Discovery of innovative seeds for diagnosis and treatment in bone and soft-tissue sarcomas by proteogenomic approach

通过蛋白质组学方法发现用于骨和软组织肉瘤诊断和治疗的创新种子

• 批准号: 21H03062
• 负责人: 川井 章
• 金额: $ 11.07万
• 依托单位: National Cancer Center Japan
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H03062/
• 关键词: 肉腫; プロテオゲノミクス; ゲノム; プロテオーム; プロテオームデータベース

肉腫の発生や進展の分子背景を解明し、バイオマーカーや治療標的の候補となる分子異常を同定するために、臨床検体と患者由来肉腫細胞株を用いた網羅的発現解析を行った。対象としたのは悪性抹消神経鞘腫（MPNST）である。MPNSTは抹消神経から発生する肉腫で神経線維腫症1型に合併することで知られており、NF-1、CDKN-2A、PRC2遺伝子の相互作用で発生する。完全摘出のみが根治療法であり、放射線・化学療法に対して抵抗性を示すため、新しい抗がん剤の開発が求められている。凍結保存された腫瘍組織からタンパク質を抽出し、質量分析を用いた解析によってタンパク質の発現プロファイルを得た。そして、手術後の再発の状態をもとに症例・試料を層別化して関連するタンパク質の発現を調べた。また、MPNST細胞株において同様に質量分析を実施し、また、リン酸化酵素の活性を網羅的に調べた（PamStation）。平行して抗がん剤２００種類を反応させて応答を調べた。さらに、ゲノムレベルの解析としてNCC Oncopanelを用いて、治療応答性に関わりうる遺伝子の異常も調べた。タンパク質の発現プロファイルから予後不良に関わる分子パスウェイそして治療標的となりうる高発現する候補タンパク質を同定した。また、抗がん剤のスクリーニングから低濃度で抗腫瘍効果を示す既存の抗がん剤を同定した。また、NCC Oncopanelからは治療標的になりうる分子異常を同定した。上記の結果を統合的に解析することで、治療標的とバイオマーカーの候補を同定する。

Meat is swollen の 発 raw や progress の molecular background を interpret し, バ イ オ マ ー カ ー や therapeutic target の alternate と な る molecular abnormalities を with fixed す る た め に と patients, clinical 検 body origin meat swollen cell lines を with い た snare 発 line analytical を っ now た. For と, た, と, 悪, 悪, sexual erasment of shingles (MPNST) である. MPNST は effacement god 経 か ら 発 raw す る meat で god 経 line d swollen swollen disease type 1 に merger す る こ と で know ら れ て お り, NF - 1, CDKN - 2 a, traces of PRC2 伝 son の interaction で 発 raw す る. Completely pick out の み が curatie treatment で あ り, radiation, chemical treatment に し seaborne て resistance を shown す た め, new し い resistance が ん tonic の open 発 が o め ら れ て い る. Freezing preservation さ れ た swollen sores organization か ら タ ン パ ク qualitative を out し, quality analysis を い た parsing に よ っ て タ ン パ ク qualitative の 発 now プ ロ フ ァ イ ル を た. そ し て, の 発 again after the operation state of の を も と に cases, sample を layer don't change し て masato even す る タ ン パ ク qualitative の 発 now を adjustable べ た. ま た, MPNST cell lines に お い て with others に quality analysis を be し, ま た, リ ン の acidification enzyme activity を snare に adjustable べ た (PamStation). Parallel て antiが ん 200 kinds を anti応 させて応 answer を tuning べた. さ ら に, ゲ ノ ム レ ベ ル の parsing と し て NCC Oncopanel を with い て, treatment 応 a sexual に masato わ り う る posthumous son 伝 の abnormal も adjustable べ た. タ ン パ ク qualitative の 発 now プ ロ フ ァ イ ル か ら to bad after に masato わ る molecular パ ス ウ ェ イ そ し て therapeutic target と な り う る high 発 now す る alternate タ ン パ ク qualitative を be し た. ま た, resisting が ん tonic の ス ク リ ー ニ ン グ か ら resistance low concentration で swollen sores unseen fruit を す in existing の resistance が ん tonic を with fixed し た. Youdaoplaceholder0, NCC Oncopanel ら ら the therapeutic target にな にな うる molecular abnormalities を are determined to た た. The に analysis of the <s:1> result を integration in the above record する する とで とで, the treatment target とバ <s:1> and <s:1> カ and カ and <s:1> the alternate を are all determined as する.

项目成果

Prospective Evaluation of Doxorubicin Cardiotoxicity in Patients with Advanced Soft-tissue Sarcoma Treated in the ANNOUNCE Phase III Randomized Trial.

• DOI: 10.1158/1078-0432.ccr-20-4592
• 发表时间: 2021-07-15
• 期刊: Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
• 作者: Jones RL;Wagner AJ;Kawai A;Tamura K;Shahir A;Van Tine BA;Martín-Broto J;Peterson PM;Wright J;Tap WD
• 通讯作者: Tap WD

Myxofibrosarcoma harboring an MLH1 pathogenic germline variant associated with Muir-Torre syndrome: a case report.

• DOI: 10.1186/s13053-021-00192-z
• 发表时间: 2021-08-21
• 期刊: Hereditary cancer in clinical practice
• 影响因子: 1.7
• 作者: Nakagawa M;Kobayashi E;Yamada M;Watanabe T;Hirata M;Tanabe N;Ushiama M;Sakamoto H;Sato C;Mori T;Yoshida A;Yoshida T;Sugano K;Kawai A
• 通讯作者: Kawai A

肉腫－日常診療からゲノム医療へ―

肉瘤 - 从日常医疗到基因组医学 -

• 发表时间: 2021
• 作者: Kubota Satoshi;Aoyama Eriko;Takigawa Masaharu;Nishida Takashi;塚崎雅之;川井 章
• 通讯作者: 川井 章

Establishment and characterization of NCC-UPS3-C1: a novel patient-derived cell line of undifferentiated pleomorphic sarcoma

NCC-UPS3-C1 的建立和表征：一种新型的患者来源的未分化多形性肉瘤细胞系

• DOI: 10.1007/s13577-021-00633-w
• 发表时间: 2021
• 期刊: Human Cell
• 影响因子: 4.3
• 作者: Tsuchiya Ryuto;Yoshimatsu Yuki;Noguchi Rei;Sin Yooksil;Ono Takuya;Akiyama Taro;Sugaya Jun;Nakatani Fumihiko;Kojima Naoki;Yoshida Akihiko;Ohtori Seiji;Kawai Akira;Kondo Tadashi
• 通讯作者: Kondo Tadashi

Establishment and characterization of NCC-MFS3-C1: a novel patient-derived cell line of myxofibrosarcoma

NCC-MFS3-C1 的建立和表征：一种新型的患者来源的粘液纤维肉瘤细胞系

• DOI: 10.1007/s13577-021-00548-6
• 发表时间: 2021
• 期刊: Human Cell
• 影响因子: 4.3
• 作者: Tsuchiya Ryuto;Yoshimatsu Yuki;Noguchi Rei;Sin Yooksil;Ono Takuya;Sei Akane;Takeshita Fumitaka;Sugaya Jun;Iwata Shintaro;Yoshida Akihiko;Ohtori Seiji;Kawai Akira;Kondo Tadashi
• 通讯作者: Kondo Tadashi