Diversity and evolution of gene expression in reptilian mitochondria

爬行动物线粒体基因表达的多样性和进化

• 批准号: 24657163
• 负责人: KUMAZAWA Yoshinori
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Nagoya City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-24657163/
• 关键词: ミトコンドリア; RNA-Seq; 爬虫類; 次世代シーケンス; RNA編集; polyA付加; RNA; 遺伝子発現; polyA; 次世代シーケンサー; トランスクリプトーム; ミトコンドリアDNA; 翻訳異常; 遺伝子配置変動

We conducted RNA-Seq experiments using animal species representing Reptilia. We found some variations in the distribution of polyA-addition sites to mRNAs and some of them are consistent with variations of gene arrangements of mtDNAs. Accuracy of polyA addition was lowered to some extent for particular mRNAs in a species though reasons for this are currently unknown. Relative ratio of each mRNA abundance in a species is changed in a way that is consistent with an idea that polycistronic mRNAs are created from one control region to another. The gene expression system in mitochondria has variations and is evolving in Reptilia.

我们使用代表爬虫类的动物物种进行了RNA-Seq实验。我们发现mrna上多聚a附加位点的分布存在一些变化，其中一些与mtdna基因排列的变化相一致。多聚a添加的准确性在一定程度上降低了特定的mrna在一个物种，虽然其原因目前尚不清楚。一个物种中每个mRNA丰度的相对比例以一种与多顺反子mRNA从一个控制区域产生到另一个控制区域的观点相一致的方式改变。爬行动物线粒体的基因表达系统存在变异，并在不断进化。

项目成果

ヤモリ類のミトコンドリアゲノミクス：遺伝子配置変動と系統関係

壁虎线粒体基因组学：基因排列变异和系统发育关系

• 发表时间: 2012
• 作者: 熊澤慶伯;三浦沙綾;孫ぎょう;ピエールジョニオ;山田知江美;橋口康之
• 通讯作者: 橋口康之

ヤモリ類のミトコンドリアゲノミクス : 遺伝子配置変動と系統関係

壁虎线粒体基因组学：基因排列变异和系统发育关系

• 发表时间: 2012
• 作者: 熊澤慶伯;三浦沙綾;孫ぎょう;ピエールジョニオ;山田知江美;橋口康之
• 通讯作者: 橋口康之

脊椎動物嗅覚受容体遺伝子ファミリーの進化研究における次世代シーケンサーの活用

下一代测序在脊椎动物嗅觉受体基因家族进化研究中的应用

• 发表时间: 2013
• 期刊: 生物科学
• 作者: 橋口康之;熊澤慶伯
• 通讯作者: 熊澤慶伯

爬虫類ミトコンドリアにおける転写物の網羅的解析

爬行动物线粒体转录本的综合分析

• 发表时间: 2013
• 作者: 孫ぎょう;栗崎政希;熊澤慶伯
• 通讯作者: 熊澤慶伯

並列DNAシーケンサーを用いた有鱗類嗅覚受容体遺伝子群の網羅的解析

使用并行DNA测序仪综合分析鳞甲嗅觉受体基因

• 发表时间: 2012
• 作者: 橋口康之;出原由季;松原和純;柳井徳磨;久保正仁;熊澤慶伯
• 通讯作者: 熊澤慶伯