イネの雑種強勢に関する形質指標とゲノム指標の作成

创建水稻杂交活力的性状和基因组指标

基本信息

  • 批准号:
    23658001
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.5万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
  • 财政年份:
    2011
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2011 至 2013
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

イネのヘテロシスに関して形質の指標とゲノム指標の作成を目標に研究を行ってきた。形質指標に関しては、従来行われたイネのF1種子に比べ、交雑組み合わせや系統数を大幅に増やし、日本晴に対して、コシヒカリ、Taichung65 (T65)、キタアケ、黒色稲2号(A58)、インディカ系統のIR36、Kasalath、Peiku (#108)、アジア栽培稲の近縁野生種(O. rufipogon)であるW107、W593、W630、アフリカの栽培稲(O. glaberrima)であるWK18、WK21を交配に用いた。組合せは日本晴を基準親として、他の11系統を対応させ、全て相反交雑をした。これら20組み合わせのF1種子を3反復以上で試験することにより、高い精度でイネにおける全体的なヘテロシスの評価を行った。形質調査には、ヘテロシスが現れやすいと言われているF1種子の形質調査を実施し、胚サイズ、種子重量および発芽能について検討した。胚のサイズには交雑の組合せによってヘテロシスが現れ、母性効果と関連している可能性が指摘できた。イネ属内における種間交雑において、インプリンティングが関与した胚乳の発達不良により種子重量が低下することが示唆できた。発芽後3日間シュート長を測定したところ複数の組合せにおいてヘテロシスが確認でき、特に日本晴を雌親としインディカ系統とO.rufipogonおよびO. glaberrimaを雄親とした組合せでは、2日目から3日目のシュートの成長がヘテロシスに対応していることが分かった。ゲノム指標としては、マイクロアレイ解析を実施し、F1個体の葯の反復配列の発現が親に比べて低下することが判明した。以上の結果は、従来のアプローチでは得られない結果であり、本研究の独自の切り口によって明らかになった。研究開始以前の予想とは異なる結論が得られたことも興味深い。
イ ネ の ヘ テ ロ シ ス に masato し て character の index と ゲ ノ ム index の made を target に を line っ て き た. Form quality indicators に masato し て は, do わ 従 れ た イ ネ の F1 seed に than べ, pay group 雑 み わ せ や system several を に sharply raised や し, Japan fine に し seaborne て, コ シ ヒ カ リ, Taichung65 (T65), キ タ ア ケ, black color 稲 (A58) 2, イ ン デ ィ カ system の IR36, Kasalath, Peiku (#108), アジア cultivation rice アジア wild species of the near omens (O.rufipogon)であるW107, W593, W630, アフリカ <s:1> cultivation rice (O.glaberrima)であるWK18, WK21を mating に に た た. Combination せ は Japan fine を benchmark pro と し て, he の 11 system を 応 seaborne さ せ, whole て instead pay 雑 を し た. こ れ ら 20 group み close わ せ の F1 seed を above 3 repeatedly で test す る こ と に よ り, high precision い で イ ネ に お け る all な ヘ テ ロ シ ス の review 価 を line っ た. Form quality survey に は, ヘ テ ロ シ ス が now れ や す い と said わ れ て い る F1 seed の character investigation を be し, embryo サ イ ズ, seed weight お よ び 発 bud can に つ い て beg し 検 た. Embryo の サ イ ズ に は pay 雑 の combination せ に よ っ て ヘ テ ロ シ ス が れ now, maternity services fruit と masato even し て い る possibility が blame で き た. イ ネ within the genus に お け る interspecific pay 雑 に お い て, イ ン プ リ ン テ ィ ン グ が masato and し た endosperm の 発 of bad に よ り seed weight low が す る こ と が in stopping で き た. 発 bud after 3 day シ ュ ー ト long を determination し た と こ ろ plural の combination せ に お い て ヘ テ ロ シ ス が confirm で き, に を Japan shine dam と し イ ン デ ィ カ system と O.r ufipogon お よ び O. Glaberrima を sires と し た combination せ で は, 2 eyes か ら 3 orders の シ ュ ー ト の growth が ヘ テ ロ シ ス に 応 seaborne し て い る こ と が points か っ た. ゲ ノ ム index と し て は, マ イ ク ロ ア レ イ parsing を be し, F1 individuals の medicine の repeatedly with column の 発 が pro に now than べ て low す る こ と が.at し た. は の results above, the 従 の ア プ ロ ー チ で は have ら れ な い results で あ り, this study の の alone cut り に よ っ て Ming ら か に な っ た. Before the start of the research, <s:1> yu thought that と なる was different from なる and the conclusion が was that られた られた と と が was very interesting.

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
イネゲノム反復配列の発現パターンから見た雄性生殖器官の特徴化
基于水稻基因组重复序列表达模式的雄性生殖器官表征
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Toriyama K;Kazama T;貴島祐治,石黒聖也,太田雄也,佐藤裕
  • 通讯作者:
    貴島祐治,石黒聖也,太田雄也,佐藤裕
イネゲノムによるウイルス断片の取り込みとその進化
水稻基因组中病毒片段的整合及其进化
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    .A Yasukouchi;T Kozaki,;貴島祐治
  • 通讯作者:
    貴島祐治
An intact mitochondrial cox1 gene and a pseudogene with different genomic configurations are present in apple cultivars 'Golden Delicious' and 'Delicious' : Evolutionary aspects
苹果品种“金冠”和“美味”中存在完整的线粒体 cox1 基因和具有不同基因组配置的假基因:进化方面
  • DOI:
    10.1016/j.scienta.2011.05.037
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.3
  • 作者:
    Tetsuo Yasugi;Umetsu Daiki;Satoshi Murakami;Makoto Sato;Tetsuya Tabata;A.Wakatsuki
  • 通讯作者:
    A.Wakatsuki
イネのゲノム中のAT反復配列は種々のDNAを取り込む進化の原動力
水稻基因组中的 AT 重复序列是进化整合各种 DNA 的驱动力
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    矢 野峻朗;伊奈深雪;安河内朗;Hung-Lieh Hu;Ya-Hui Chiang;Chien-Chun Lu;小柳香奈子
  • 通讯作者:
    小柳香奈子
Transcriptions of repeat sequences at boot stage in rice anther and its expression changes induced by low-temperature.
水稻花药启动期重复序列的转录及其低温诱导的表达变化
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Seiya Ishiguro;Yutaka Sato and Yuji Kishima
  • 通讯作者:
    Yutaka Sato and Yuji Kishima
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貴島 祐治其他文献

Double coverings and integral local system cohomology of arrangements
双重覆盖和排列的积分局部系统上同调
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    Sakumi Sugawara
フォトグラメトリを利用した野生イネ草姿の三次元解析
利用摄影测量技术对野生稻草外观进行三维分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    徳山 芳樹;串田 栞理;曵地 究;貴島 祐治;小出 陽平
  • 通讯作者:
    小出 陽平
アジアとアフリカの栽培イネから なる 4 倍体雑種イネのゲノム構成
亚洲和非洲栽培稻四倍体杂交水稻的基因组组成
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    古田智敬;長岐清孝;柏原壱成;國吉大地;北島克哉;小出陽平;貴島 祐治;山本敏央
  • 通讯作者:
    山本敏央
次世代シークエンスを用いたジェノタイピングに おける比較ゲノム情報に基づく誤判定の低減法
使用下一代测序进行基因分型时基于比较基因组信息减少假阳性的方法
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    古田 智敬;鳥羽 大陽;貴島 祐治;山本 敏央
  • 通讯作者:
    山本 敏央
植物のゲノムに潜むウイルス-反復配列に秘められたしなやかでしたたかな植物ゲノム-
隐藏在植物基因组中的病毒 - 隐藏在重复序列中的灵活而强大的植物基因组 -
  • DOI:
  • 发表时间:
    2004
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    奥野倫子;生田英輔;宮野道雄;宮野道雄;Shin-Nosuke Hashida;生田英輔;Shin-Nosuke Hashida;So Kobayashi;Miwako Takata;Hashida Shinnosuke;Takata Miwako;Kobayashi Sou;Kunii Motoyuki;Kishima Yuji;貴島 祐治
  • 通讯作者:
    貴島 祐治

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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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アジアとアフリカ栽培イネの異種間4倍体雑種の生殖維持機構と育種利用に関する研究
亚非水稻种间四倍体杂种繁殖维持机制及育种应用研究
  • 批准号:
    23K26873
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.5万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Study on reproductive maintenance and breeding utilization of the interspecific tetraploid hybrids between Asian and African cultivated rice.
亚非栽培稻种间四倍体杂种繁殖维持及育种利用研究
  • 批准号:
    23H02180
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.5万
  • 项目类别:
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イネ小胞子に潜在する個体分化能と倍数化能を活用した育種基盤の新構築
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    19H00937
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    2019
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    25292003
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    2013
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イネゲノムに内在するウイルス様配列の耐病性付与機能の検証
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  • 批准号:
    16658001
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 2.5万
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    Grant-in-Aid for Exploratory Research
イネゲノムに内在するウイルス様断片と耐病性との関係解明
阐明水稻基因组中的病毒样片段与抗病性之间的关系
  • 批准号:
    15028202
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 2.5万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
イネゲノムに見出されたツングロウイルスゲノム断片の構造と機能に関する分子的基礎
水稻基因组中发现的东风病毒基因组片段结构和功能的分子基础
  • 批准号:
    13039003
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 2.5万
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キンギョソウ・トランスポゾンTam3の温度依存性転移機構の分子遺伝学的解析
金鱼草转座子 Tam3 温度依赖性转座机制的分子遗传学分析
  • 批准号:
    09760002
  • 财政年份:
    1997
  • 资助金额:
    $ 2.5万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
キンギョソウ・トランスポゾンTam3に対する転移抑制遺伝子の機能解析
金鱼草转座子 Tam3 转移抑制基因的功能分析
  • 批准号:
    08760002
  • 财政年份:
    1996
  • 资助金额:
    $ 2.5万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
キンギョソウ・トランスポゾンTem3の転移活性が形質変異に及ぼす影響
金鱼草转座子Tem3转座活性对表型变异的影响
  • 批准号:
    07760006
  • 财政年份:
    1995
  • 资助金额:
    $ 2.5万
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    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

相似海外基金

初期生育におけるヘテロシス(雑種強勢)の発現機構の解明と育種利用
阐明早期生长期间杂种优势(杂种优势)的表达机制及其在育种中的应用
  • 批准号:
    22K05569
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
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アブラナ科野菜の雑種強勢における顕性遺伝子座の役割の解明
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  • 批准号:
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  • 资助金额:
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イネ幼苗期のプラスチドゲノムコピー数を指標とした雑種強勢評価法の検討
以水稻苗期质体基因组拷贝数为指标的杂种优势评价方法探讨
  • 批准号:
    21K05513
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 2.5万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
アポミクシス形質を獲得してクローン胚を形成するコムギの作出と関連遺伝子の同定
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    19H02935
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
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Elucidation of the molecular mechanism of hybrid vigor in Brassica vegetables
芸苔类蔬菜杂交活力分子机制的阐明
  • 批准号:
    19H02947
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 2.5万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Understanding disease registance mechanism in sugar beet by deep data
通过深度数据了解甜菜的发病机制
  • 批准号:
    18K05915
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 2.5万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Epigenome analysis in the commercial F1 hybrid cultivar in Chinese cabbage(Fostering Joint International Research)
大白菜商业F1杂交品种的表观基因组分析(促进国际联合研究)
  • 批准号:
    16KK0171
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 2.5万
  • 项目类别:
    Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research)
Genome prediction of F1 yield between heterotic groups in sugar beet.
甜菜杂种优势群体之间 F1 产量的基因组预测。
  • 批准号:
    17K07615
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 2.5万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Study on identification of genes associated with heterosis and application for breeding.
杂种优势相关基因鉴定及其育种应用研究
  • 批准号:
    17K15207
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 2.5万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
Identification of hybrid vigor related loci in Brassica
芸苔属杂种优势相关位点的鉴定
  • 批准号:
    15H05614
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 2.5万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
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知道了