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Clarification of virulence factor involved in the chronicity of osteomyelitis of the jaw

颌骨骨髓炎慢性相关毒力因子的阐明

基本信息

批准号：
20K10112
负责人：
道泰之
金额：
$ 2.83万
依托单位：
Tokyo Medical and Dental University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

顎骨骨髄炎では種々の口腔細菌種が協同して病変形成に関わっている考えられている．しかし、従来の研究は培養可能な一部の細菌種のみを調べる手法に依存しているため，疾患に関与する細菌群を網羅的に解析することや、それらの細菌の活動性を評価することが困難であった。本研究では，顎骨骨髄炎細菌叢における細菌の活動性の変化を，実際の細菌活動性を反映したmRNAの発現量をメタトランスクリプトーム解析によって転写レベルの活動性として明らかにすることを目標とする。そして，病変の進展に伴い有意に発現量が増加する遺伝子を特定，その遺伝子が発現するタンパク質の病変での発現動態や宿主細胞への病原性を解析し，疾患の慢性化に寄与する新規な病原因子として同定することで，抗菌薬治療に依存しない創薬の基盤構築を目指す．しかし、メタトランスクリプトーム解析を実施するには、メタゲノム解析以上のデータ量が必要になることや、解析手法自体が複雑なこともあり、採取できる検体量が限られる本疾患でメタトランスクリプトーム解析を行うのは困難な場合がある。そこで、本研究では、まずメタ16S解析を行うことで顎骨骨髄炎の病変に存在する細菌群を網羅的に同定し、さらには16S rDNAと16S rRNAの比を計算することで、細菌群を構成する各細菌腫の活動性を評価して模擬的なメタトランスクリプトーム解析を行った。その結果、従来の研究で顎骨骨髄炎のCore microbiomeと同定された細菌腫であっても、全ての細菌腫の活動性が高いわけではないことが明らかとなった。さらに、共起ネットワーク解析では、活動性の高い細菌種だけでなく活動性の低い細菌種、マイナーな細菌腫がともにネットワークを構築することで、頑強性を保有するネットワークが形成されている可能性が示唆された。

Osteoarthritis of the jaw is caused by a combination of oral bacterial species and disease formation. In recent years, it has been difficult to evaluate the activity of bacteria in culture, depending on the method of regulation of some bacterial species, and the analysis of bacterial populations related to diseases. This study aims to investigate the changes in bacterial activity in the osteitis jawbone bacterial flora, and to analyze the changes in bacterial activity as a reflection of mRNA expression. The progression of disease is accompanied by an increase in the amount of intentional expression, the identification of genes, the development of genes, the analysis of pathogenicity of host cells, the chronicity of disease, the identification of new pathogenic factors, and the development of novel mechanisms for antimicrobial therapy. For example, if you want to analyze the above data, you can use the method of analysis to solve the problem. In this study, we determined the identity of the bacterial population involved in osteomyelitis, calculated the ratio of 16S rDNA to 16S rRNA, and analyzed the activity of each bacterial tumor. The results of this study show that the activity of the Core microbiome of osteomyelitis in the jaw is high. The high activity bacterial species and the low activity bacterial species have been analyzed and the high activity bacterial species and the low activity bacterial species have been analyzed.