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白血病細胞のin vitro薬剤感受性に影響を及ぼす因子の網羅的分子遺伝学的解析

白血病细胞体外药物敏感性影响因素综合分子遗传学分析

基本信息

批准号：
21K15862
负责人：
清水大輔
金额：
$ 2.91万
依托单位：
Hamamatsu University School of Medicine
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

児白血病の予後は改善しているが、再発・難治小児急性白血病や、乳児急性リンパ性白血病は未だ予後不良であり、治療成績向上のためには、新規薬剤などを用いた治療戦略の確立が求められている。コストの安いin vitro薬剤感受性試験により、再発・難治急性白血病、乳児急性リンパ性白血病の薬剤感受性プロファイルを判明させ、特定の薬剤に感受性を持つ白血病細胞に対し、近年進歩の著しい次世代シークエンスを用いた全エクソーム解析やRNAシークエンスなどによる遺伝子発現量の解析などの網羅的解析により、薬剤感受性に関わる標的遺伝子を抽出し、薬剤感受性の背景となるbiologyを解明する。具体的には、新規薬剤を導入した新たな薬剤感受性試験用のプレートを設計、作成をした。次に、凍結保存されている細胞株を解凍し、培養を行った。培養した細胞株が十分増殖した後、それぞれの細胞株と臨床検体に対して薬剤感受性試験を実施した。薬剤感受性試験で得られた結果から、特定の薬剤に感受性を持つ白血病細胞で次世代シークエンスを用いたやRNA-seqを実施し、薬剤感受性と関連のある遺伝子のfusionをpick upした。白血病と関連のあるfusion geneは複数同定できたが、何れも臨床で行われた検査ですでに同定されているものであり、薬剤感受性との関連は疑われないものだった。次に、主に分子標的薬における薬剤感受性試験結果に基づいて検体を感受性あり群となし群に群分けした。感受性あり群・なし群間でRNA-seqでの発現量に差がある遺伝子を抽出し、複数遺伝子を同定したが、薬剤感受性との関連が明らかなものはなかった。JPLSG臨床試験の余剰検体を用いた研究が一部の研究では利用可能となったため解析を開始した。

"Leukemia" in the future, we will improve the treatment of acute leukemia, treat small acute leukemia, breast acute leukemia and breast acute leukemia. We need to know that we can treat acute leukemia, breast cancer, leukemia, leukemia. In recent years, the next generation system has been used to analyze the data of the RNA network, the extraction of the sensor, the background of the receptivity, and the background of the biology. The specific information and new regulations are imported into the new system. The sensitivity of the device is designed and made into a device by using the software device. For the second time, please save the cell line and culture it. After the growth of the cell line, the growth rate of the cell line was significantly higher than that of the control group, and the cell line was not affected by the growth of the plant. The susceptibility test results showed that the specific susceptibility to leukemias was maintained in the next generation of leukemic cells. The second generation of leukemic cells was administered with RNA-seq, and the susceptibility was detected by fusion and pick up. The number of copies of leukemia virus fusion gene is the same as that of leukemia virus, and the number of copies of leukemia cells is the same as that of leukemias. The results of the sensitivity tests of secondary and primary molecules show that the susceptibility of primary and secondary molecules is different from that of primary molecules. In the receptive cluster, there is a difference in the amount of RNA-seq between the two groups. The number of variables in the cluster is the same as that in the complex cluster, and the receptive cluster is sensitive. The rest of the JPLSG research program is based on a research program that makes use of possible analytical methods to start the study.