胸腺腫および関連自己免疫疾患におけるT細胞の網羅的遺伝子解析による免疫異常の解明

通过 T 细胞的综合遗传分析阐明胸腺瘤和相关自身免疫性疾病的免疫异常

• 批准号: 21K16302
• 负责人: 川上 徹
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Shinshu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K16302/
• 关键词: 胸腺腫; 赤芽球癆; STAT3; ターゲットシーケンス; クローン性造血; T細胞受容体; T細胞; 体細胞遺伝子変異; 自己免疫疾患

本研究の目的は、胸腺腫症例のT細胞の遺伝子変異プロファイルを網羅的遺伝子解析により明らかにし、胸腺腫および関連する自己免疫疾患の診療に有用な新規指標を確立することである。先行研究においてCD4陽性細胞とCD8陽性細胞に分けて全エクソン解析を行い、結果を比較することでCD4陽性細胞、CD8陽性細胞それぞれに特徴的な遺伝子群を同定していたが、それに細胞シグナル伝達、細胞増殖、細胞周期といった機能に関連する遺伝子やT細胞性リンパ腫、クローン性造血などに重要な影響をもつと考えられる遺伝子等を加え、52遺伝子からなる遺伝子解析パネルを作成した。続いて、胸腺腫を含む、のべ132症例の末梢血単核球からDNAを抽出し、作成したパネルを用いてライブラリ化し、ターゲットシーケンスを行った。変異アリル頻度が高い遺伝子についてはダイレクトシーケンスで確認を行った。以前の研究と結果を比較し、解析方法の妥当性を確認した。遺伝子多型やエラーと考えられる変異の除去を行った結果、各症例ごとに中央値で3個の体細胞遺伝子変異を同定し、STAT3遺伝子を含む41遺伝子が複数症例で変異していた。特に、クローン性造血に関わる複数の遺伝子の変異が高頻度に認められた。赤芽球を合併した胸腺腫では他の病型と比較し、変異遺伝子数が少ない傾向があった。一部のクローン性造血関連遺伝子の変異陽性例では免疫抑制療法後に再発しやすい傾向がみられた。今後、可能な症例では時系列に沿った解析を行い、臨床経過との比較を行う方針である。

The aim of this study was to establish new markers useful in the diagnosis and treatment of thymic disorders by analyzing the genetic diversity of T cells in thymic patients. In the first study, CD4-positive cells and CD8-positive cells were separated and analyzed completely. The results were compared. CD4-positive cells and CD8-positive cells were identified and characterized by the same genetic subgroup. The relationship between cell proliferation and cell cycle function was studied. The important influence of hematopoiesis is to increase the number of genes, 52 to analyze the number of genes, etc. In 132 cases of thymoma, DNA was extracted from the peripheral blood of the patient and the patient was treated with high concentration of DNA. The frequency of the change is high, and it is confirmed that the change is caused by the change of color. The results of previous studies were compared and the validity of analytical methods was confirmed. The results showed that there were 3 somatic gene variants in each case, and 4 somatic gene variants in each case. Special, multi-sex hematopoiesis related to the number of different genes and high frequency of recognition. The number of red buds combined with thymoma tended to be less than that of other diseases. A number of heterogeneously positive cases of hematopoietic related genes tended to relapse after immunosuppressive therapy. In the future, possible cases, time series, analysis, clinical trials, comparison and policy

项目成果

Comparative analysis of humoral responses to BNT162b2 vaccine among patients with hematologic disorders and organ transplant recipients.

• DOI: 10.1016/j.trim.2022.101713
• 发表时间: 2022-12
• 期刊: TRANSPLANT IMMUNOLOGY
• 影响因子: 1.5
• 作者: Nakazawa, Hideyuki;Sakai, Kaoko;Sudo, Yuriko;Iwabuchi, Ryohei;Sakai, Hitoshi;Nishina, Sayaka;Kawakami, Toru;Kawakami, Fumihiro;Matsuzawa, Shuji;Ito, Toshiro;Kitahara, Mari;Kamijo, Yuji;Umemura, Takeji;Ushiki, Atsuhito;Kanai, Shinichiro;Tsuchiya, Hiroyuki;Ishida, Fumihiro
• 通讯作者: Ishida, Fumihiro

T cell clonal expansion and STAT3 mutations: a characteristic feature of acquired chronic T cell-mediated pure red cell aplasia

• DOI: 10.1007/s12185-022-03310-2
• 发表时间: 2022-03-11
• 期刊: INTERNATIONAL JOURNAL OF HEMATOLOGY
• 影响因子: 2.1
• 作者: Kawakami, Fumihiro;Kawakami, Toru;Ishida, Fumihiro
• 通讯作者: Ishida, Fumihiro

A novel germline GATA2 frameshift mutation with a premature stop codon in a family with congenital sensory hearing loss and myelodysplastic syndrome

先天性感觉性听力损失和骨髓增生异常综合征家族中一种新型种系 GATA2 移码突变，具有提前终止密码子

• DOI: 10.1007/s12185-021-03130-w
• 发表时间: 2021
• 期刊: International Journal of Hematology
• 影响因子: 2.1
• 作者: Nakazawa Hideyuki;Yamaguchi Tomomi;Sakai Hitoshi;Maruyama Masae;Kawakami Toru;Kawakami Fumihiro;Nishina Sayaka;Ishikawa Masumi;Kosho Tomoki;Ishida Fumihiro
• 通讯作者: Ishida Fumihiro

Characteristic mutational profiles of STAT3 and clonal hematopoiesis-related genes in acquired PRCA

获得性 PRCA 中 STAT3 和克隆造血相关基因的特征突变谱

• 发表时间: 2022
• 作者: Toru Kawakami;Taku Yamane;Fumihiro Kawakami;Masae Maruyama;Natsumi Ida;Yuga Mizuno;Ami Asakura;Sayaka Nishina;Hitoshi Sakai;Yumiko Higuchi;Hideyuki Nakazawa;Fumihiro Ishida
• 通讯作者: Fumihiro Ishida