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Prediction and screening of selective autophagy cargo in Saccharomyces cerevisiae

酿酒酵母选择性自噬货物的预测和筛选

基本信息

批准号：
24657083
负责人：
SUZUKI Kuninori
金额：
$ 2.58万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2012
资助国家：
日本
起止时间：
2012-04-01 至 2014-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

Macroautophagy (autophagy) is a bulk protein-degradation system ubiquitously conserved in eukaryotic cells. During autophagy, cytoplasmic components are enclosed in a membrane compartment, called an autophagosome. In this study, we developed a method for monitoring intact autophagosomes ex vivo by detecting the fluorescence of GFP-fused aminopeptidase I, the best-characterized selective cargo of autophagosomes in Saccharomyces cerevisiae. A combination of LC-MS/MS with subsequent statistical analyses revealed a list of autophagosome cargo proteins. The methods we describe will be useful for analyzing the mechanisms and physiological significance of Atg11-independent selective autophagy.

宏自噬是一种广泛存在于真核细胞中的蛋白质降解系统。在自噬过程中，细胞质成分被包裹在一个被称为自噬小体的膜室中。在这项研究中，我们建立了一种通过检测GFP融合氨基肽酶I的荧光来体外监测完整自噬小体的方法，GFP融合氨基肽酶I是酿酒酵母中最具特征的自噬小体选择性货物。LC-MS/MS与随后的统计分析相结合，揭示了自噬小体货物蛋白的清单。我们所描述的方法将有助于分析Atg11非依赖性选择性自噬的机制和生理意义。

项目成果

期刊论文数量（12）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

オートファジーによる被分解タンパク質の網羅的解析

自噬降解蛋白质的综合分析

DOI：
发表时间：
2013
期刊：
影响因子：
0
作者：
Takafumi Kobayashi;Kuninori Suzuki and Yoshinori Ohsumi;鈴木邦律
通讯作者：
鈴木邦律

東京大学大学院新領域創成科学研究科先端生命科学専攻生命応答システム分野HP

东京大学研究生院尖端科学研究生院生命响应系统系、尖端生命科学系 HP

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

東京大学大学院新領域創成科学研究科プロスペクタス

东京大学研究生院前沿科学研究生院招股说明书

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

Autophagosome formation can be achieved in the absence of Atg18 by expressing engineered PAS-targeted Atg2

DOI：
10.1016/j.febslet.2012.06.008
发表时间：
2012-07-30
期刊：
FEBS LETTERS
影响因子：
3.5
作者：
Kobayashi, Takafumi;Suzuki, Kuninori;Ohsumi, Yoshinori
通讯作者：
Ohsumi, Yoshinori

Organelle acidification is important for localisation of vacuolar proteins in Saccharomyces cerevisiae.

细胞器酸化对于酿酒酵母中液泡蛋白的定位很重要。

DOI：
10.1007/s00709-013-0510-2
发表时间：
2013
期刊：
Protoplasma
影响因子：
2.9
作者：
Suzuki K;Nakamura S;Morimoto M;Fujii K;Noda NN;Inagaki F;Ohsumi Y.;鈴木邦律他;Matsumoto R
通讯作者：
Matsumoto R