大腸菌の挿入因子IS1及びIS3の転移とその調節機構に関する研究
大腸菌の挿入因子IS1及びIS3の転移とその調節機構に関する研究
批准号:
09780624
负责人:
関根 靖彦
金额:
$1.28万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份:
1997
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1997 至 1998
中文摘要
(1) IS1、IS3の転移に関与する宿主因子の検索;IS1、IS3において転移に影響を与える因子を検索、同定するために、各種の大腸菌変異株(ヒストン様タンパク質[IHF,H-NS,HU,FIS,StpA,Dps,Hfq]、組換え関連タンパク質[RecQ,RuvCJ)におけるISの転移能や環状IS分子の生成の有無を調べたところ、H-NS欠損株ではIS1の転移が起こらないことがわかり、H-NSがIS1転移に必須な宿主因子であることがわかった。(2) IS1、IS3のトランスポゼース、及びインヒビタータンパク質(IS1InsAタンパク質、IS3OrfAタンパク質)の精製;IS1、IS3の転移反応の生化学的解析を行うために、これらのタンパク質をポリヒスチジンのタグ(His-tag)との融合タンパク質の形で大腸菌内で過剰産生ずることを試みた。その結果、IS1のトランスポゼース及びInsAタンパク質、IS3のOrfAタンパク質の過剰産生に成功し、これらをHis-tagにアフィニティーをもつNi-NTA力ラムによるクロマトグラフィー、ゲルろ過法などで精製した。残念ながら、IS3のトランスポゼースについては、様々な条件で過剰産生を試みたが、成功には至っていない。(3) 精製タンパク質の生化学的解析;精製したIS1のトランスポゼース及びInsAタンパク質のIs末端の逆向き反復配列への結合能を調べたところ、どちらのタンパク質も逆向き反復配列特異的なDNA結合活性を持つことがわかった。現在、IS3のOrfAタンパク質のDNA結合活性、IS1のトランスポゼースのISの末端でのDNA鎖の切断活性について検討中である。(4) IS3の遺伝子発現におけるRRFの関与;翻訳の終結反応に必須なribosome rec ycIing factor(RRF)の変異によって、IS3のorfBの開始コドンを改変した遺伝子の翻訳開始が異常になることを発見した。
英文摘要
(1) IS1、IS3の転移に関与する宿主因子の検索;IS1、IS3において転移に影響を与える因子を検索、同定するために、各種の大腸菌変異株(ヒストン様タンパク質[IHF,H-NS,HU,FIS,StpA,Dps,Hfq]、組換え関連タンパク質[RecQ,RuvCJ)におけるISの転移能や環状IS分子の生成の有無を調べたところ、H-NS欠損株ではIS1の転移が起こらないことがわかり、H-NSがIS1転移に必須な宿主因子であることがわかった。(2) IS1、IS3のトランスポゼース、及びインヒビタータンパク質(IS1InsAタンパク質、IS3OrfAタンパク質)の精製;IS1、IS3の転移反応の生化学的解析を行うために、これらのタンパク質をポリヒスチジンのタグ(His-tag)との融合タンパク質の形で大腸菌内で過剰産生ずることを試みた。その結果、IS1のトランスポゼース及びInsAタンパク質、IS3のOrfAタンパク質の過剰産生に成功し、これらをHis-tagにアフィニティーをもつNi-NTA力ラムによるクロマトグラフィー、ゲルろ過法などで精製した。残念ながら、IS3のトランスポゼースについては、様々な条件で過剰産生を試みたが、成功には至っていない。(3) 精製タンパク質の生化学的解析;精製したIS1のトランスポゼース及びInsAタンパク質のIs末端の逆向き反復配列への結合能を調べたところ、どちらのタンパク質も逆向き反復配列特異的なDNA結合活性を持つことがわかった。現在、IS3のOrfAタンパク質のDNA結合活性、IS1のトランスポゼースのISの末端でのDNA鎖の切断活性について検討中である。(4) IS3の遺伝子発現におけるRRFの関与;翻訳の終結反応に必須なribosome rec ycIing factor(RRF)の変異によって、IS3のorfBの開始コドンを改変した遺伝子の翻訳開始が異常になることを発見した。
期刊论文(4)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Y.Sekine: "Inhibition of transpositional recombination by OrfA and OrfB proteins encoded by insertion sequence IS3" Genes to Cells. 2. 547-557 (1997)
Y.Sekine:“插入序列 IS3 编码的 OrfA 和 OrfB 蛋白对转座重组的抑制”基因到细胞。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
L.Janosi: "Evidence for in vivo ribosome recycling,the fourth step in protein biosynthesis." EMBO J.17. 1141-1151 (1998)
L.Janosi:“体内核糖体回收的证据,这是蛋白质生物合成的第四步。”
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
tRNA修飾塩基ライシジンの生合成機構の解析とそれを標的とする創薬へ向けた研究
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批准号:16657041
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2004
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负责人:関根 靖彦
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依托单位:
バクテリアのtRNA修飾酵素遺伝子の網羅的同定とtRNA修飾塩基の機能解析
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批准号:14014249
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.84万
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财政年份:2002
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负责人:関根 靖彦
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依托单位:
バクテリアの転移性遺伝因子ISの転移とその制御の分子機構
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批准号:13780546
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.6万
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财政年份:2001
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负责人:関根 靖彦
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依托单位:
大腸菌の全tRNA修飾酵素遺伝子の同定とtRNA修飾塩基の網羅的機能解析
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批准号:13206018
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$3.39万
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财政年份:2001
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负责人:関根 靖彦
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依托单位:
大腸菌の挿入因子ISの転移とその制御の分子機構
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批准号:11780488
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1999
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负责人:関根 靖彦
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依托单位:
大腸菌の挿入因子IS3の転移機構に関する研究
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批准号:07780591
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1995
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负责人:関根 靖彦
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依托单位:
大腸菌の挿入因子IS1及びIS3の転移機構に関する研究
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批准号:05780497
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1993
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负责人:関根 靖彦
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依托单位:
大腸菌の挿入因子ISの転移とその調節機構に関する研究
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批准号:04780257
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1992
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负责人:関根 靖彦
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依托单位:
挿入因子IS1の遺伝子発現に関与するフレームシフト機構に関する研究
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批准号:02954203
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (Research Fellowship)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1990
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负责人:関根 靖彦
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依托单位:
海外基金