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ソメワケササクレヤモリを用いた爬虫類初の性決定遺伝子の同定

使用 Somewakesasakure 壁虎鉴定爬行动物中第一个性别决定基因

基本信息

批准号：
18K06362
负责人：
松田洋一
金额：
$ 2.83万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2018
资助国家：
日本
起止时间：
2018-04-01 至 2020-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

ソメワケササクレヤモリ(Paroedura picta)はZZ/ZW型の性染色体構成を持つと考えられていることから、C-ヘテロクロマチン、テロメア配列、マイクロサテライトDNA配列のコピー数を指標に性染色体の同定を試みたが、これらに違いがみられる染色体対は同定できなかった。そこで、過去の我々の研究（Kawai et al. Chromosoma 118, 43-51, 2009）でZW型の性染色体の遺伝連鎖群が同定され、さらにはZ-W染色体間で構造変化が生じた領域が明らかにされているミナミヤモリ(Gekko hokouensis)との比較ゲノム解析を行うことによって、ソメワケササクレヤモリの性分化関連候補遺伝子の検出を試みることにした。ソメワケササクレヤモリの全ゲノム配列はすでに読まれていることから、本研究ではPacBio RSIIシステムを用いてミナミヤモリのZW型雌個体の全ゲノム配列解析を実施し、X30の長鎖リード情報を得て、そのアセンブリングを終了した。さらに、ミナミヤモリの雌雄の生殖腺から、Z-W染色体間で構造変化がみられるゲノム領域に存在するDMRT1とAco1遺伝子について、雌雄間で構造の違いがみられるcDNAクローンを得た。そして、ソメワケササクレヤモリでもこれらの遺伝子のZWホモログの単離を行うとともに、既存のソメワケササクレヤモリの全ゲノム配列と本研究で得られたミナミヤモリの情報をもとに、ソメワケササクレヤモリのZ-W間染色体間で分化が生じたゲノム領域を特定し、性分化に関わる候補領域の塩基配列を比較する。

Paroedura picta is a ZZ/ZW type sex chromosome composition indicator. The number of chromosomes in DNA alignment is an indicator of sex chromosome identity. A Study of the Past and the Past (Kawai et al. Chromosome 118, 43-51, 2009) The genetic linkage group of ZW-type sex chromosomes is determined, and the structural transformation between Z-W chromosomes occurs.(Gekko hokouensis) and the comparison of the analysis of the line, the detection of the sex differentiation candidate, the detection of the test. In this study, we conducted a study on the use of PacBio RSII in the analysis of all-female distribution of ZW type females, and obtained long-term locking information for X30. In addition, the structure of male and female gonads, Z-W chromosome structure, and the existence of DMRT1 and Aco1 gene in the field of gonads, and the structure of male and female gonads, and the structure of Z-W chromosome structure, and the existence of DMRT1 and Aco1 gene in the field of gonads, and the structure of male and female gonads, and the structure of Z-W chromosome structure, and the existence of DMRT1 and Aco1 gene. In this study, we obtained a comparison of the gene alignment between Z-W chromosomes and Z-W chromosomes in specific and sex-differentiated candidate domains.