Development of a site-specific and comprehensive quantification method for protein phosphorylations based on MS/MS spectral simulation

开发基于 MS/MS 谱模拟的蛋白质磷酸化位点特异性综合定量方法

• 批准号: 19K07017
• 负责人: Imanishi Susumu
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: Meijo University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-01 至 2022-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19K07017/
• 关键词: 質量分析; 定量プロテオミクス; タンパク質リン酸化; シミュレーション; スペクトルライブラリ

项目成果

リン酸化シミュレーションソフトウェアSimPhosphoを用いたリン酸化部位特異的SWATHデータ解析法の開発

使用磷酸化模拟软件SimPhospho开发磷酸化位点特异性SWATH数据分析方法

• 发表时间: 2020
• 期刊: 名城大学総合研究所紀要
• 作者: 早川直希;平野裕大;高井彩乃;岩城圭一郎;Veronika Suni;今西進
• 通讯作者: 今西進

ケタミン投与マウスの大脳皮質及び海馬における抗うつ作用関連分子の探索

在氯胺酮给药小鼠的大脑皮层和海马中寻找抗抑郁药相关分子

• 发表时间: 2021
• 作者: 佐藤亮樹;高羽里佳;前田恭佑;近藤萌花;田崎ひなの;衣斐大祐;平松正行;今西 進
• 通讯作者: 今西 進

Optimization of TripleTOF spectral simulation and library searching for confident localization of phosphorylation sites

• DOI: 10.1371/journal.pone.0225885
• 发表时间: 2019-12-02
• 期刊: PLOS ONE
• 影响因子: 3.7
• 作者: Takai, Ayano;Tsubosaka, Tomoya;Imanishi, Susumu Y.
• 通讯作者: Imanishi, Susumu Y.

FFPE肺組織切片に対するSWATH法による定量プロテオーム解析法の条件検討

使用 SWATH 方法对 FFPE 肺组织切片进行定量蛋白质组分析的条件检查

• 发表时间: 2021
• 作者: 中野里咲;鈴木亜門;平野裕太;石津明洋;今西 進
• 通讯作者: 今西 進

SWATH測定による致死性血栓症モデルマウスの定量プロテオミクス

使用 SWATH 测量对致死性血栓模型小鼠进行定量蛋白质组学

• 发表时间: 2019
• 作者: 河村美奈;田崎ひなの;川原聖也;酒井麻衣;長野文彦;岩城圭一郎;谷郁孝;後藤彩花;水野智博;清水美衣;原田健一;今西進
• 通讯作者: 今西進