Discrimination between primary and metastatic lung tumors by genomic profile

通过基因组谱区分原发性和转移性肺肿瘤

基本信息

批准号：
21K08894
负责人：
後藤太一郎
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Yamanashi Prefectural Hospital Organization
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

他臓器癌(大腸癌、胃癌、乳癌、頭頚部癌、骨肉腫など)の治療歴があり、後に肺腫瘍が出現した患者で、2014年4月から2021年4月の期間に当院において肺腫瘍の摘出手術を施行した症例を対象とした。書面による同意が得られた患者を研究対象とし、本年度計42例での解析を行った。前年度に施行したNGS解析の結果を用いて、遺伝子変異のクラスター解析を行い、他臓器癌と肺腫瘍の遺伝子変異パターンを統計学的に比較検討した。42症例において、遺伝子変異パターンの一致、不一致により、原発性肺癌（7症例）または転移性肺腫瘍（35症例）と診断可能であった。また、Oligometastasisに対する手術治療（局所制御）の意義や長期予後への影響を検討するため、肺転移35症例につき、以下のphylogeny解析を追加した。正常細胞から原発巣、転移巣を生じるまでのphylogeny：原発巣と転移巣の遺伝子変異解析結果を用いて、N-J法によりクラスター解析を行い、phylogenetic解析（‘ape’ and ‘phangon R’, 3.2.3 on linux）を追加した。腫瘍の進化系統樹を作成し、正常細胞から分岐まで、分岐後各成分までの遺伝子学的距離、関連遺伝子変異を推定し、腫瘍の進化過程・病勢進行の機序を検証した。また、Trunk-ratio (正常細胞から分岐までの遺伝子学的距離/全遺伝子学的距離)や付加されるmutationのpattern・個数と術後予後との相関を検証した。以上より、clinical outcomeに影響するmutational factorsが同定された。

受试者是患有治疗其他器官癌症的患者（例如结肠癌，胃癌，乳腺癌，头颈癌，骨肉瘤等），后来患有肺部肿瘤，并接受了手术以在2014年4月和2021年4月之间在我们的医院中删除肺部肿瘤。使用上一年进行的NGS分析结果，进行了基因突变的聚类分析，并在统计上比较了其他器官癌和肺部肿瘤中的遗传突变模式。在42例病例中，遗传突变模式的匹配和不一致允许诊断原发性肺癌（7例）或转移性肺肿瘤（35例）。此外，为了检查手术治疗（局部对照）对寡聚的重要性及其对长期预后的影响，为35例肺转移添加了以下系统发育分析。从正常细胞中产生原发性和转移性灶的系统发育：使用N-J方法进行聚类分析的基因突变分析的结果，并添加了系统发育分析（'ape'和'phangon'和'phangon r'，Linux上的3.2.3）。我们为肿瘤创建了一个进化的系统发育树，估计了从正常细胞到分支的遗传距离和相关的基因突变，分支后的成分以及肿瘤进化和疾病进展的机制。我们还检查了躯干比率（从正常细胞到分支的遗传距离/总遗传距离）与添加突变的模式数量和术后预后之间的相关性。从以上，已经确定了影响临床结果的突变因素。