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マイクロサテライト不安定化を指標にした個体の早期老化状態の検出

以微卫星不稳定为指标检测个体的早期衰老状态

基本信息

批准号：
22K17837
负责人：
隈本宗一郎
金额：
$ 2.91万
依托单位：
Waseda University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K17837/
关键词：
染色体不安定化マイクロサテライト老化

项目摘要

個体の様々な細胞種における老化細胞特異的な遺伝子発現パターンや核相異常などが明らかになりつつある。しかし、老化細胞で示唆されているマイクロサテライト不安定化に関して、配列特異性、頻度および変異導入メカニズムは明らかになっていない。また老化状態検出法において、血中成分や遺伝子発現を指標にした老化や特定加齢性疾患の評価が試みられているが、いまだ早期老化状態を反映するマーカー遺伝子は特定されていない。従来の検出法の問題点として、マーカー遺伝子の発現量が低く、RNAはゲノムDNAと比較して不安定であるため取り扱いや長期保存が難しかった。従って、加齢におけるマイクロサテライト不安定化の解析を進めてきた。2022年度は哺乳類ゲノムに対してリピートプローブを用いたゲノム解析が報告されていなかったため、初めにAGリピートプローブによるマイクロサテライト解析を実施した。コントロールとして若年のC57BL/6NJclマウスより肝臓、肺および腎臓を摘出し、MiCAPsによるライブラリーを作成した。結果、各ライブラリー間で検出される遺伝子座が異なっており、安定して検出可能な共通の遺伝子座を絞り込む必要がある。また、クラスタリング解析の結果から、各サンプル間でのマイクロサテライト配列の相関は類似していたものの、いくつかのサンプルではクラスタリング位置が外れており、取得するデータ量およびマイクロサテライト領域を決定し、最適な条件を検討する。以上の結果から、マウスをモデルとして、AGリピートを対象としたマイクロサテライト領域の網羅的なデータを取得することができた。

個体の様々な細胞種における老化細胞特異的な遺伝子発現パターンや核相異常などが明らかになりつつある。しかし、老化細胞で示唆されているマイクロサテライト不安定化に関して、配列特異性、頻度および変異導入メカニズムは明らかになっていない。また老化状態検出法において、血中成分や遺伝子発現を指標にした老化や特定加齢性疾患の評価が試みられているが、いまだ早期老化状態を反映するマーカー遺伝子は特定されていない。未来的法律将限制申请点的数量，限制RNA的提取量，限制DNA的提取量，限制DNA的提取量，限制申请期的保存量。従って、加齢におけるマイクロサテライト不安定化の解析を進めてきた。2022年年度母乳喂养婴儿补助金发放补偿金负担解除分析公告补助金发放补偿金，初始阶段AG发放母乳喂养补助金负担解除分析措施。如果年内C57BL/6NJcl出现肝硬化，则需进行肝硬化治疗，MiCAPs则需进行肝硬化治疗。結果、各ライブラリー間で検出される遺伝子座が異なっており、安定して検出可能な共通の遺伝子座を絞り込む必要がある。また、クラスタリング解析の結果から、各サンプル間でのマイクロサテライト配列の相関は類似していたものの、いくつかのサンプルではクラスタリング位置が外れており、取得するデータ量およびマイクロサテライト領域を決定し、最適な条件を検討する。以上的水果罐头、调味品罐头、AG食品类食品。