ホヤ胚発生を支配する転写制御ネットワーク

调控海鞘胚胎发育的转录调控网络

• 批准号: 20687014
• 负责人: 佐藤 ゆたか
• 金额: $ 17.06万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20687014/
• 关键词: ホヤ; 遺伝子調節ネットワーク

ホヤはコンパクトなゲノムを持ち、胚の構造も単純であるため、ゲノムワイドかつ細胞単位のネットワークの研究が比較的行いやすい。また、ホヤはオタマジャクシ型の幼生をつくるなど、脊索動物に共通の基本的な体制を持っており、ホヤの発生の理解は脊索動物の起源の理解に直接つながる期待がある。昨年度に得た転写因子10個についてクロマチン免疫沈降法によるin vivoでの転写因子の結合プロファイルを解析した。これまでの遺伝子機能解析からは予測されない多くの結合が見つかった。そのうちの一部の結合は実際に機能的であることを実験的に確認した。また、これらの結合が過去の遺伝子機能解析から見いだすことができなかった理由のひとつは、その結合による遺伝子調節がきわめて少数の細胞においてのみ起こるためであった。たとえば、Twist-like1遺伝子は3つの系譜の間充織細胞で発現するが、このうちのひとつの系統でのみ転写調節因子ZicLが結合し、その転写を調節する。また、昨年度に引き続き、母性因子による胚性の調節遺伝子制御についても実験をすすめた。母性因子が胚性の遺伝子発現を制御する転写調節のロジックを明らかにするため、母性因子の網羅的ノックダウンと胚性遺伝子のシス制御の解析を同時に進めている。さらに研究を進め、遺伝子ネットワークを総合的に明らかにし、進化のメカニズムを考察していく予定であったが、本研究は別の科学研究費補助金の採用を受け、1ヶ月あまりの研究の後に廃止し、本研究で得られたデータを引き継いだ。

The study of cell structure, cell structure and cell structure is of great importance. The development of chordates and the understanding of their origins are expected to be directly related to the development of basic systems common to chordates. The analysis of 10 factors in vivo by immunoprecipitation The function analysis of this gene is to predict the combination of many genes. A part of the combination of real time function is confirmed. The function analysis of the gene in the past shows that the gene regulation of the gene in a few cells can be achieved by analyzing the reasons for the gene combination. Twist-like1 gene expression in mesenchymal cells of the 3-fold lineage is regulated by ZicL, a regulatory factor in the system. In the past, maternal factors have been introduced into the regulation of embryonic genes. The maternal factor is responsible for controlling the development of embryonic genes, and the analysis of the maternal factor's network and embryonic gene's regulation is also carried out. The research progress, genetic development, integration, development and management of the system are discussed in detail. The research is based on the application of scientific research grants. The research is conducted in January.

项目成果

Gene regulatory networks underlying the compartmentalization of the Ciona central nervous system

• DOI: 10.1242/dev.026419
• 发表时间: 2009-01-15
• 期刊: DEVELOPMENT
• 影响因子: 4.6
• 作者: Imai, Kaoru S.;Stolfi, Alberto;Satou, Yutaka
• 通讯作者: Satou, Yutaka

Gene regulatory networks in the early ascidian embryo

早期海鞘胚胎中的基因调控网络

• 发表时间: 2009
• 期刊: Biochimica et Biophysica Acta (掲載決定)
• 作者: Yutaka Satou;Nori Satoh;Kaoru S. Imai
• 通讯作者: Kaoru S. Imai

Gene Regulatory Networks for the ascidian larval development

海鞘幼虫发育的基因调控网络

• 发表时间: 2008
• 作者: Shimada;A.;Takano;K.;Shirouzu;M.;Hanawa-Suetsugu;K.;Terada;T.;Toyooka;K.;Umehara;T.;Yamamoto;M.;Yokoyama;S.;Suetsugu;S.;Takahide Kon;Yutaka Satou
• 通讯作者: Yutaka Satou

Improved genome assembly and evidence-based global gene model set for the chordate Ciona intestinalis : new insight into intron and operon poputations

改进的脊索动物基因组组装和基于证据的全局基因模型集：对内含子和操纵子群体的新见解

• 发表时间: 2008
• 期刊: Genome Biology 9
• 作者: Yutaka Satou;Katsuhiko Mineta;Michio Ogasawara;et.al.
• 通讯作者: et.al.