Molecular phylogeny using multiple nuclear gene sequences

使用多个核基因序列的分子系统发育

• 批准号: 22657060
• 负责人: KUMAZAWA Yoshinori
• 金额: $ 2.17万
• 依托单位: Nagoya City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22657060/
• 关键词: 分子系統; 次世代シーケンサー; 爬虫類; ヘビ類; 核ゲノム; cDNA; 次世代シーケンサ

We conducted high-throughput analyses using 4 squamate species and determined cDNA sequences of many highly expressed genes in the liver. Using the Blast analyses, we assessed the similarity of the cDNA representation between species, as well as the occurrence of paralogy for the highly expressed genes. Tree analyses suggested the phylogenetic position of snakes.

我们进行了高通量的分析，使用4种有鳞动物，并确定了许多高表达的基因在肝脏中的cDNA序列。使用Blast分析，我们评估了物种之间cDNA表达的相似性，以及高表达基因的旁系同源性的发生。树分析表明了蛇类的系统发育位置。

项目成果

Mitochondrial genomes of acrodont lizards: timing of gene rearrangements and phylogenetic and biogeographic implications.

• DOI: 10.1186/1471-2148-10-141
• 发表时间: 2010-05-13
• 期刊: BMC evolutionary biology
• 影响因子: 3.4
• 作者: Okajima Y;Kumazawa Y
• 通讯作者: Kumazawa Y

A phylogeographic analysis of the air sac catfishes of the Heteropneustes fossilis species complex (Heteropneustidae : Siluriformes)

Heteropneustes 化石物种复合体（Heteropneustidae：鲶形目）气囊鲶鱼的系统发育地理学分析

• 发表时间: 2010
• 作者: Ratmuangkhwang S.;Musikasinthorn P.;Kumazawa Y.
• 通讯作者: Kumazawa Y.

カメ類のミトコンドリアゲノムにおける分子進化速度の不均一性

海龟线粒体基因组分子进化速率的异质性

• 发表时间: 2011
• 作者: 山田知江美;柴田弘紀;熊澤慶伯
• 通讯作者: 熊澤慶伯

次世代シーケンシングによる新規ミトコンドリアゲノム配列決定の効率性と正確性

通过下一代测序进行新型线粒体基因组测序的效率和准确性

• 发表时间: 2011
• 作者: 熊澤慶伯;橋口康之
• 通讯作者: 橋口康之

ヘビ亜目における性染色体の分化過程

蛇科动物性染色体的分化过程

• 发表时间: 2009
• 作者: 松原和純;樽井寛;鳥羽通久;山田和彦;西田千鶴子;熊澤慶伯;阿形清和;松田洋一
• 通讯作者: 松田洋一