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ゲノム解析的手法を用いた鳥類と爬虫類の染色体比較研究

使用基因组分析方法进行鸟类和爬行动物的比较染色体研究

基本信息

批准号：
13874100
负责人：
松田洋一
金额：
$ 1.34万
依托单位：
Hokkaido University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2001
资助国家：
日本
起止时间：
2001 至 2002
项目状态：
已结题

项目摘要

昨年度はスッポンの脳と14日胚のcDNAライブラリーから得られた、ESTクローンを用いて、世界初の爬虫類の染色体地図を作製した。今年度は、シマヘビ(Elaphe quadrivirgata)の脳よりcDNAライブラリーを作製し、ランダムに単離したcDNAの部分配列を決定することにより2097種類のESTクローンを得た。NCBIのデータベースを用いてホモロジー検索を行い、既知のヒト機能遺伝子のスッポンホモログを94個同定した。次に、ダイレクトR-バンディングFISH法をシマヘビ染色体に応用し、66個のヒト遺伝子ホモログをシマヘビ染色体上にマッピングすることによって、ヒト-シマヘビ間の比較染色体地図を作製した。染色体の識別が可能な1-6番染色体とZ染色体上には58の機能遺伝子がマッピングされ、ヒト染色体との間に30の相同領域を検出した。次に、得られた結果を既知のヒト-ニワトリ間の比較染色体地図と比較し、ヒトとの染色体相同領域を介してシマヘビ-ニワトリ間の染色体相同性を調べた。そして、昨年度に作製されたスッポンの染色体地図と比較した結果、シマヘビにおいてもニワトリとの間に多くの染色体相同領域の存在が確認されたが,ゲノム全体での相同性をみれば,ニワトリ-スッポン間よりニワトリ-シマヘビ間のほうが染色体の保存性が低い傾向がみられた.これまでカメ類は無弓類に分類され,ヘビ・トカゲ類(鱗竜類)や鳥類・ワニ類(主竜類)を含む双弓類とは別系統とされていたが,最近のミトコンドリアDNAや核遺伝子の塩基配列の解析から,カメ類はヘビ・トカゲ類よりも鳥類とワニ類に近縁であると推定されている.我々のデータは,この説を裏づける結果となっている.またシマヘビのZ染色体とニワトリのZ染色体間には対応が見られず、ヘビとニワトリで独立に性染色体が分化したことが示唆された。

On the 14th day of the year, cDNA was successful, EST was used, and the chromosomes of the world's first reptiles were used. For the current year, in the current year, we need to improve the performance of the cDNA. In this year, we will make a decision on how to improve the performance of the EST in the cDNA section of this year. In this year, we will be able to make a decision on how to make a decision. In this year, we will be able to make a decision on how to improve the performance of the EST. NCBI is responsible for the purchase and purchase of 94 identical licenses, which is known to be possible under the same license. In the second half of the year, the FISH method was used to compare the chromosomes on the chromosomes. The results were compared with those on the chromosomes. It is possible that the 58-fold chromosome on the chromosome 1-6 may be able to transmit data in the same field as in the same field. According to the results of secondary tests, it is known that the two chromosomes are identical in the same field as that in the same field. Last year, the results of chromosome comparison were compared in the same field of chromosomes. in the same field of chromosomes, it is confirmed that there are many chromosomes in the same field. all chromosomes are similar to each other. There is no bow classification in this category, and there is a double-bow classification in this category (primary category). Recently, the DNA nuclear subsystem is configured to parse the data, and the license type is used to verify that the cluster is presumed to be sensitive. I am sorry to hear that the results are very bad. The Z chromosomes were isolated, the Z chromosomes were separated, and the differentiation of sex chromosomes was detected.