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Elucidation of glioma immune microenvironment heterogeneity based on immunogenomics by liquid biopsy

基于液体活检免疫基因组学阐明胶质瘤免疫微环境异质性

基本信息

批准号：
21H03044
负责人：
溝口昌弘
金额：
$ 11.23万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

グリオーマ遺伝子解析：2021年WHO分類に対応した分子診断を44症例に継続した。新たにFGFR1に対しシークエンス、HRM法、MLPA法による遺伝子異常の検出が可能となった。髄液cell-free(cf) DNAを用いたMLPA法によるコピー数解析：術前に採取した髄液を用いてコピー数変化をMLPA法で解析した。髄液cfDNA濃度(中央値0.213 ng/uL)はMLPA法の推奨濃度を著しく下回ったが、条件を探索し濃度0.15ng/uL以上かつ100 bp以上のDNA長で反応することを確認した。条件を満たす症例では全例MLPAの反応は成功し、EGFR増幅、Ch 7+/10-、PDGFRA、CDK4増幅、CDKN2A欠失は明確に同定され、感度はそれぞれ75%，88.9%，100%，100%，75%であり特異度は100%であった。ヒト血液由来誘導ミクログリア様(iMG)細胞による評価：免疫微小環境のバイオマーカーとして有用であるiMG細胞における貪食能について検討した。グリオーマ25例、てんかん4例、髄膜種1例、GIST1例、そのうち11例に対し脳内ミクログリア（PMG）の貪食能も同時に解析した。同一患者でのPMG、iMGとの間には正の相関関係がみられ、機能面においてもiMGがPMGを反映している所見であった。また星細胞腫や膠芽腫は乏突起膠腫と比較して有意に貪食能が高かった。CDKN2A/Bヘミ欠失の評価：IDH変異型グリオーマでCDKN2A/Bのホモ欠失は強力な予後不良因子であるが、ヘミ欠失の効果は不明である。コピー数解析によりホモ欠失、ヘミ欠失、正常の3群に分類しOS/PFSを評価するとastrocytoma ではヘミ欠失は正常と比較して有意なOSの短縮をみとめた。さらにp16とMTAPに対する免疫染色でヘミ欠失を診断可能であることを見出した。

WHO classification of molecular diagnosis in 2021 FGFR1, HRM and MLPA are new methods for detecting genetic anomalies. Cell-free(cf) DNA analysis using MLPA: Preoperative cell-free DNA analysis using MLPA The concentration of cfDNA in the solution (central value 0.213 ng/uL) was determined by MLPA method. The next step was to explore the conditions. The concentration was above 0.15 ng/uL and the DNA length was above 100 bp. All cases of MLPA were successfully detected, EGFR increased, Ch7 +/10-, PDGFRA increased, CDKN2A was not clearly identified, sensitivity was 75%, 88.9%, 100%, 75% and specificity was 100%. Blood Origin Induced Gluttony (iMG) Cell Detection: Immune Microenvironment and Gluttony Detection in Useful iMG Cells. 25 cases of PMG, 4 cases of PMG, 1 case of GIST and 11 cases of PMG were analyzed simultaneously. The relationship between PMG and iMG in the same patient is positive, and the relationship between PMG and iMG in the same patient is positive. The star cell swelling, the gum swelling, the lack of bumps, and the high level of intentional gluttony CDKN2A/B is missing and the result is unknown. The number of missing, missing, normal and 3 groups of OS are evaluated. p16 and MTAP were not detected.

项目成果

期刊论文数量（21）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

がんゲノム時代の新たなグリオーマ治療戦略

癌症基因组时代的胶质瘤治疗新策略

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Saito Shoji;Natsumeda Manabu;Sainouchi Makoto;Takino Toru;Shibuya Kohei;On Jotaro;Kanemaru Yu;Ogura Ryosuke;Okada Masayasu;Oishi Makoto;Shimada Yoshifumi;Wakai Toshifumi;Okuda Shujiro;Ajioka Yoichi;Kakita Akiyoshi;Fujii Yukihiko;溝口昌弘
通讯作者：
溝口昌弘

当院のMicrosatellite instabilityを有するGBMにおける遺伝的および免疫学的プロファイルの検討

我院微卫星不稳定性GBM的遗传和免疫学特征检查