次世代シーケンサーを用いた粘液線維肉腫の網羅的解析と新規治療標的の探索

使用下一代测序对粘液纤维肉瘤进行综合分析并寻找新的治疗靶点

• 批准号: 18J12043
• 负责人: 竹内 康英
• 金额: $ 1.22万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2018
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2018-04-25 至 2020-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18J12043/
• 关键词: 粘液繊維肉腫; 遺伝子変異解析; 粘液線維肉腫

本研究は粘液線維肉腫の遺伝子変異の詳細と、予後不良因子である低分化な成分が生じてくる遺伝学的機序や治療標的となりうる遺伝子異常を解明することを目的としている。遺伝子変異の詳細：全72症例の原発性MFSに対し、全エクソンシーケンス、ないしはターゲットシーケンスを行い、遺伝子変異を解析した。同時にシーケンスデータを用いて腫瘍内染色体のコピー数異常の解析も実施した。また、公開データベースに登録された116症例のデータも統合し解析した。130症例の全エクソンシーケンスデータで合計9,246個の遺伝子変異が検出され、中央値は55.5個であった。最も多くの症例で遺伝子変異を認めた遺伝子はTP53で、ATRX、RB1がそれに続いた。コピー数異常、ないしは免疫染色でのp53強陽性を含めた場合、合計104症例(55.3%)でTP53に関する異常が検出された。低分化な成分が生じてくる機序の解明について：12症例の腫瘍部由来DNAに対しメチル化アレイ実験を行い、公開データベースに登録された317症例の軟部肉腫メチル化アレイデータと統合して解析した。軟部肉腫は4個のクラスターに分類され、予後との有意な相関がみられた(p値：0.025)。粘液繊維肉腫に関する合計29症例のメチル化アレイデータを解析したが、予後や形態学的な変化と有意な相関を示す所見は得られなかった。現在ホルマリン固定後の組織に対するバイサルファイト全ゲノムシーケンスの実施によるより多くの症例での解析の実施を検討している。治療標的となりうる遺伝子異常に関して：上述の通り、現時点でMFSにおいて検出されている遺伝子異常はTP53の点突然変異やコピー数異常、形態学的異常と結びつきづらいエピゲノム変化などであり、分子標的治療薬の対象となりがたいもので、MFSの治療成績を劇的に向上させる遺伝子異常に関しては検出されていない。

This study focuses on the details of the differences between mucous line sarcoidosis and post-administration adverse factors including poorly differentiated components. The mechanism of てくる缝学 is to treat the target となりうる缝子 abnormalities and the purpose is to explain the することをpurpose. Details of the idiosyncrasies of the remaining children: all 72 cases of original MFS, all 72 casesケンス、ないしはターゲットシーケンスを行い、缝子変义をanalyticsた. At the same time, we are using the analysis method of abnormal chromosome number in tumors.また、Open the データベースに login された116 cases のデータもintegration analysis した. There are 130 cases of all cases, a total of 9,246 cases, a total of 9,246 cases, and a central case of 55.5 cases. The most common cases are TP53, ATRX, and RB1. Abnormal number of TP53 and strong positive immunostaining for p53 were detected in a total of 104 cases (55.3%). Poorly differentiated components of the disease: the origin of the tumor in the 12 cases of DNA diseaseを行い、Open データベースに登录された317 cases of soft part meat swelling メチル化アレイデータとintegrationしてanalyticsした. Soft part swelling は 4 のクラスターに classification され, Yogo との意な related がみられた (p value: 0.025). A total of 29 cases of mucoid sarcoidosis have been analyzed.が、The morphology of the morphology changes and the meaning is related to what is seen and what is seen. Now the tissue after the fixation of ホルマリンに対するバイサルファイト全ゲノムシーケンスの実士によるより多くの集でのANALYSISの実士を検している. The target of treatment is the abnormality of the left-behind child: the above-mentioned pass, the current point of the MFS TP53's point of abnormality is a sudden change in the number of points, anomalies in morphology, and anomalies in morphology.びつきづらいエピゲノム変化などであり、Molecular Targeted Treatment 薬の対 resemble となりがたいもので, MFS's treatment results are the drama's に上させる伝子 abnormality, に关しては検出されていない.

项目成果

Myxofibrosarcoma is characterized by frequent abnormalities in TP53 and increased genetic instability

粘液纤维肉瘤的特点是 TP53 频繁异常和遗传不稳定性增加

• 发表时间: 2019
• 作者: Yasuhide Takeuchi;Annegret Kunitz;Hiromichi Suzuki;Kenichi Yoshida;Yuichi Shiraishi;Teppei Shimamura;Kenichi Chiba;Hiroko Tanaka;Nobuyuki Kakiuchi;Yusuke Shiozawa;Akira Yokoyama;Tetsuichi Yoshizato;Kosuke Aoki;Yoichi Fujii;Hideki Makishima
• 通讯作者: Hideki Makishima

粘液線維肉腫の遺伝子変異・腫瘍内多様性の検討

粘液纤维肉瘤基因突变和瘤内多样性的检查

• 发表时间: 2018
• 作者: 竹内康英;鈴木啓道,吉田健一,垣内伸之,塩澤裕介,白石友一,牧島秀樹,Damm Frederik,羽賀博典,小川誠司
• 通讯作者: 鈴木啓道,吉田健一,垣内伸之,塩澤裕介,白石友一,牧島秀樹,Damm Frederik,羽賀博典,小川誠司

粘液線維肉腫にみられるTP53の異常と著明な遺伝的不安定性

粘液纤维肉瘤中 TP53 异常和显着的遗传不稳定性

• 发表时间: 2019
• 作者: 竹内 康英;鈴木 啓道;吉田 健一;白石 友一;垣内 伸之;塩澤 裕介;井上 善景;千葉 健一;牧島 秀樹;宮野 悟;羽賀 博典;Damm Frederik;小川 誠司
• 通讯作者: 小川 誠司

Comprehensive analysis of genetic alterations and intratumor heterogeneity in myxofibrosarcoma

粘液纤维肉瘤遗传改变和瘤内异质性的综合分析

• 发表时间: 2018
• 作者: Yasuhide Takeuchi;Annegret Kunitz;Hiromichi Suzuki;Kenichi Yoshida;Yuichi Shiraishi;Teppei Shimamura;Kenichi Chiba;Hiroko Tanaka;Nobuyuki Kakiuchi;Yusuke Shiozawa;Akira Yokoyama;Tetsuichi Yoshizato;Kosuke Aoki;Yoichi Fujii;Hideki Makishima
• 通讯作者: Hideki Makishima