オルガネラ代謝物の化学標識による時空間メタボローム解析
オルガネラ代謝物の化学標識による時空間メタボローム解析
批准号:
21H02058
负责人:
田村 朋則
金额:
$11.23万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2021-04-01 至 2025-03-31
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英文摘要
2021年度はミトコンドリア内代謝物を標的としたOrganelle-targeting Reactive Molecule (ORM)の開発を行った。ミトコンドリアはTCA回路、酸化的リン酸化、脂肪酸ベータ酸化など、様々な代謝を担うオルガネラであり、本手法の有用性を検証する上で適したオルガネラであると言える。ORMのミトコンドリア局在モチーフとして膜電位依存的にミトコンドリアに局在することが知られるローダミン誘導体を採用し、様々な官能基(アミン、カルボン酸、アルデヒド、ケトン、チオールなど)を有する代謝物の化学標識を実現するために、多様な反応基を連結したORM試薬を合成した。本年度は特に光反応基の検討を進め、フェニルアジド、ベンゾフェノン、ジアジリンといった光反応基を有するローダミン誘導体を合成した。合成したORMを培養細胞に処置し、ライブイメージングやLC-MS解析によって、オルガネラターゲッティング能、反応効率、反応選択性等を評価した。初期検討の結果、ORMはミトコンドリアに特異的に局在し、光照射によっていくつかの代謝物に対する標識が進行することが確認された。特に脂肪酸類が同定されたことから、ミトコンドリア内代謝物の選択的な標識が進行していることが示唆された。また、本年度はオルガネラ内のホスファチジルコリンを選択的に標識する技術を応用してホスファチジルコリンの代謝を制御する遺伝子の網羅的スクリーニングを行った。
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Development of novel proteomics methods based on biocompatible organic chemistry
基于生物相容性有机化学的新型蛋白质组学方法的开发
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kohei Morimoto, Daichi Kitagawa, Seiya Kobatake, 吉田真明, 田村朋則]
通讯作者:
田村朋則
タンパク質/脂質の in situ 化学修飾
蛋白质/脂质的原位化学修饰
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yui TSUNEKAWA, Shin-ichi YUSA, 田村朋則]
通讯作者:
田村朋則
オルガネラ膜特異的なホスファチジルコリンのライブイメージング
细胞器膜特异性磷脂酰胆碱的实时成像
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
実験医学
影响因子:
--
作者:
[田村朋則, 浜地格]
通讯作者:
浜地格
オルガネラ選択的脂質ラベリングの新展開(3):ホスファチジルイノシトールへの拡張
细胞器选择性脂质标记的新进展(3):扩展到磷脂酰肌醇
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[木村 天海, 田村 朋則, 浜地 格]
通讯作者:
浜地 格
オルガネラ代謝物の化学標識による時空間メタボローム解析
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批准号:23K21151
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$2.16万
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财政年份:2024
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负责人:田村 朋則
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依托单位:
黄色ブドウ球菌由来鉄獲得蛋白質Isdの蛍光バイオセンサー化と阻害剤探索法の構築
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批准号:13J07399
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.91万
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财政年份:2013
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负责人:田村 朋則
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依托单位:
LDT化学による新しい細胞内蛋白質間相互作用解析技術の開発
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批准号:10J04905
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2010
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负责人:田村 朋則
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依托单位:
海外基金