DNA複製複合体の構造変換による、RNAプライマー鎖長の制御機構の解明
DNA複製複合体の構造変換による、RNAプライマー鎖長の制御機構の解明
批准号:
20J12260
负责人:
沖 啓輔
金额:
$1.34万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-24 至 2022-03-31
中文摘要
アーキアの複製ポリメラーゼであるPolDが、CMGヘリカーゼ (MCM-GINS-GAN複合体) とプライマーゼのブリッジとなることでレプリソームを形成することを昨年度報告した。そこで、CMGヘリカーゼとPolDの複合体形成に関してさらに詳細な解析を行ったところ、GINSが2分子のPolDと強固に結合することが証明された。次にこの相互作用は、PolDのDP1サブユニットのN末端ドメイン(DP1N)とGINSのGins51サブユニットのC末端ドメイン(Gins51C)との結合によることを示し、DP1N-Gins51C-GAN三者複合体の結晶構造解析を行なった。さらに、DP1N-Gins51Cを介した結合が存在する条件でのみ、PolDがCMG様ヘリカーゼの一本鎖DNA依存性のヘリカーゼ活性を促進することを発見した。すなわち、リーディング鎖上を進行するCMGヘリカーゼにPolDが結合することによって、親DNA二本鎖を解く反応が促進されるという、ヘリカーゼ-ポリメラーゼ間の機能的な相互作用を初めて実験的に証明した。これらの結果をまとめて論文発表を行なった。CMGヘリカーゼとPolDの強固な結合とは対照的に、PolDとプライマーゼの複合体形成はPolD-PCNA-DNA複合体の形成とともに解消される。PolDとプライマーゼの相互作用部位についても詳細な構造解析が必要と考えた。PolDのDP2サブユニットのcPIPを模した合成ペプチドを設計し、精製したPriLのN末端ドメイン (PriLN)と混合して結晶構造解析を行なったところ、PriLNに存在する疎水性ポケットに、ヘリックス構造を形成したDP2cPIPが結合することが明らかとなり、部位特異的変異体を用いた生化学的解析によって複合体の形成における重要性が証明された。これらの結果をまとめて学会発表を行なった。論文投稿準備を進めている。
英文摘要
アーキアの複製ポリメラーゼであるPolDが、CMGヘリカーゼ (MCM-GINS-GAN複合体) とプライマーゼのブリッジとなることでレプリソームを形成することを昨年度報告した。そこで、CMGヘリカーゼとPolDの複合体形成に関してさらに詳細な解析を行ったところ、GINSが2分子のPolDと強固に結合することが証明された。次にこの相互作用は、PolDのDP1サブユニットのN末端ドメイン(DP1N)とGINSのGins51サブユニットのC末端ドメイン(Gins51C)との結合によることを示し、DP1N-Gins51C-GAN三者複合体の結晶構造解析を行なった。さらに、DP1N-Gins51Cを介した結合が存在する条件でのみ、PolDがCMG様ヘリカーゼの一本鎖DNA依存性のヘリカーゼ活性を促進することを発見した。すなわち、リーディング鎖上を進行するCMGヘリカーゼにPolDが結合することによって、親DNA二本鎖を解く反応が促進されるという、ヘリカーゼ-ポリメラーゼ間の機能的な相互作用を初めて実験的に証明した。これらの結果をまとめて論文発表を行なった。CMGヘリカーゼとPolDの強固な結合とは対照的に、PolDとプライマーゼの複合体形成はPolD-PCNA-DNA複合体の形成とともに解消される。PolDとプライマーゼの相互作用部位についても詳細な構造解析が必要と考えた。PolDのDP2サブユニットのcPIPを模した合成ペプチドを設計し、精製したPriLのN末端ドメイン (PriLN)と混合して結晶構造解析を行なったところ、PriLNに存在する疎水性ポケットに、ヘリックス構造を形成したDP2cPIPが結合することが明らかとなり、部位特異的変異体を用いた生化学的解析によって複合体の形成における重要性が証明された。これらの結果をまとめて学会発表を行なった。論文投稿準備を進めている。
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超好熱性アーキア Thermococcus kodakarensisのレプリソームにおけるPolD上でのプライマーゼからPCNAへの置換による機能変換
在超嗜热古菌 Thermococcus kodakarensis 的复制体中用 PCNA 取代 PolD 上的引物酶进行功能转换
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[沖啓輔, 山上健, 永田麻梨子, 真柳浩太, 白井剛, 安達成彦, 沼田倫征, 松本俊介, 石野園子, 石野良純]
通讯作者:
石野良純
Two conformations of DNA polymerase D-PCNA-DNA complex in a hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis.
超嗜热古菌 Thermococcus kodakarensis 中 DNA 聚合酶 D-PCNA-DNA 复合物的两种构象。
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[沖啓輔,真柳浩太,宮崎直幸,石野園子,山上健,森川耿右,岩崎憲治, 神田大輔,白井剛,石野良純]
通讯作者:
神田大輔,白井剛,石野良純
DOI:
10.1093/nar/gkab799
发表时间:
2022-04-22
期刊:
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
影响因子:
14.9
作者:
[Oki, Keisuke, Nagata, Mariko, Yamagami, Takeshi, Numata, Tomoyuki, Ishino, Sonoko, Oyama, Takuji, Ishino, Yoshizumi]
通讯作者:
Ishino, Yoshizumi
Structural and functional analysis of the interaction between family D-DNA polymerase and CMG-like helicase in the replisome of Thermococcus kodakarensis
柯达热球菌复制体中 D-DNA 家族聚合酶与 CMG 样解旋酶相互作用的结构和功能分析
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[沖 啓輔, 永田麻梨子, 山上 健, 沼田倫征, 石野園子, 大山拓 次, 石野良純]
通讯作者:
石野良純
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