イネの雑種強勢に関する形質指標とゲノム指標の作成

创建水稻杂交活力的性状和基因组指标

• 批准号: 23658001
• 负责人: 貴島 祐治
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-23658001/
• 关键词: イネ; ヘテロシス; 形質指標; ゲノム指標; 種子形質; マイクロアレイ; 反復配列; 葯; 雑種強勢; F１種子; マイクロアレイ解析

イネのヘテロシスに関して形質の指標とゲノム指標の作成を目標に研究を行ってきた。形質指標に関しては、従来行われたイネのF1種子に比べ、交雑組み合わせや系統数を大幅に増やし、日本晴に対して、コシヒカリ、Taichung65 (T65)、キタアケ、黒色稲２号(A58)、インディカ系統のIR36、Kasalath、Peiku (#108)、アジア栽培稲の近縁野生種(O.　rufipogon)であるW107、W593、W630、アフリカの栽培稲(O. glaberrima)であるWK18、WK21を交配に用いた。組合せは日本晴を基準親として、他の11系統を対応させ、全て相反交雑をした。これら20組み合わせのF1種子を３反復以上で試験することにより、高い精度でイネにおける全体的なヘテロシスの評価を行った。形質調査には、ヘテロシスが現れやすいと言われているF1種子の形質調査を実施し、胚サイズ、種子重量および発芽能について検討した。胚のサイズには交雑の組合せによってヘテロシスが現れ、母性効果と関連している可能性が指摘できた。イネ属内における種間交雑において、インプリンティングが関与した胚乳の発達不良により種子重量が低下することが示唆できた。発芽後3日間シュート長を測定したところ複数の組合せにおいてヘテロシスが確認でき、特に日本晴を雌親としインディカ系統とO.rufipogonおよびO. glaberrimaを雄親とした組合せでは、2日目から3日目のシュートの成長がヘテロシスに対応していることが分かった。ゲノム指標としては、マイクロアレイ解析を実施し、F1個体の葯の反復配列の発現が親に比べて低下することが判明した。以上の結果は、従来のアプローチでは得られない結果であり、本研究の独自の切り口によって明らかになった。研究開始以前の予想とは異なる結論が得られたことも興味深い。

イ ネ の ヘ テ ロ シ ス に masato し て character の index と ゲ ノ ム index の made を target に を line っ て き た. Form quality indicators に masato し て は, do わ 従 れ た イ ネ の F1 seed に than べ, pay group 雑 み わ せ や system several を に sharply raised や し, Japan fine に し seaborne て, コ シ ヒ カ リ, Taichung65 (T65), キ タ ア ケ, black color 稲 (A58) 2, イ ン デ ィ カ system の IR36, Kasalath, Peiku (#108), アジア cultivation rice アジア wild species of the near omens (O.rufipogon)であるW107, W593, W630, アフリカ <s:1> cultivation rice (O.glaberrima)であるWK18, WK21を mating に に た た. Combination せ は Japan fine を benchmark pro と し て, he の 11 system を 応 seaborne さ せ, whole て instead pay 雑 を し た. こ れ ら 20 group み close わ せ の F1 seed を above 3 repeatedly で test す る こ と に よ り, high precision い で イ ネ に お け る all な ヘ テ ロ シ ス の review 価 を line っ た. Form quality survey に は, ヘ テ ロ シ ス が now れ や す い と said わ れ て い る F1 seed の character investigation を be し, embryo サ イ ズ, seed weight お よ び 発 bud can に つ い て beg し 検 た. Embryo の サ イ ズ に は pay 雑 の combination せ に よ っ て ヘ テ ロ シ ス が れ now, maternity services fruit と masato even し て い る possibility が blame で き た. イ ネ within the genus に お け る interspecific pay 雑 に お い て, イ ン プ リ ン テ ィ ン グ が masato and し た endosperm の 発 of bad に よ り seed weight low が す る こ と が in stopping で き た. 発 bud after 3 day シ ュ ー ト long を determination し た と こ ろ plural の combination せ に お い て ヘ テ ロ シ ス が confirm で き, に を Japan shine dam と し イ ン デ ィ カ system と O.r ufipogon お よ び O. Glaberrima を sires と し た combination せ で は, 2 eyes か ら 3 orders の シ ュ ー ト の growth が ヘ テ ロ シ ス に 応 seaborne し て い る こ と が points か っ た. ゲ ノ ム index と し て は, マ イ ク ロ ア レ イ parsing を be し, F1 individuals の medicine の repeatedly with column の 発 が pro に now than べ て low す る こ と が.at し た. は の results above, the 従 の ア プ ロ ー チ で は have ら れ な い results で あ り, this study の の alone cut り に よ っ て Ming ら か に な っ た. Before the start of the research, <s:1> yu thought that と なる was different from なる and the conclusion が was that られた られた と と が was very interesting.

项目成果

イネゲノム反復配列の発現パターンから見た雄性生殖器官の特徴化

基于水稻基因组重复序列表达模式的雄性生殖器官表征

• 作者: Toriyama K;Kazama T;貴島祐治，石黒聖也，太田雄也，佐藤裕
• 通讯作者: 貴島祐治，石黒聖也，太田雄也，佐藤裕

イネゲノムによるウイルス断片の取り込みとその進化

水稻基因组中病毒片段的整合及其进化

• 发表时间: 2013
• 作者: .A Yasukouchi;T Kozaki,;貴島祐治
• 通讯作者: 貴島祐治

An intact mitochondrial cox1 gene and a pseudogene with different genomic configurations are present in apple cultivars 'Golden Delicious' and 'Delicious' : Evolutionary aspects

苹果品种“金冠”和“美味”中存在完整的线粒体 cox1 基因和具有不同基因组配置的假基因：进化方面

• DOI: 10.1016/j.scienta.2011.05.037
• 发表时间: 2011
• 期刊: Scientia Horticulturae
• 影响因子: 4.3
• 作者: Tetsuo Yasugi;Umetsu Daiki;Satoshi Murakami;Makoto Sato;Tetsuya Tabata;A.Wakatsuki
• 通讯作者: A.Wakatsuki

植物の分子育種学

植物分子育种

• 发表时间: 2011
• 作者: 星野敦;玉田洋介
• 通讯作者: 玉田洋介

イネのゲノム中のAT反復配列は種々のDNAを取り込む進化の原動力

水稻基因组中的 AT 重复序列是进化整合各种 DNA 的驱动力

• 发表时间: 2013
• 期刊: 日本草地学会誌
• 作者: 矢 野峻朗;伊奈深雪;安河内朗;Hung-Lieh Hu;Ya-Hui Chiang;Chien-Chun Lu;小柳香奈子
• 通讯作者: 小柳香奈子