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がん遺伝子DEKによるクロマチン構造への影響とその制御法の解明

阐明癌基因DEK对染色质结构的影响及其调控方法

基本信息

批准号：
22KJ0871
负责人：
越後谷健太
金额：
$ 1.47万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2023
资助国家：
日本
起止时间：
2023-03-08 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

真核生物のゲノムDNAはクロマチン構造を形成し核内に収納されている。がん遺伝子タンパク質DEKはクロマチン結合因子でありさまざまな核内プロセスに関与しているが、どのようなメカニズムでクロマチンに結合し機能しているかは不明である。本研究では、クロマチンとDEKの複合体についてクライオ電子顕微鏡を用いて高分解能の構造解析を行い、DEKによるクロマチン結合のメカニズムを原子分解能で解明する。さらに、得られた構造をもとに生化学的解析を行い、DEKの結合がクロマチン構造に与える影響を解明する。本年度はクライオ電子顕微鏡を用いた構造解析を行った。この解析結果として、クロマチンの構成単位であるヌクレオソームとDEKの複合体の立体構造を高分解能で決定することに成功した。得られた立体構造から、ヌクレオソームのリンカーDNAと呼ばれるDNA部分にDEKが結合することと、DEKの結合によってヌクレオソームのリンカーDNAが特殊な配向を取ることを発見した。さらに、DEKのヌクレオソーム結合に重要だと思われるアミノ酸残基の候補を同定した。次年度はこれらのアミノ酸を変異させたDEKとヌクレオソームの結合試験を行う。また、本研究ではDEKの結合による高次クロマチン構造への影響を解析するために、高次クロマチンサンプルとDEKの複合体について構造生物学的解析を行う。本年度はヌクレオソームが多数連なったサンプルであるポリヌクレオソームの再構成を行なった。次年度はこのポリヌクレオソームとDEKの複合体を精製し、クライオ電子顕微鏡を用いた構造解析を行う計画である。

Eukaryotic organisms have to be able to form DNA structures in the nucleus. The combination factor of the core and the core is related to the combination function of the core and the core. In this study, the structure analysis of the complex of DEK and DEK with high decomposition energy and the atomic decomposition energy of DEK were studied. The analysis of the structure and the effect of DEK This year's electron microscope was used for structural analysis. The analysis results show that the structure of the complex can be determined by high decomposition energy. The results show that the three dimensional structure of DNA and DEK can be combined with the special orientation of DNA. In addition, DEK can also be used as a candidate for acid residues in combination with important components. In the next year, we will try our best to improve the quality of our products. In this study, we analyzed the effects of DEK on the structure of the complex. This year, the majority of the company's products were reorganized. The next year, the complex of DEK was refined, and the structure analysis of electron microscope was carried out.