Drawing a differentiation potency index of iPSC based on genomic imprinting

基于基因组印记绘制iPSC分化效能指数

• 批准号: 23659181
• 负责人: SOEJIMA Hidenobu
• 金额: $ 2.33万
• 依托单位: Saga University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-23659181/
• 关键词: エピジェネティクス; ゲノム刷り込み; iPS細胞; 肝芽腫; DNAメチル化; インプリントDMR; ゲノムインプリンティング; 分化万能性

To evaluate iPSC from the aspect of genomic imprinting, we analyzed DNA methylation status of imprinting related differentially methylated regions (DMRs), which were scattered throughout the genome, in iPSCs derived from mouse fibroblast, peripheral blood cells of normal human and Beckwith-Wiedemann syndrome patients. We also analyzed hepatoblastomas, which originated from immature liver precursor cells. We found that in mouse iPSC, the methylation status of many DMRs decreased after reprogramming and that a certain number of DMRs restored their methylation status during retinoic acid induced differentiation. Human iPSC showed that methylation patterns of several DMRs changed to paternal epigenotype after reprogramming. Finally, hepatoblastoma analysis suggested that the occurrence of hypomethylation at a few DMRs prior to tumor development.

为了从基因组印迹的角度评价iPSC，我们分析了分散在基因组中的印迹相关差异甲基化区域（DMRs）的DNA甲基化状态，这些区域分别来自小鼠成纤维细胞、正常人外周血和beckwithwithwiedemann综合征患者的iPSC。我们还分析了肝母细胞瘤，它起源于未成熟的肝前细胞。我们发现，在小鼠iPSC中，许多DMRs的甲基化状态在重编程后下降，并且在维甲酸诱导的分化过程中，一定数量的DMRs恢复了甲基化状态。人类iPSC显示，重编程后，几种DMRs的甲基化模式转变为父系表观遗传型。最后，肝母细胞瘤分析表明，在肿瘤发生之前，在一些DMRs中发生了低甲基化。

项目成果

本邦における間葉性異形成胎盤の臨床像．

日本间充质发育不良胎盘的临床特征。

• 发表时间: 2013
• 作者: 青木早織;大場隆;岡島翠;坂口 勲;東元健;副島英伸;福永真治;片渕秀隆．
• 通讯作者: 片渕秀隆．

Aberrant methylation of H19-DMR acquired after implantation was dissimilar in soma versus placenta of patients with Beckwith-Wiedemann syndrome

• DOI: 10.1002/ajmg.a.35335
• 发表时间: 2012-07-01
• 期刊: AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART A
• 影响因子: 2
• 作者: Higashimoto, Ken;Nakabayashi, Kazuhiko;Soejima, Hidenobu
• 通讯作者: Soejima, Hidenobu

シスチン尿症を伴うゲノムワイド父性片親性ダイソミー症例の遺伝子解析.

胱氨酸尿症全基因组父系单亲二倍体病例的遗传分析。

• 发表时间: 2013
• 作者: 大塚泰史;佐々木健作;城崎幸介;東元健;岡本伸彦;高間 勇一;窪田 昭男;松本富美中山 雅弘;吉浦孝一郎;副島英伸.
• 通讯作者: 副島英伸.

Beckwith-Wiedemann 症候群, Sotos 症候群

Beckwith-Wiedemann 综合征、Sotos 综合征

• 发表时间: 2013
• 期刊: 周産期医学
• 作者: 前田寿幸;東元健;副島英伸;副島英伸
• 通讯作者: 副島英伸

新生児期低血糖合併Beckwith-Wiedemann症候群患者における病態形成機序の検討

Beckwith-Wiedemann综合征并发新生儿低血糖的发病机制探讨

• 发表时间: 2013
• 作者: 長嶋一昭;田中大祐;東元 健;八木ひとみ;杉崎 和;田原 裕美子;小倉かさね;佐藤広規;佐藤雄一;山野 言;副島英伸;稲垣暢也
• 通讯作者: 稲垣暢也