ホヤ胚発生の包括的理解のための遺伝子発現アトラスの作製にむけた試み

尝试创建基因表达图谱以全面了解海鞘胚胎发育

• 批准号: 20657042
• 负责人: 佐藤 ゆたか
• 金额: $ 2.11万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20657042/
• 关键词: ホヤ; マイクロアレイ; 発現プロファイル

動物の発生は細胞を基本単位として進行する。また、発生においてはゲノムを単位として遺伝子の発現が時間的・空間的に調節されている。したがって、時空間的に制御された遺伝子発現の様子を細胞の単位でかつゲノムワイドに知ることは発生の全体像を知る上で欠かせない知識である。本研究で用いるホヤ胚は細胞数が少なく、細胞単位の解析が可能な実験系である。また、脊索動物としてはゲノムサイズが小さく、コードされている遺伝子数も少ない。つまり、ホヤ胚を用いることで細胞単位かつゲノムワイドな解析を比較的容易に行うことができる。ホヤ胚発生における細胞単位の発現プロファイルの解析のため、本年度はまず、受精卵からmRNAを抽出し、それを用いてマイクロアレイによる発現解析をおこなった。次に8細胞期胚について、割球をガラス針で単離した。ホヤの8細胞期胚は左右対称であるので、4種類のサンプルが得られた。得られたサンプルのそれぞれからmRNAを抽出し、受精卵と同様にマイクロアレイによる発現解析を行った。マイクロアレイの結果同士の発生学的研究への利用には細胞の大きさなどのパラメータによる補正が必要となる。そこで、いくつかの補正を試みた後、in situハイブリダイゼーション解析によって、実際の遺伝子発現パターンを個々に調べることで、マイクロアレイの結果を考察した。その結果として、いくつかの補正を行うことで、マイクロアレイの実験間での比較が正確に行えるようになりつつある。

The basic position of the animal's growth and development is as follows: In the process of development, the development of the gene is regulated by time and space. The time and space of the system control, the generation of the child, the cell of the individual, the knowledge of the whole image of the generation, the lack of knowledge. In this study, the number of cells in embryos was reduced, and the analysis of cell units was possible. The number of birds in the chordates is very small. It is easy to analyze the cell unit and compare the cell unit with the cell unit This year, the analysis of the expression of mRNA in cell units during embryo development was carried out. The next 8-cell embryo stage, cut the ball, cut the needle. 8-cell embryo stage, 4-cell embryo stage The expression of mRNA was detected by PCR. It is necessary to make corrections in the study of biology of the same species. After the correction, in situ analysis, the results of the actual detection were investigated. The result is correct, the correction is correct, and the comparison is correct.