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多成分一粒子輝度イメージングによる生細胞内ＴＤＰ４３凝集体形成機構解析

利用多组分单粒子亮度成像分析活细胞中TDP43聚集体的形成机制

基本信息

批准号：
19J13657
负责人：
福島綾介
金额：
$ 1.22万
依托单位：
Hokkaido University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-25 至 2021-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

2021年4月から6月まで「新型コロナウイルス感染症の影響に伴う特別研究員の採用期間の取扱いについて」に記載されている採用期間の延長を行い、主に学位論文の執筆等の研究成果取りまとめに専念した。本報告書では前述の期間中に取りまとめた2019年度と2020年度の研究成果を簡潔に報告する。本研究目的は、生細胞内でタンパク質のオリゴマー形成や凝集形成の初期過程の観測が可能な方法の開発である。タンパク質のオリゴマー形成や凝集形成は細胞内シグナル伝達や神経変性疾患と密接に関連し、生細胞内における観測と評価によって、細胞内分子機構に関して新たな知見を提供できる。本研究では最尤推定とベイズ推定を応用した方法の確立、そして、その方法の実証実験を行った。ベイズ推定では、経験ベイズ法を用いて画像中の近傍ピクセルの情報を学習し活用する解析法を確立した。蛍光画像には光の回折限界に由来するボケがあり、隣接するピクセル間で急激な蛍光強度の変化は緩和されるという特徴を活用した。実証実験では、緑色蛍光タンパク質（EGFP）溶液とEGFPを発現するHeLa細胞を用いて、本解析手法の妥当性を検証した。その溶液と細胞実験の結果から、パラメーターの推定精度は従来法と比較して10倍の精度となった。さらに、EGFPタンデム結合型二量体と三量体の測定結果から、１分子内に含まれる EGFPの数の変化がパラメーターの変化として反映されることを示した。これらの成果は論文としてBiophysical Journalに投稿し受理された（2021年3月）。本研究で開発した手法は、生細胞の蛍光画像の解析からタンパク質のオリゴマー形成を生細胞内で評価できる手法である。オリゴマー形成の評価は単純な蛍光画像の観察からでは評価困難であるが、本手法によって細胞内の機能制御に関連した新たな知見を得ることができる。

April to June, 2021,"The impact of new types of infectious diseases with special researcher's selection period" was recorded in the research results such as the extension of the selection period and the writing of the master's thesis. This report is a concise report on the research results of 2019 and 2020. The purpose of this study was to explore possible methods for detecting the initial process of cytokinesis and aggregation in living cells. The formation of aggregates in the cytoplasm provides new insights into the intracellular mechanisms involved in the detection and evaluation of neurological disorders and adhesion. This study is aimed at establishing, verifying and implementing the methodology for the estimation and application. To establish the analytical method for the study and application of the information in the image The light intensity of the light is reduced. The results show that the green fluorescent protein (EGFP) solution can be used to detect HeLa cells, and the analysis method is suitable. The accuracy of the estimation of the results of the solution is 10 times higher than that of the previous method The results of the determination of EGFP binding dimers and trimers are shown in Table 1. This paper was submitted to Biophysical Journal (March 2021). This study is aimed at developing methods for analyzing the fluorescence images of living cells and evaluating their formation in living cells. This technique is used to control the function of cells.