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New breeding strategy using interaction between plants and endosphere bacteria

利用植物和内圈细菌之间相互作用的新育种策略

基本信息

批准号：
20K05982
负责人：
鈴木剛
金额：
$ 2.75万
依托单位：
Osaka Kyoiku University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では『マイクロバイオーム解析』と『植物組織内バクテリア局在可視化』を両輪に、エンドファイト群集の基盤情報を蓄積する。様々な環境下・生育状態のイネやトマト根組織内マイクロバイオームを解析し、エンドファイト群集として『植物の生育状況』と『バクテリア組織内局在』が連関しているバクテリア種を探索・同定し、この植物-微生物間相互作用に関係する植物側受容因子を遺伝学的に精査し、持続的農業に寄与する新しい育種戦略を構築することを目的としている。2022年度は、水田育成イネの根組織内のEndosphereのバクテリアに関しては、研究協力者（マレーシア・Rahman教授）にDNAを送付して次世代シークエンス解析をしていただいた16サンプルについて「R」を用いて再度詳細に統計解析した。マイクロバイオームデータを各分類群レベルに分けたうえで、バクテリアのデータ数を変化させて、関数metaMDSを使用しNMDSによる菌叢比較を行ったところ、生育具合の違いによって相違が見られた。さらに、PCAを実施することでComamonadaceaeやOxalobacteraceaeが生育不良になる方向へ寄与していることが明らかになった。本研究では生育にプラスの方向で影響を与えるエンドファイトを探索しているため、一旦アプローチを変更することにした。一方で、マレーシア側では、日本側のDNAを利用して真菌のマイクロバイオーム解析も試み、論文投稿中のバクテリアの解析結果とは別に論文準備中である。トマトのコンパニオンプランツに関しては、屋外の畑においてラッカセイの共植の影響（果実の評価を含む）を調査することを試みたが、天候不良などの影響でサンプルが大規模に失われ、マイクロバイオーム解析を断念することになり、次年度に行うことにした。また、FISHによるバクテリア局在可視化はトマトで改善することができた。

本研究では『マイクロバイオーム解析』と『植物組織内バクテリア局在可視化』を両輪に、エンドファイト群集の基盤情報を蓄積する。生物多样性管理局在生物多样性管理局内进行了植物-微生物相互作用的植物形态多样性的探索·同定试验，坚持的教育改革与新的教育发展战略协调一致，实现了教育目的的转变。2022年度，水肺成纤维细胞根癌内分泌系统Endosphere基因组DNA解译实验室，研究者（罗伯特·拉赫曼教授）将DNA测序交付给基因组DNA解译实验室，16个基因组DNA解译实验室“R”使用基因组DNA再次进行基因组DNA解译实验室。非典型增生性骨髓增生异常综合征，非典型增生性骨髓增生异常综合征。PCA阻碍细菌生长，丛枝菌科（Comamonadaceae）和草酸杆菌科（Oxalobacteraceae）生长不良，方向相反。本研究では生育にプラスの方向で影響を与えるエンドファイトを探索しているため、一旦アプローチを変更することにした。一方当事人、被告人、日本人DNA利用沙门氏菌感染者的看护人身份解析被告人、被告人中的原告人身份解析被告人中的被告人。トマトのコンパニオンプランツに関しては、屋外の畑においてラッカセイの共植の影響（果実の評価を含む）を調査することを試みたが、天候不良などの影響でサンプルが大規模に失われ、マイクロバイオーム解析を断念することになり、次年度に行うことにした。因此，FISH检测试剂盒检验局在可生化检测试剂盒改良后，可检测出病毒。

项目成果

期刊论文数量（8）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Double-Locking Mechanism of Self-Compatibility in Arabidopsis thaliana: The Synergistic Effect of Transcriptional Depression and Disruption of Coding Region in the Male Specificity Gene.

DOI：
10.3389/fpls.2020.576140
发表时间：
2020
期刊：
Frontiers in plant science
影响因子：
5.6
作者：
Suwabe K;Nagasaka K;Windari EA;Hoshiai C;Ota T;Takada M;Kitazumi A;Masuko-Suzuki H;Kagaya Y;Yano K;Tsuchimatsu T;Shimizu KK;Takayama S;Suzuki G;Watanabe M
通讯作者：
Watanabe M

Characterization of self-incompatible Brassica napus lines lacking SP11 expression

缺乏SP11表达的自交不亲和甘蓝型油菜品系的表征

DOI：
10.1266/ggs.19-00050
发表时间：
2020
期刊：
Genes & Genetic Systems
影响因子：
1.1
作者：
Okamoto;T.;Okamoto;M.;Hikichi;E.;Ogawa;M.;Takada;Y.;Suzuki;G.;Takayama;S.;and Watanabe;M.
通讯作者：
M.

モナシュ大学マレーシア(マレーシア)

莫纳什大学马来西亚分校（马来西亚）