最適な乳がんホルモン療法を患者に届けるための新たな遺伝子診断法の開発
开发一种新的基因诊断方法,为患者提供最佳的乳腺癌激素治疗
基本信息
- 批准号:18K07310
- 负责人:
- 金额:$ 2.83万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2018
- 资助国家:日本
- 起止时间:2018-04-01 至 2020-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
令和元年度はタモキシフェンを含む乳がんホルモン療法が施行された患者を対象に血液サンプルの単核球分画より、生殖細胞系列のゲノムDNAを抽出し、エクソーム解析を行った。average depth of coverageは50程度であり、HGVD(Human Genome Variation Database)のreference配列と各症例のゲノムシーケンスを比較したところ、各症例につき約12万個のSingle Nucleotide Variant (SNV),Insertion/Deletion多型が同定された。同じくHGVDのreference配列をコントロールとしてC10orf11のターゲット・リシークエンスも行ったところ、0.1程度のアレル頻度をもつバリアント(SNV)を同定した。また昨年度に引き続き、本研究対象となる、上記治療を受けた乳がん症例を電子カルテより検索し、① 基本情報 (年齢、性別、がん種、既往歴、現病歴、家族歴、病期、治療内容、予後等)、②本研究に必要な情報 (前治療内容、治療開始日、投与量、併用薬剤、投与期間、投与方法、投与経路、副作用情報 (種類、発現日、Grade、発現期間等)、治療反応性情報 (縮小率、無再発生存期間、生存期間、無増悪生存期間等)) 等を抽出し、本研究における解析用の臨床情報データベースの一部を構築した。
In order to achieve this goal, we will conduct a series of treatments including breast cancer treatment, blood cell analysis, and germ cell analysis. Average depth of coverage 50 degrees, HGVD(Human Genome Variation Database) reference allocation, each case of the need to compare, each case of about 120,000 Single Nucleotide Variant (SNV),Insertion/Deletion polymorphism is the same. HGVD's reference arrangement is the same as C10orf11's reference arrangement, and the frequency of loss is the same as 0.1 degrees. This study aims to provide information on the treatment of breast cancer and breast cancer.(Age, gender, race, history, current disease history, family history, disease duration, treatment content, future, etc.) ② Necessary information for this study Part of the clinical information for analysis in this study was constructed by extracting information such as the content of previous treatment, treatment start date, dosage, combination agent, administration period, administration method, administration route, side effect information (type, onset date, Grade, onset period, etc.), treatment response information (reduction rate, recurrence-free survival period, survival period, recurrence-free survival period, etc.), etc.
项目成果
期刊论文数量(20)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Whole genome sequencing to identify predictive marker for the risk of drug-induced interstitial lung disease.
全基因组测序以确定药物引起的间质性肺病风险的预测标记。
- DOI:
- 发表时间:2019
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:H. Zembutsu;C. Udagawa;H. Horinouchi;K. Shiraishi;T. Kohno;T. Okusaka;H. Ueno;K. Tamura;Y. Ohe.
- 通讯作者:Y. Ohe.
Circulating tumor DNA assessed through amplicon-based next-generation sequencing and its clinical application.
通过基于扩增子的下一代测序评估循环肿瘤 DNA 及其临床应用。
- DOI:
- 发表时间:2019
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hitoshi Zembutsu;Hiroki Osumi;Eiji Shinozaki;Kensei Yamaguchi;Masato Ozaka;Takashi Sasaki;Marie Muramatsu;Naoki Sasahira.
- 通讯作者:Naoki Sasahira.
Clinical relevance of circulating tumor DNA assessed through deep sequencing in patients with metastatic colorectal cancer
- DOI:10.1002/cam4.1913
- 发表时间:2019-01-01
- 期刊:
- 影响因子:4
- 作者:Osumi, Hiroki;Shinozaki, Eiji;Zembutsu, Hitoshi
- 通讯作者:Zembutsu, Hitoshi
Clinical relevance of circulating tumor DNA assessed through amplicon-based next-generation sequencing.
通过基于扩增子的下一代测序评估循环肿瘤 DNA 的临床相关性。
- DOI:
- 发表时间:2019
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hitoshi Zembutsu;Hiroki Osumi;Eiji Shinozaki;Kensei Yamaguchi;Masato Ozaka;Takashi Sasaki;Naoki Sasahira.
- 通讯作者:Naoki Sasahira.
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- 作者:
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- 发表时间:
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- 影响因子:0
- 作者:
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- DOI:
- 发表时间:
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- 影响因子:0
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- 影响因子:0
- 作者:
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前佛 均
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$ 2.83万 - 项目类别:
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