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Risk and prediction of tick-borne diseases based on migration and dispersal of host animals

基于宿主动物迁徙和扩散的蜱传疾病的风险和预测

基本信息

批准号：
20K07471
负责人：
沢辺京子
金额：
$ 2.83万
依托单位：
National Institute of Infectious Diseases
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究は、マダニ媒介ウイルスによる極めて重篤な人獣共通の新興・再興感染症であるSFTSに注目した。自然界でのSFTSウイルスの感染環を推察し、ヒトの健康影響へのリスク評価ならびに発生予測に資することを目的としたものである。具体的には、媒介節足動物（マダニ）、その宿主動物（イノシシ、シカ、ネズミ、アライグマ等）、環境要因（森林面積、人工林面積、農地、平均気温、年降水量等）、SFTS患者、SFTSウイルス等病原体情報の4つの要素を包括的に解析し、SFTSを含むダニ媒介感染症発生のリスクマップ作製を行う。本年度初めはまだCOVID-19の収束が見られなかったため、予定した計画は遂行できなかったが、主な成果は以下のとおりである。１）以前にマダニの生息調査を行った兵庫県T市において追加調査を行い、マダニの種構成ならびに保有ウイルスの検出を行った。２）すでに登録されているSFTS患者および病原体の情報収集に努めたが、患者情報の入手が困難であった。しかし、国立感染症研究者が収集しているNESID情報の一部利用を検討し、情報収集の準備を進めている。入手出来次第SFTSの発生リスクの検討を試みる。３）マダニの一塩基多型を調べるためのハイブリダイゼーションキャプチャプローブのデザインを行った。プローブの配列として以下の点を考慮した。①単一のプローブセットで複数種の解析を行えるように塩基レベルで種間の保存性が高いこと②遺伝子の喪失が無く異なるマダニ種で安定的に存在する配列であること③ゲノム中に一コピーのみ存在し進化の過程でコピー数の変化が起きていないと考えられる配列であること。現在、アクセス可能なマダニ種のゲノムアセンブリを比較した結果、約2,000ヶ所の上記の条件に合致する座位を発見し、それらからそれぞれプローブをデザインした。R5年度はこのプローブセットの性能評価を行う予定である。

This study focuses on the development of new infectious diseases among people. Nature's SFTS infection cycle is predicted, and health effects are evaluated. The analysis of 4 factors including pathogen information such as vector arthropods (arthropods), host animals (organisms, crops, etc.), environmental factors (forest area, plantation area, cultivated land, average temperature, annual precipitation, etc.), SFTS patients, SFTS pathogens, and the development of SFTS vector infections. At the beginning of the year, COVID-19 was released, and the plan was implemented. 1) The previous investigation of interest was conducted in T City, Hyogo Prefecture. Additional investigation was conducted in T City, Hyogo Prefecture. 2) It is difficult to collect information about SFTS patients and pathogens. National infectious disease researchers are exploring the use of part of the NESID information and preparing for the collection. Start with the next generation of SFTS. 3) A polytype is required. The following points should be considered: 1. Analysis of a plurality of species in a single species; 2. Loss of a single species; 3. Existence of a single species; 4. Evolution of a single species; 5. Number of species; 6. Now, we can compare the results of this study with those of the previous study, and we can find out about 2,000 cases of this study. R5 annual performance evaluation