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結晶スポンジ法によるゲノムマイニングのワークフロー刷新

使用水晶海绵法的基因组挖掘工作流程创新

基本信息

批准号：
19J22015
负责人：
和田直樹
金额：
$ 1.79万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-25 至 2022-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

一昨年度からJing-Ke Weng准教授（アメリカ・ホワイトヘッド生物医学研究所）と続けている共同研究において、紅藻Laurencia pacificaの遺伝子情報から取得されたテルペン環化酵素の一種が産生する新規化合物の構造解析に成功した。本化合物は非結晶性の油状化合物であり既存の構造解析手法では正確な構造決定が困難であると予想されたものの、結晶スポンジ法によってその絶対配置を含めた化学構造が容易に導かれた。本化合物は独特の甘い香りを発することから、香料等の産業的な応用が期待される。また、これまで結晶スポンジ法においてほとんど用いられてこなかった極性溶媒（ケトン・エステル等）を解析対象化合物と混合することで、結晶スポンジ法においてステロイド化合物包接錯体の結晶構造解析がより高い信頼性をもって行えることを見出し、本知見をOrganic Letters誌に論文として発表した。本研究で得られた成果は、テルペン・ステロイド化合物の迅速かつ高信頼性のある構造解析に結晶スポンジ法の応用が有効であることを実証するものであり、生合成研究など微量化合物の構造解析が必要とされる研究分野においてその応用が今後も多く現れることが期待される。そのほか、結晶スポンジ法が2013年に初めて発表された以降8年の期間において、国内外の研究グループが達成した結晶スポンジ法における技術的改良や構造解析実施例について調査し、総説論文を発表した。

Last year から Jing Ke - Weng associate professor (アメリカ · ホワイトヘッド biomedical research institute) と続けている joint research において, red alga Laurencia Pacifica の heritage 伝 child intelligence から obtain されたテルペン cyclization enzyme の a が produce する new rules compound の structure に successful した. This compound は non-crystalline sex の oily compound であり existing の structure parsing technique ではな structure right decision が difficult であると to think されたものの, crystallization スポンジ method によってその unique configuration seaborne を containing めた chemical structure が easy に guide かれた. This compound is unique to <s:1> sweet and fragrant <s:1> を and を is expected to be used in する, する, と, ら, and other <s:1> industries such as spices. また, これまで crystallization スポンジ method においてほとんど with いられてこなかった polarity solvent (ケトン · エステル etc) を parsing as compound と mixed seaborne することで, crystallization スポンジ method においてステロイド inclusion compounds misprinted の crystallization structure がより high い letter 頼をもって line えることを see し, this knowledge を Organic Letters journal に paper とてて published たた This study で have られた results は, テルペン · ステロイド compound の quickly かつ high letter 頼のある structure analysis に crystallization スポンジ method の応 with が unseen であることを card be するものであり, biosynthesis research など trace compounds の structure が necessary とされる research eset においてその応 with がもくれ now more in the future ることが period Wait until される. そのほか, crystallization スポンがジ method at the beginning of 2013 にめて発 table された to drop during the eight years のにおいて, の research at home and abroad グループが reached した crystallization スポンジ method における technology improved や structure be applied example についして investigation, 総 said thesis を発 table した.