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分子細胞遺伝学的手法を用いた世界初のプラナリア染色体地図作製の試み

世界首次尝试使用分子细胞遗传学方法创建涡虫染色体图谱

基本信息

批准号：
16657001
负责人：
松田洋一
金额：
$ 2.18万
依托单位：
Hokkaido University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2005
项目状态：
已结题

项目摘要

16年度には、理化学研究所発生・再生科学総合研究センターで維持されている日本産プラナリア(Dugesia japonica)系統を用いて、プラナリアの染色体標本の作製法とFISH解析システムを確立し、プラナリアにおける世界初の機能遺伝子の高精度染色体マッピングに成功した。今年度は、スペイン産プラナリア(Schmidtea mediterranea)の無性生殖系統を用いて核型解析と染色体マッピングを行った。D.japonicaが2n=16で全て両腕染色体(FN=32)であったのに対しS.mediterraneaの染色体数は2n=8(FN=16)であった。Q-、R-、C-分染法を用いて詳細な解析を行った結果、1番染色体と3番染色体間で転座が生じ、この系統では染色体構造変化がヘテロ型で固定していた。生じた構造変化のパターンを明らかにするため、MHC,noudarake,1993HH,DjotxA,DjotxBの5遺伝子、18S rRNA遺伝子、(TTAGGG)nテロメア配列を用いて、染色体マッピングを行った。その結果、用いた機能遺伝子は全て1番染色体に存在し、短腕からnoudarake-DjotxA-MHC-DjotxB-1993HHのオーダーでマップされた。そして、MHC-DjotxB間で染色体の切断が生じ、遠位部側の染色体断片と3番染色体の長腕間で転座が生じたことが判明した。さらに、DjotxBと1993HHを含む領域で欠失が生じたことも明らかとなった。また、本研究においてプラナリアで開発した染色体解析法をホヤの染色体解析にも応用し、京都大学の研究グループとの共同研究でホヤのイディオグラムと染色体地図の作製に協力した。

In 2016, the Institute of Physical Chemistry and Chemical Sciences developed and maintained a comprehensive research institute for the development and maintenance of Dugesia japonica system. FISH analysis of chromosome DNA was successfully established and the high-precision chromosome DNA analysis of the world's first functional gene was successfully established. This year, the asexual reproductive system of Schmidtea mediterranea was analyzed by karyotype and chromosome analysis. D.japonica has a total chromosome number of 2n=16 (FN=32) and S.mediterranea has a chromosome number of 2n=8(FN=16). Q-, R-and C-staining methods were used to analyze the results in detail. Chromosome 1 and chromosome 3 were formed, and chromosome structure was changed. The genetic structure of DjotxA, DjotxB, DjotxB, DjotxA, DjotxB, DjotxB,DjotxA,DjotxB, DjotxB,DjotxA,DjotxB,DjotxA, DjotxB, DjotxB,DjotxA,DjotxB,DjotxB, DjotA,DjotxB,DjotxA, DjotxB, DjotA, DjotxB, DjotxA, DjotxB, DjotA, DjotxB, DjotxB, DjotA, DjotxB, DjotA, DjotxB As a result, the functional gene is completely present in the chromosome, and the short arm is removed from the noudarake-DjotxA-MHC-DjotxB-1993HH. The chromosome fragmentation between MHC and DjotxB was identified. The chromosome fragmentation on the distal side was identified. DjotxB 1993HH contains the missing field. This study was conducted in collaboration with Kyoto University in the development of chromosome analysis methods.