权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

ホヤ初期胚発生におけるゲノムワイドな転写因子ネットワークの解析

早期海鞘胚胎发育过程中全基因组转录因子网络的分析

基本信息

批准号：
17687022
负责人：
佐藤ゆたか
金额：
$ 19.39万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2007
项目状态：
已结题

项目摘要

ホヤ(Ciona intestinalis)の胚発生を支配する転写制御のネットワークをゲノムワイドにかつ、システムレベルで明らかにするため、主に以下の2つの実験に絞って解析を行った。1.クロマチン免疫沈降法を用いて、ZicL、Twist-like1、MyoD、Brachyury、Lhx3などの転写因子が、胚発生において結合するゲノム領域を抽出し、ゲノムタイリングアレイを用いて、その結合領域をゲノムワイドに同定した。その結果として、ホヤの胚発生における遺伝子ネットワークには予想よりも遙かに多くのフィードフォワードループが存在することを見いだした。この情報を昨年度までに明らかにした遺伝子機能阻害実験を元にして組み立てた遺伝子ネットワークに情報を取り入れ、ネットワーク構造の理解を精緻化を行った。2.神経系は他の組織よりもはるかに複雑な構造を持ち、昨年までの解析では必ずしもその発生を制御する遺伝子ネットワークは明らかになっていなかった。ホヤの遺伝子ネットワークの解析はこれまで細胞単位で解析され、そこに大きな特長がある。そこで、神経系での遺伝子ネットワークの解析のため、複雑な構造を持つ神経系について、細胞の単位で解析する系を確立した。つづいて、神経系で発現する制御遺伝子をゲノムワイドに網羅的に同定した。そのうち25種類の遺伝子機能をモルフォリノオリゴヌクレオチドで阻害し、そのほかの神経系で発現する遺伝子の発現に与える影響を調べ、情報を統合して遺伝子ネットワークを再構築した。

The development of Ciona intestinalis is governed by the following two principles: 1. The use of CRI, ZicL, Twist-like1, MyoD, Brachyury, Lhx3, and other factors in the development of embryos, the extraction of binding domains, the use of CRI, and the determination of binding domains. As a result, we can see that there are many mobile phones in the world where mobile phones are born. This information is now available in the form of information, information, information. 2. The structure of the brain system is complex, and the analysis of the brain system is necessary to control the development of the brain. The analysis of the gene expression is based on the analysis of the cell position. In addition, the analysis of the gene sequence of the nervous system and the analysis of the cell sequence of the complex structure are established. In the middle of the game, the brain system appears to control the transmission of information, and the network is determined. The function of 25 kinds of gene is to adjust the influence of gene development and gene development, to integrate information and to reconstruct gene development.