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Molecular phylogeny using multiple nuclear gene sequences

Molecular phylogeny using multiple nuclear gene sequences
使用多个核基因序列的分子系统发育
批准号：
22657060
负责人：
KUMAZAWA Yoshinori
金额：
$2.17万
依托单位：
Nagoya City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2010
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2010 至 2011
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22657060/
关键词：
分子系統次世代シーケンサー爬虫類ヘビ類核ゲノムcDNA次世代シーケンサ

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We conducted high-throughput analyses using 4 squamate species and determined cDNA sequences of many highly expressed genes in the liver. Using the Blast analyses, we assessed the similarity of the cDNA representation between species, as well as the occurrence of paralogy for the highly expressed genes. Tree analyses suggested the phylogenetic position of snakes.
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Mitochondrial genomes of acrodont lizards: timing of gene rearrangements and phylogenetic and biogeographic implications.
DOI： 10.1186/1471-2148-10-141
发表时间： 2010-05-13
期刊： BMC evolutionary biology
影响因子： 3.4
作者： [Okajima Y, Kumazawa Y]
通讯作者： Kumazawa Y
A phylogeographic analysis of the air sac catfishes of the Heteropneustes fossilis species complex (Heteropneustidae : Siluriformes)
Heteropneustes 化石物种复合体（Heteropneustidae：鲶形目）气囊鲶鱼的系统发育地理学分析
DOI： --
发表时间： 2010
期刊：
影响因子： --
作者： [Ratmuangkhwang S., Musikasinthorn P., Kumazawa Y.]
通讯作者： Kumazawa Y.
カメ類のミトコンドリアゲノムにおける分子進化速度の不均一性
海龟线粒体基因组分子进化速率的异质性
DOI： --
发表时间： 2011
期刊：
影响因子： --
作者： [山田知江美, 柴田弘紀, 熊澤慶伯]
通讯作者： 熊澤慶伯
次世代シーケンシングによる新規ミトコンドリアゲノム配列決定の効率性と正確性
通过下一代测序进行新型线粒体基因组测序的效率和准确性
DOI： --
发表时间： 2011
期刊：
影响因子： --
作者： [熊澤慶伯, 橋口康之]
通讯作者： 橋口康之
共 21 条
    Diversity and evolution of gene expression in reptilian mitochondria
    • 批准号：
      24657163
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.58万
    • 财政年份：
      2012
    • 负责人：
      KUMAZAWA Yoshinori
    • 依托单位：
      Nagoya City University
    Molecular phylogeny of geckos using new mitogenomic approaches
    • 批准号：
      20370033
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $11.4万
    • 财政年份：
      2008
    • 负责人：
      KUMAZAWA Yoshinori
    • 依托单位：
      Nagoya City University
    Evolution and biogeography of freshwater fishes in relation to the collision of Indian subcontinent and climatic changes
    • 批准号：
      20405012
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $10.48万
    • 财政年份：
      2008
    • 负责人：
      KUMAZAWA Yoshinori
    • 依托单位：
      Nagoya City University
    Mesozoic continental fragmentations and lizard radiations
    • 批准号：
      17570076
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.24万
    • 财政年份：
      2005
    • 负责人：
      KUMAZAWA Yoshinori
    • 依托单位：
      Nagoya University
    海外基金