ホヤ初期胚の細胞運命決定機構

早期海鞘胚胎的细胞命运决定机制

• 批准号: 21H02486
• 负责人: 佐藤 ゆたか
• 金额: $ 11.07万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H02486/
• 关键词: ホヤ; 遺伝子調節ネットワーク; Zic; Foxd; 初期発生

多細胞生物の発生においてつくりだされる多様な遺伝子発現パターンは遺伝子調節ネットワークの働きによるものである。ネットワーク構造の理解は進んだが、その動態の理解は進んでいない。私のグループではゲノムと胚の構造が単純なホヤを用いて遺伝子調節ネットワークの動態を細胞の単位で解析し、３２細胞期までの胚全体のネットワーク動態を計算機上で再現することに成功している。その再現においては経験則的な仮定をおいているので、そうした仮定の実証を進める。具体的には次の三つの課題に取り組む。（１）明確な結合配列がその標的の調節領域にない転写因子について、一部は複数のモチーフを認識する可能性の検証。（２）受精後一定時間たってから胚性ゲノムからの転写が始まるというZygotic genome activationの分子機構の理解。（３）遺伝子調節ネットワーク動態が不連続に進行する背景にある分子機構。（１）について、Zic-r.a転写因子が二つのモチーフを認識し、それぞれが別の組織特異的発現を担っていることを明らかにし、論文として公表した。また、Foxd転写因子がわずかに異なる配列を認識することで、標的を活性化したり抑制したりという機能の切り替えをおこなっていることを明らかにした。（２）について、いくつかの母性転写因子についてノックダウン実験をおこない、初期の遺伝子発現に対してグローバルな影響が認められることを確認した。（３）について、Foxdタンパク質に対する抗体を作成し、Foxdタンパク質の胚内での動態を詳しく観察した。

The development of multicellular organisms is characterized by the presence of multiple genes, which are regulated by genes. The understanding of structure and dynamics is progressive. The structure of the embryo is pure, and the dynamics of the embryo are successfully reproduced on the computer at the cell stage and 32 cell stage. In addition to the above, it is also necessary to improve the quality of the products. The specific three topics are selected and grouped. (1) Identification of the possibility of recognizing multiple factors in the regulatory domain of the combination of the subject and the subject. (2) The molecular mechanism of Zygotic genome activation is understood after fertilization. (3) The molecular mechanism of gene regulation is related to the background of gene regulation. (1) Zic-r.a factor is a factor of two kinds of knowledge, and the occurrence of different tissue-specific phenomena is a factor of two kinds of knowledge, and the occurrence of different tissue-specific phenomena is a factor of two kinds of knowledge. For example, if you want to change the name of the target, you can change the name of the target. (2) The mother's writing factor is confirmed by the early stage of the transmission and the early stage of the transmission. (3) To create antibodies against FoxD and observe the dynamics of FoxD in detail.

项目成果

Two distinct motifs for Zic-r.a drive specific gene expression in two cell lineages

Zic-r.a 的两个不同基序驱动两个细胞谱系中的特定基因表达

• 发表时间: 2023
• 作者: Izumi Oda-Ishii;Deli Yu and Yutaka Satou
• 通讯作者: Deli Yu and Yutaka Satou

Tbx15/18/22 shares a binding site with Tbx6-r.b to maintain expression of a muscle structural gene in ascidian late embryos

Tbx15/18/22 与 Tbx6-r.b 共享一个结合位点，以维持海鞘晚期胚胎中肌肉结构基因的表达

• DOI: 10.1016/j.ydbio.2021.12.012
• 发表时间: 2022
• 期刊: Developmental Biology
• 影响因子: 2.7
• 作者: Yu Deli;Iwamura Yuri;Satou Yutaka;Oda-Ishii Izumi
• 通讯作者: Oda-Ishii Izumi

A Manually Curated Gene Model Set for an Ascidian, Ciona robusta (Ciona intestinalis Type A)

海鞘、海鞘 (Ciona Enteris A 型) 的手动基因模型集

• DOI: 10.2108/zs210102
• 发表时间: 2022
• 期刊: Zoological Science
• 影响因子: 0.9
• 作者: Satou Yutaka;Tokuoka Miki;Oda-Ishii Izumi;Tokuhiro Sinichi;Ishida Tasuku;Liu Boqi;Iwamura Yuri
• 通讯作者: Iwamura Yuri