Studies on Squamate phylogeny by complete mtDNA sequences

通过完整 mtDNA 序列研究有鳞动物系统发育

• 批准号: 12640680
• 负责人: KUMAZAWA Yoshinori
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 2001
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12640680/
• 关键词: Reptilia; mtDNA; molecular phylogeny; lizard; snake; blind snake; evolution; taxonomy; 高次分類; ミトコンドリア; 有鱗類; PCR; 分子系統解析; ゲノム; 進化; トカゲ類

I determined complete nucleotide sequences of mitochondrial genomes from representatives of several squamate families and conducted molecular phylogenetic analyses using nucleotide or amino acid sequences of mitochondrial genes. Squamate mitochondrial genomes thus sequenced had the typical gene organization that had been found for most other vertebrates, except in that Komodo monitor had peculiar gene rearrangements in its mitochondrial DNA. Phylogenetic analyses suggested that 1) extant snakes and lizards are monophyletic to each other, 2) Iguania does not represent the eariest lizard lineage, and 3) the blind snake is a sister lineage to other more advanced snakes. These findings add independent phylogenetic information to the conventional evolutionary view mostly based on morphology. I am interested in obtaining more data to understand higher phylogenetic relationships of reptiles.

我确定了几个有鳞科代表的线粒体基因组的完整核苷酸序列，并使用线粒体基因的核苷酸或氨基酸序列进行了分子系统发育分析。如此测序的有鳞动物线粒体基因组具有在大多数其他脊椎动物中发现的典型基因组织，除了科莫多巨蜥在其线粒体DNA中有特殊的基因重排。系统发育分析表明：1）现存的蛇和蜥蜴彼此是单系的; 2）鬣蜥并不代表最早的蜥蜴谱系; 3）盲蛇是其他更高级蛇的姐妹谱系。这些发现增加了独立的系统发育信息，传统的进化观主要是基于形态。我有兴趣获得更多的数据，以了解更高的爬行动物的系统发育关系。

项目成果

Kumazawa,Y. et al: "Molecular phylogeny of osteoglossoids : a new model for Gondwanian origin and plate tectonic transportation of the Asian arowana."Molecolar Biology and Evolution. 17(12). 1869-1878 (2000)

熊泽，Y.

熊澤 慶伯: "アロワナ淡水魚類のプレートラクトニクスによる大陸移動:分子時計と地質データの総合による新しい生物進化像の構築"月刊地球. 22(3). 208-214 (2001)

Yoshihaku Kumazawa：“淡水龙鱼板块内酯引起的大陆漂移：通过整合分子钟和地质数据构建生物进化的新图景”，《地球月刊》22(3) (2001)。

熊 澤 慶 伯: "アロワナ淡水魚類のプレートテクトニクスによる大陸移動;分子時計と地質データの総合による新しい生物進化像の構築"月刊地球. 22(3). 208-214 (2001)

Kei Haku Kumazawa：“龙鱼淡水鱼因板块构造而发生的大陆漂移；通过整合分子钟和地质数据构建生物进化的新图景”，地球月刊 22(3) (2001)。

Kumazawa, Y.: "Molecular clock estimation in fishes and its application to biogeographical studies"Proceedings of the International Commemorative Symposium for 70th Anniversary of the Japanese Society for Fisheries Science 1. (in press).

Kumazawa, Y.：“鱼类分子钟估计及其在生物地理学研究中的应用”日本水产学会成立 70 周年国际纪念研讨会论文集 1。（出版中）。

Cao,Y. et al.: "Phylogenetic position of turtles among amniotes : evidence from mitochondrial and nuclear genes."Grene. 259. 139-148 (2000)

曹Y.