ホヤ初期胚の細胞運命決定機構
ホヤ初期胚の細胞運命決定機構
批准号:
21H02486
负责人:
佐藤 ゆたか
金额:
$11.07万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
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英文摘要
多細胞生物の発生においてつくりだされる多様な遺伝子発現パターンは遺伝子調節ネットワークの働きによるものである。ネットワーク構造の理解は進んだが、その動態の理解は進んでいない。私のグループではゲノムと胚の構造が単純なホヤを用いて遺伝子調節ネットワークの動態を細胞の単位で解析し、32細胞期までの胚全体のネットワーク動態を計算機上で再現することに成功している。その再現においては経験則的な仮定をおいているので、そうした仮定の実証を進める。具体的には次の三つの課題に取り組む。(1)明確な結合配列がその標的の調節領域にない転写因子について、一部は複数のモチーフを認識する可能性の検証。(2)受精後一定時間たってから胚性ゲノムからの転写が始まるというZygotic genome activationの分子機構の理解。(3)遺伝子調節ネットワーク動態が不連続に進行する背景にある分子機構。(1)について、Zic-r.a転写因子が二つのモチーフを認識し、それぞれが別の組織特異的発現を担っていることを明らかにし、論文として公表した。また、Foxd転写因子がわずかに異なる配列を認識することで、標的を活性化したり抑制したりという機能の切り替えをおこなっていることを明らかにした。(2)について、いくつかの母性転写因子についてノックダウン実験をおこない、初期の遺伝子発現に対してグローバルな影響が認められることを確認した。(3)について、Foxdタンパク質に対する抗体を作成し、Foxdタンパク質の胚内での動態を詳しく観察した。
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科研奖励(0)
会议论文
Two distinct motifs for Zic-r.a drive specific gene expression in two cell lineages
Zic-r.a 的两个不同基序驱动两个细胞谱系中的特定基因表达
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Izumi Oda-Ishii, Deli Yu and Yutaka Satou]
通讯作者:
Deli Yu and Yutaka Satou
Tbx15/18/22 shares a binding site with Tbx6-r.b to maintain expression of a muscle structural gene in ascidian late embryos
Tbx15/18/22 与 Tbx6-r.b 共享一个结合位点,以维持海鞘晚期胚胎中肌肉结构基因的表达
DOI:
10.1016/j.ydbio.2021.12.012
发表时间:
2022
期刊:
Developmental Biology
影响因子:
2.7
作者:
[Yu Deli, Iwamura Yuri, Satou Yutaka, Oda-Ishii Izumi]
通讯作者:
Oda-Ishii Izumi
A Manually Curated Gene Model Set for an Ascidian, Ciona robusta (Ciona intestinalis Type A)
海鞘、海鞘 (Ciona Enteris A 型) 的手动基因模型集
DOI:
10.2108/zs210102
发表时间:
2022
期刊:
Zoological Science
影响因子:
0.9
作者:
[Satou Yutaka, Tokuoka Miki, Oda-Ishii Izumi, Tokuhiro Sinichi, Ishida Tasuku, Liu Boqi, Iwamura Yuri]
通讯作者:
Iwamura Yuri
ホヤ胚の運命決定機構の解明
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批准号:24K02032
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.9万
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财政年份:2024
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负责人:佐藤 ゆたか
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依托单位:
ホヤ胚発生を支配する転写制御ネットワーク
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批准号:20687014
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
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资助金额:$17.06万
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财政年份:2008
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负责人:佐藤 ゆたか
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依托单位:
ホヤ胚発生の包括的理解のための遺伝子発現アトラスの作製にむけた試み
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批准号:20657042
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.11万
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财政年份:2008
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负责人:佐藤 ゆたか
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依托单位:
ホヤ初期胚発生におけるゲノムワイドな転写因子ネットワークの解析
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批准号:17687022
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
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资助金额:$19.39万
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财政年份:2005
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负责人:佐藤 ゆたか
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依托单位:
ホヤゲノムにおける5'スプライスリーダー配列をもつmRNAの網羅的解析
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批准号:17017020
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.2万
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财政年份:2005
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负责人:佐藤 ゆたか
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依托单位:
ホヤ胚の内胚葉分化と中胚葉誘導における分子機構の解明
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批准号:14704070
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
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资助金额:$16.81万
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财政年份:2002
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负责人:佐藤 ゆたか
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依托单位:
ホヤ胚の筋肉細胞分化決定機構の解析
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批准号:12780554
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.73万
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财政年份:2000
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负责人:佐藤 ゆたか
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依托单位:
ホヤ胚の筋肉および内胚葉細胞分化における内在的決定機構の解析
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批准号:99J03806
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1999
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负责人:佐藤 ゆたか
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依托单位:
ホヤ胚の筋肉細胞分化における筋肉アクチン遺伝子の特異的発現調節機構の解析
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批准号:96J06806
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1998
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负责人:佐藤 ゆたか
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依托单位:
海外基金