次世代シーケンサーを用いた粘液線維肉腫の網羅的解析と新規治療標的の探索

使用下一代测序对粘液纤维肉瘤进行综合分析并寻找新的治疗靶点

• 批准号: 18J12043
• 负责人: 竹内 康英
• 金额: $ 1.22万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2018
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2018-04-25 至 2020-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18J12043/
• 关键词: 粘液繊維肉腫; 遺伝子変異解析; 粘液線維肉腫

本研究は粘液線維肉腫の遺伝子変異の詳細と、予後不良因子である低分化な成分が生じてくる遺伝学的機序や治療標的となりうる遺伝子異常を解明することを目的としている。遺伝子変異の詳細：全72症例の原発性MFSに対し、全エクソンシーケンス、ないしはターゲットシーケンスを行い、遺伝子変異を解析した。同時にシーケンスデータを用いて腫瘍内染色体のコピー数異常の解析も実施した。また、公開データベースに登録された116症例のデータも統合し解析した。130症例の全エクソンシーケンスデータで合計9,246個の遺伝子変異が検出され、中央値は55.5個であった。最も多くの症例で遺伝子変異を認めた遺伝子はTP53で、ATRX、RB1がそれに続いた。コピー数異常、ないしは免疫染色でのp53強陽性を含めた場合、合計104症例(55.3%)でTP53に関する異常が検出された。低分化な成分が生じてくる機序の解明について：12症例の腫瘍部由来DNAに対しメチル化アレイ実験を行い、公開データベースに登録された317症例の軟部肉腫メチル化アレイデータと統合して解析した。軟部肉腫は4個のクラスターに分類され、予後との有意な相関がみられた(p値：0.025)。粘液繊維肉腫に関する合計29症例のメチル化アレイデータを解析したが、予後や形態学的な変化と有意な相関を示す所見は得られなかった。現在ホルマリン固定後の組織に対するバイサルファイト全ゲノムシーケンスの実施によるより多くの症例での解析の実施を検討している。治療標的となりうる遺伝子異常に関して：上述の通り、現時点でMFSにおいて検出されている遺伝子異常はTP53の点突然変異やコピー数異常、形態学的異常と結びつきづらいエピゲノム変化などであり、分子標的治療薬の対象となりがたいもので、MFSの治療成績を劇的に向上させる遺伝子異常に関しては検出されていない。

The purpose of this study is to understand the purpose of this study. The purpose of this study is to understand the purpose of this study. The purpose of this study is to understand the purpose of this study. The purpose of this study is to understand the poor differentiation and poor differentiation of the adverse factors. There were 72 cases of primary MFS syndrome, all cases were caused by primary disease, the disease was caused by the disease, and the symptoms were analyzed. At the same time, we need to use the constant analysis of the number of chromosomes in the system. There were 116 cases of illness in the hospital, and there was an analysis of the system. In one hundred and thirty cases, a total of 9246 tax stations were sold in total and 55.5 in the central government. The most common cases of multiple diseases are TP53, ATRX, and RB1. There were 104 cases (55.3%) of TP53 infection with immunostaining and p53 immunostaining. The mechanism of poor differentiation is explained in the order of mechanism: in 12 cases, the origin of the disease is due to the DNA, the public, the registration, the registration, and the analysis of the system. There are 4 meat cuisines in the meat market, which are classified and are intended to be held in the future (p: 0.025). A total of 29 cases of mucus disease were analyzed, and the future physiology was intended to show what they had seen. Now, after the system is fixed, the organization will need to pay attention to the treatment of multiple symptoms of the disease. The symptoms of the disease are as follows: the above-mentioned symptoms, the time of the MFS, the sudden change of the temperature of the TP53, the normal results of the physiology, the response of the drugs, the treatment of the molecules, the symptoms of the disease, the symptoms of the molecules, the symptoms of the disease, the symptoms of the molecular medicine, the symptoms of the disease. The MFS treats the child of the baby in the upper part of the body. The child often makes a mistake.

项目成果

Myxofibrosarcoma is characterized by frequent abnormalities in TP53 and increased genetic instability

粘液纤维肉瘤的特点是 TP53 频繁异常和遗传不稳定性增加

• 发表时间: 2019
• 作者: Yasuhide Takeuchi;Annegret Kunitz;Hiromichi Suzuki;Kenichi Yoshida;Yuichi Shiraishi;Teppei Shimamura;Kenichi Chiba;Hiroko Tanaka;Nobuyuki Kakiuchi;Yusuke Shiozawa;Akira Yokoyama;Tetsuichi Yoshizato;Kosuke Aoki;Yoichi Fujii;Hideki Makishima
• 通讯作者: Hideki Makishima

粘液線維肉腫の遺伝子変異・腫瘍内多様性の検討

粘液纤维肉瘤基因突变和瘤内多样性的检查

• 发表时间: 2018
• 作者: 竹内康英;鈴木啓道,吉田健一,垣内伸之,塩澤裕介,白石友一,牧島秀樹,Damm Frederik,羽賀博典,小川誠司
• 通讯作者: 鈴木啓道,吉田健一,垣内伸之,塩澤裕介,白石友一,牧島秀樹,Damm Frederik,羽賀博典,小川誠司

粘液線維肉腫にみられるTP53の異常と著明な遺伝的不安定性

粘液纤维肉瘤中 TP53 异常和显着的遗传不稳定性

• 发表时间: 2019
• 作者: 竹内 康英;鈴木 啓道;吉田 健一;白石 友一;垣内 伸之;塩澤 裕介;井上 善景;千葉 健一;牧島 秀樹;宮野 悟;羽賀 博典;Damm Frederik;小川 誠司
• 通讯作者: 小川 誠司

Comprehensive analysis of genetic alterations and intratumor heterogeneity in myxofibrosarcoma

粘液纤维肉瘤遗传改变和瘤内异质性的综合分析

• 发表时间: 2018
• 作者: Yasuhide Takeuchi;Annegret Kunitz;Hiromichi Suzuki;Kenichi Yoshida;Yuichi Shiraishi;Teppei Shimamura;Kenichi Chiba;Hiroko Tanaka;Nobuyuki Kakiuchi;Yusuke Shiozawa;Akira Yokoyama;Tetsuichi Yoshizato;Kosuke Aoki;Yoichi Fujii;Hideki Makishima
• 通讯作者: Hideki Makishima