タイにおける健常小児口腔微生物叢の構造解明とメタゲノムワイド関連解析

泰国健康儿童口腔微生物群的结构阐明和宏基因组广泛关联分析

基本信息

批准号：
20KK0210
负责人：
川端重忠
金额：
$ 11.98万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-10-27 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究計画では、タイにおける健常および重度の早期小児う蝕の小児の口腔微生物叢について解析を行い、微生物叢全体の遺伝子解析に加えて個別の菌体のゲノム配列の決定を試みる。得られたゲノム情報から、薬剤耐性遺伝子の分布、ならびに培養不能菌の代謝経路の決定を行う。さらに、早期小児う蝕と相関を示す微生物叢中の菌種または遺伝子の検出を試みるものである。タイにおいて全身状態が健常な小児集団を選出することとした。同意が得られた被験者全員から微生物叢検体として、唾液と歯面プラークを収集し、54検体を得た。重度ECCの解析については、更に検体数を追加した上で、得られた群より、口腔内状況に基づき、カリエスフリーな集団と重度ECCの集団をさらに選出し、比較を行う予定である。得られた各検体について、16S rRNAを解析対象とした細菌叢解析を行った。全体として、Streptococcus属、Prevotella属、Veillonella属、Actinomyces属などの比率が高いことが示された。一方で、興味深いことに、小児検体であるにも関わらず、Porphyromonas属やFusobacterium属も一定の割合で検出された。さらに、細菌叢中の遺伝子を同定するため、微量遺伝子の増幅を行った上でメタゲノムショットガン解析を実施した。薬剤耐性遺伝子については、遺伝子マッピングプログラムと耐性遺伝子データベースを利用して検索するパイプラインを確立した。メタゲノムショットガン解析で得られたシーケンスデータについては、今後ゲノム配列の再構築と遺伝子配列のアノテーションを行う。

在该研究项目中，我们将分析泰国健康和严重的儿童龋齿的口服微生物群，除了对整个微生物群的遗传分析外，我们还将尝试确定单个细胞的基因组序列。从获得的基因组信息中，确定了耐药性基因的分布和不可培养细菌的代谢途径。此外，他们尝试检测与幼儿龋齿相关的微生物群中的物种或基因。我们决定在泰国选择一个健康状况健康的小儿人口。收集唾液和牙齿表面斑块作为来自所有同意获得的受试者的微生物标本，并获得了54个标本。关于严重ECC的分析，我们计划添加其他样本数量，并根据所获得的组的口腔情况比较无龋齿的人群和严重的ECC人群。对于获得的每个样品，使用16S rRNA进行细菌菌群分析。总体而言，结果表明，链球菌，Prevotella，Veillonella和放线菌的比例很高。有趣的是，尽管它是小儿标本，但也以一定的速度检测到了卟啉单胞菌和镰刀菌。此外，为了鉴定细菌菌群中的基因，进行了痕量基因，并进行了宏基因组shot弹枪分析。建立了使用基因映射程序和耐药基因数据库搜索耐药性基因的管道。通过宏基因组shot弹枪分析获得的测序数据将在将来重建和基因序列。

项目成果

期刊论文数量（132）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

微生物の歴史と発展，口腔微生物学・免疫学第5版

微生物学、口腔微生物学和免疫学的历史和发展第五版

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Yamaguchi M;Takemura M;Higashi K;Goto K;Hirose Y;Sumitomo T;Nakata M;Uzawa N;Kawabata S.;川端重忠，大原直也，小松澤均，寺尾豊;川端重忠.
通讯作者：
川端重忠.

大阪大学大学院歯学研究科微生物学講座

大阪大学大学院牙科医学研究科微生物学系

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

微生物，イラストでわかる歯科医学の基礎第4版

微生物，带插图的牙科基础知识，第四版

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Takahara Y;Sumitomo T;Kono M;Yamaguchi M;Nakata M;Hotomi M;Kawabata S.;大野誠之，山口雅也，広瀬雄二郎，東孝太郎，竹本訓彦，秋山徹，住友倫子，池辺忠義，川端重忠．;東孝太郎，山口雅也，中田匡宣，武部克希，住友倫子，鈴木守，川端重忠．;山口雅也，Hpoo Pwint Myo Win，大野誠之，東孝太郎，広瀬雄二郎，Mya Mya Aye，Moh Moh Htun，Hlaing Myat Thu，川端重忠．;高原悠樹，住友倫子，河野正充，山口雅也，中田匡宣，保富宗城，川端重忠．;山口雅也，川端重忠.
通讯作者：
山口雅也，川端重忠.

インフルエンザに合併する細菌性肺炎の重要性

流感并发细菌性肺炎的重要性

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
歯界月報
影响因子：
0
作者：
Nguyen Truong Duc Hoang;末廣智也、峯裕一、藤井万紀子;住友倫子，川端重忠.
通讯作者：
住友倫子，川端重忠.

老化により肺炎球菌感染症が重症化する機構のマウスモデルを用いた探索.

使用小鼠模型探索肺炎球菌感染随着衰老而变得更加严重的机制。

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Okamoto M;Ali M;Komichi S;Watanabe M;Huang H;Ito Yuki;Miura J;Hirose Y;Mizuhira M;Takahashi Y;Okuzaki D;Kawabata S;Imazato S;Hayashi M.;後藤花奈，山口雅也，川端重忠．;住友倫子，川端重忠．;高原悠樹，住友倫子，河野正充，山口雅也，中田匡宣，保富宗城，川端重忠．;山口雅也，川西邦夫，小林桃子，元岡大祐，奥崎大介，川端重忠．
通讯作者：
山口雅也，川西邦夫，小林桃子，元岡大祐，奥崎大介，川端重忠．