完全甘ガキ性決定遺伝子の同定と機能解析

甜牡蛎性别决定全基因的鉴定及功能分析

• 批准号: 21K14848
• 负责人: 西山 総一郎
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K14848/
• 关键词: 果樹; プロアントシアニジン; 倍数性; 果実品質; ゲノム; ゲノム解析

本研究では、カキの最重要形質の一つである完全甘ガキ性の決定遺伝子座の解析と制御メカニズムの解明を目指した研究を実施している。これまでに、決定遺伝子の座乗領域はカキ属近縁種ゲノムベースで約900kbに絞り込まれている。しかしながら、栽培ガキの倍数性も一因となり、決定遺伝子とその制御メカニズムは同定できていない。2022年度は以下に示す3つの点について進展があった。1. 六倍体カキのゲノムをPacbio Hifiによりシーケンスした。ハプロタイプレベルのアセンブルを目指したが、6つのゲノムのうち5つしかアセンブルされなかった。しかし、甘渋性決定領域については、過去に作製した甘渋性連鎖マーカーをアセンブルされた配列に全て配置することができ、機能ハプロタイプを見分けることが可能となり、ゲノム上の構造変異が可視化された。2. 前年度に見出された変異型完全甘ガキアレルに遺伝的に近いと思われる顕性の非完全甘ガキアレルの配列を詳細に解析した。遺伝資源とF1集団10個体のゲノムシーケンスを組み合わせて解析し、候補遺伝子は7遺伝子、候補多型は80個に絞られた。これらに非同義置換は含まれなかったが、1つの候補遺伝子のイントロン部に多型が集中していた。これを有力な候補遺伝子とみなし、機能解析に着手した。3. 完全甘ガキ育種で見られる、完全甘ガキであるにも関わらず渋味を呈する個体 (渋残り) のサンプル・データ収集を進めた。これら個体の渋味は甘渋性決定領域とは独立した遺伝的制御を受けることが確認された。

In this study, one of the most important features of this study is to make a decision on the analysis of the constellation, and to understand the meaning of the research. It is necessary to determine that the sub-regional economic cooperation belongs to several kinds of economic cooperation in the near future, and that the 900kb is responsible for the economic development of all countries. In the first place, the multiplicity of the plant is affected, and it is decided that the system should be controlled and controlled. In 2022, the following shows that the following will show the progress of the three-day program. 1. The hexaploid fish is Pacbio Hifi, and the hexaploid is not. I don't know what to do. I don't know. I don't know. In the past, it is necessary to make a comprehensive configuration of the whole configuration system, the ability of the machine to determine the availability of information, the availability of equipment, and the availability of equipment. two。 In the previous year, it was announced that there was a close relationship between the two types of women in the previous year, and that they were not completely satisfied. In the F1 set of resources, there are 10 general health care providers, 7 health care providers, and 80 candidates with multiple types. This is not the same setting. There are two types of data, one is waiting for each other, and the other is the one with multiple types. The computer is capable of analyzing the data of the computer and the computer. 3. It is very easy to breed all kinds of food, and the taste is very good. The whole collection is improved. It is necessary to determine the control of the field and the control of the independent system.

项目成果

カキ甘渋性を制御する候補遺伝子の探索

寻找控制牡蛎甜度的候选基因

• 发表时间: 2021
• 作者: 藤原陽介;西山総一郎;尾上典之;松崎隆介;米森敬三;田尾龍太郎
• 通讯作者: 田尾龍太郎

DNA sequence diversity of the astringency-controlling locus in Diospyros kaki

柿子涩味控制位点 DNA 序列多样性

• DOI: 10.17660/actahortic.2022.1338.13
• 发表时间: 2022
• 期刊: Acta Hort.
• 作者: Nishiyama;S.;A. Kuramoto;and R. Tao
• 通讯作者: and R. Tao

Candidate gene analysis for the ASTRINGENCY locus controlling fruit astringency in Diospyros kaki based on mRNA- and small RNA-sequencing analyses

基于 mRNA 和小 RNA 测序分析的控制柿子果实涩味的 ASTRINGENCY 位点候选基因分析

• 发表时间: 2022
• 期刊: Acta Horticulturae
• 作者: Yosuke Fujiwara;Nishiyama Soichiro;Onoue Noriyuki;Matsuzaki Ryusuke;Yonemori Keizo;Tao Ryutaro
• 通讯作者: Tao Ryutaro

Candidate gene analysis for the ASTRINGENCY locus controlling fruit astringency in Diospyros kaki using mRNA-seq and small RNA-seq data

使用 mRNA-seq 和小 RNA-seq 数据对柿子中控制果实涩味的 ASTRINGENCY 基因座进行候选基因分析

• 发表时间: 2021
• 作者: Fujiwara;Y.;S. Nishiyama;N. Onoue;R. Matsuzaki;K. Yonemori and R. Tao
• 通讯作者: K. Yonemori and R. Tao

タンニン細胞の発達と完全甘ガキの「渋残り」との関連性

单宁细胞发育与全甜牡蛎“涩味”的关系

• 发表时间: 2022
• 作者: Fujiwara;Y.;S. Nishiyama;N. Onoue;R. Matsuzaki;K. Yonemori;R. Tao;安田 喜一・廣田 真也・松永 涼・金子 博・戸村 大河・富永 晃好・八幡 昌紀;山本涼平・尾形凡生・岩本將稔・米森敬三;佐藤真衣・安田喜一（CA）・森上千聖・金子 博・松山 知樹;藤原陽介・西山総一郎・尾上典之・米森敬三・田尾龍太郎
• 通讯作者: 藤原陽介・西山総一郎・尾上典之・米森敬三・田尾龍太郎