Molecular phylogeny of geckos using new mitogenomic approaches

使用新的线粒体基因组学方法进行壁虎的分子系统发育

• 批准号: 20370033
• 负责人: KUMAZAWA Yoshinori
• 金额: $ 11.4万
• 依托单位: Nagoya City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20370033/
• 关键词: 爬虫類; ヤモリ; ミトコンドリア; 分子系統; 次世代シーケンサー; 次世代シーケンサ

We established a method to sequence multiple complete mitochondrial genomes in parallel with the high-throughput sequencer. The efficiency and accuracy in the sequencing was confirmed using several reptilian individuals that had been sequenced for their mitogenomes manually. We have obtained dozens of complete or nearly complete mitogenomes to find new examples of gene rearrangements, as well as phylogenetic relationships of geckos.

我们建立了一种利用高通量测序仪并行测定多个线粒体全基因组序列的方法。测序的效率和准确性得到了几个爬行动物个体的证实，这些个体已经手动对其有丝分裂基因组进行了测序。我们已经获得了几十个完整或接近完整的有丝分裂基因组，以发现新的基因重排的例子，以及壁虎的系统发育关系。

项目成果

カメ類のミトコンドリアゲノムにおける分子進化速度の不均一性

海龟线粒体基因组分子进化速率的异质性

• 发表时间: 2011
• 作者: 山田知江美;柴田弘紀;熊澤慶伯
• 通讯作者: 熊澤慶伯

Molecular phylogenetic and dating analyses using mitochondrial DNA sequences of eyelid geckos.

使用眼睑壁虎线粒体 DNA 序列进行分子系统发育和年代测定分析。

• 发表时间: 2008
• 作者: Jonniaux;P.;熊澤慶伯
• 通讯作者: 熊澤慶伯

Mitochondrial genomes of acrodont lizards: timing of gene rearrangements and phylogenetic and biogeographic implications.

• DOI: 10.1186/1471-2148-10-141
• 发表时间: 2010-05-13
• 期刊: BMC evolutionary biology
• 影响因子: 3.4
• 作者: Okajima Y;Kumazawa Y
• 通讯作者: Kumazawa Y

シマヘビ嗅覚受容体遺伝子群のクローニングおよび系統解析

条纹蛇嗅觉受体基因簇的克隆及系统发育分析

• 发表时间: 2009
• 作者: 出原由季;橋口康之;松原和純;熊澤慶伯
• 通讯作者: 熊澤慶伯

ホームページ

主页