Discovery of innovative seeds for diagnosis and treatment in bone and soft-tissue sarcomas by proteogenomic approach

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肉腫の発生や進展の分子背景を解明し、バイオマーカーや治療標的の候補となる分子異常を同定するために、臨床検体と患者由来肉腫細胞株を用いた網羅的発現解析を行った。対象としたのは悪性抹消神経鞘腫（MPNST）である。MPNSTは抹消神経から発生する肉腫で神経線維腫症1型に合併することで知られており、NF-1、CDKN-2A、PRC2遺伝子の相互作用で発生する。完全摘出のみが根治療法であり、放射線・化学療法に対して抵抗性を示すため、新しい抗がん剤の開発が求められている。凍結保存された腫瘍組織からタンパク質を抽出し、質量分析を用いた解析によってタンパク質の発現プロファイルを得た。そして、手術後の再発の状態をもとに症例・試料を層別化して関連するタンパク質の発現を調べた。また、MPNST細胞株において同様に質量分析を実施し、また、リン酸化酵素の活性を網羅的に調べた（PamStation）。平行して抗がん剤２００種類を反応させて応答を調べた。さらに、ゲノムレベルの解析としてNCC Oncopanelを用いて、治療応答性に関わりうる遺伝子の異常も調べた。タンパク質の発現プロファイルから予後不良に関わる分子パスウェイそして治療標的となりうる高発現する候補タンパク質を同定した。また、抗がん剤のスクリーニングから低濃度で抗腫瘍効果を示す既存の抗がん剤を同定した。また、NCC Oncopanelからは治療標的になりうる分子異常を同定した。上記の結果を統合的に解析することで、治療標的とバイオマーカーの候補を同定する。