumors by genomic profile

Discrimination between primary and metastatic lung tumors by genomic profile
通过基因组谱区分原发性和转移性肺肿瘤
批准号:
21K08894
负责人:
後藤 太一郎
金额:
$2.66万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31

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他臓器癌(大腸癌、胃癌、乳癌、頭頚部癌、骨肉腫など)の治療歴があり、後に肺腫瘍が出現した患者で、2014年4月から2021年4月の期間に当院において肺腫瘍の摘出手術を施行した症例を対象とした。書面による同意が得られた患者を研究対象とし、本年度計42例での解析を行った。前年度に施行したNGS解析の結果を用いて、遺伝子変異のクラスター解析を行い、他臓器癌と肺腫瘍の遺伝子変異パターンを統計学的に比較検討した。42症例において、遺伝子変異パターンの一致、不一致により、原発性肺癌(7症例)または転移性肺腫瘍(35症例)と診断可能であった。また、Oligometastasisに対する手術治療(局所制御)の意義や長期予後への影響を検討するため、肺転移35症例につき、以下のphylogeny解析を追加した。正常細胞から原発巣、転移巣を生じるまでのphylogeny:原発巣と転移巣の遺伝子変異解析結果を用いて、N-J法によりクラスター解析を行い、phylogenetic解析(‘ape’ and ‘phangon R’, 3.2.3 on linux)を追加した。腫瘍の進化系統樹を作成し、正常細胞から分岐まで、分岐後各成分までの遺伝子学的距離、関連遺伝子変異を推定し、腫瘍の進化過程・病勢進行の機序を検証した。また、Trunk-ratio (正常細胞から分岐までの遺伝子学的距離/全遺伝子学的距離)や付加されるmutationのpattern・個数と術後予後との相関を検証した。以上より、clinical outcomeに影響するmutational factorsが同定された。
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会议论文
小型魚類を用いた次世代に対応する生命科学教育プログラムの開発
  • 批准号:
    21K02603
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额:
    $2.25万
  • 财政年份:
    2021
  • 负责人:
    後藤 太一郎
  • 依托单位:
ARDS後に生じる肺線維化におけるマトリックスメタロプロテアーゼの関与
  • 批准号:
    13770743
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 资助金额:
    $1.22万
  • 财政年份:
    2001
  • 负责人:
    後藤 太一郎
  • 依托单位:
ヤムシにおける神経構築の形成
  • 批准号:
    04740407
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
  • 资助金额:
    $0.58万
  • 财政年份:
    1992
  • 负责人:
    後藤 太一郎
  • 依托单位:
ヤムシの産卵誘発
  • 批准号:
    03740377
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
  • 资助金额:
    $0.58万
  • 财政年份:
    1991
  • 负责人:
    後藤 太一郎
  • 依托单位:
海外基金