Development of statistical analysis methods for visualizing nonlinear activity of large-scale neural populations
Development of statistical analysis methods for visualizing nonlinear activity of large-scale neural populations
批准号:
20K11709
负责人:
島崎 秀昭
金额:
$2.83万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-01 至 2024-03-31
中文摘要
本研究は,脳が有する外界のモデルを実験データから明らかにするための基盤的な統計解析技術として,時間変動する神経細胞集団の発火頻度と相関構造を逐次推定する技術として我々がこれまでに構築した【状態空間-イジングモデル】を発展させ,より大規模・非線形な神経細胞集団活動の解析を可能にする技術を開発することを目的としている.3年目にあたる本年度は,キネティック・イジングモデルを用いた状態空間モデルの推定精度および計算時間等の定量的検証を行った.また,キネティック・イジングモデルの古典的モデルである非対称Sherrington-Kirkpatrickモデルに対する秩序・無秩序相転移およびパターン生成等の基礎的特徴について理論的な研究を行い,厳密解を得る等の成果を得た.これらに加えて,従来型の状態空間-イジングモデルの実データへの適用も行った.特に,本年度出版された論文(Shomali, Ahmadabadi, Rasuli, Shimazaki. Communications Biology, 2023)の中で,Allen Instituteが提供する覚醒下のマウスの第一次視覚野神経細胞集団から記録した3つの神経細胞集団のスパイク時系列データに本手法を適用することで,視覚刺激等の影響で変動する発火頻度の影響を取り除いた上で,強い負の3次相関が見出せることを示した.これにより,当該論文の主張を強く補完することができた.
英文摘要
本研究は,脳が有する外界のモデルを実験データから明らかにするための基盤的な統計解析技術として,時間変動する神経細胞集団の発火頻度と相関構造を逐次推定する技術として我々がこれまでに構築した【状態空間-イジングモデル】を発展させ,より大規模・非線形な神経細胞集団活動の解析を可能にする技術を開発することを目的としている.3年目にあたる本年度は,キネティック・イジングモデルを用いた状態空間モデルの推定精度および計算時間等の定量的検証を行った.また,キネティック・イジングモデルの古典的モデルである非対称Sherrington-Kirkpatrickモデルに対する秩序・無秩序相転移およびパターン生成等の基礎的特徴について理論的な研究を行い,厳密解を得る等の成果を得た.これらに加えて,従来型の状態空間-イジングモデルの実データへの適用も行った.特に,本年度出版された論文(Shomali, Ahmadabadi, Rasuli, Shimazaki. Communications Biology, 2023)の中で,Allen Instituteが提供する覚醒下のマウスの第一次視覚野神経細胞集団から記録した3つの神経細胞集団のスパイク時系列データに本手法を適用することで,視覚刺激等の影響で変動する発火頻度の影響を取り除いた上で,強い負の3次相関が見出せることを示した.これにより,当該論文の主張を強く補完することができた.
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Sussex University(英国)
苏塞克斯大学(英国)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
IPM/University of Guilan(イラン)
IPM/桂兰大学(伊朗)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Winter Workshop on Mechanism of Brain and Mind 2023
2023年大脑与心灵机制冬季研讨会
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Ken Ishihara, Hideaki Shimazaki]
通讯作者:
Hideaki Shimazaki
DOI:
10.1016/j.celrep.2020.107790
发表时间:
2020-06-23
期刊:
CELL REPORTS
影响因子:
8.8
作者:
[Nakajo, Haruna, Chou, Ming-Yi, Okamoto, Hitoshi]
通讯作者:
Okamoto, Hitoshi
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[大嶋夏乃, 澤本拓真, 澤木大輔, 金子楓果, 荒木由布子, M. Sato-Ilic, Hideaki Shimazaki]
通讯作者:
Hideaki Shimazaki
共 18 条
神経科学への応用を目的とした高次相関を持つスパイク時系列群の作成と推定手法の開発
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批准号:08J01386
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2008
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负责人:島崎 秀昭
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依托单位:
神経科学への応用を目的としたポイントプロセスからの強度過程の統計的推定問題
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批准号:06J02651
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.22万
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财政年份:2006
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负责人:島崎 秀昭
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依托单位:
海外基金