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ヒト少量血液からの対象ゲノム領域クローニング新手法の開発

ヒト少量血液からの対象ゲノム領域クローニング新手法の開発
开发一种从少量人类血液中克隆靶基因组区域的新方法
批准号:
16659091
负责人:
木村 穣
金额:
$1.66万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 2005

项目摘要

项目成果

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本年度は以下の成果を得た。1)血液からのDNA抽出法の検討昨年度はDNA抽出法を中心に検討し、多くの研究室で使用されるQuiagen社のDNA抽出キットに比べ、膜を利用したDNA抽出器は操作時間が約5-10分/検体と非常に短時間ですみ、一年程度冷蔵保存の血液からでも50-100KbのDNAを回収できた。本年度はこれを実践的に応用し、研究室のメンバー10人で再現性のよい結果を得た。医の倫理委員会ですでに承認を受けた研究計画について患者群のDNAについても今後検討する。2)クローニング条件の検討件については、昨年度、大腸菌のETクローニング法におけるクローニング条件の検討し、大腸菌株の選定を行った。当初、非常に期待していた方法であったが、この方法は対象領域が10Kb以上になってくると組換え率が非常に低くなることが判明した。これではETクローニング法のよさが活かせないため、次いで非対称的なcohesive末端を生じる制限酵素を用いる方法をモデルゲノムとして酵母を対象に検討した。約10KbまでのDNA断片について、ゲノムからのdirect cloningを試みたところ、回収したクローンはほぼ全例目的の領域を含んでいた。ヒトゲノムの際はcomplexityが高いため、分子量によるDNA分画等を行わねばならないと思われるが、極めて期待が持てる方法と言える。以上をもとに、今後ますます実用化への道を目指したい。
期刊论文(8)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1016/j.bbrc.2004.12.057
发表时间: 2005-02-18
期刊: BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS
影响因子: 3.1
作者: [Sakurai, T, Sato, M, Kimura, M]
通讯作者: Kimura, M
Possible roles of zic1 and zic4, identified within the medaka Double anal fin(Da)locus, in dorsoventral patterning of the trunk-tail region(related to the phenotypes of the Da mutant).
zic1 和 zic4 在青鳉双肛鳍 (Da) 基因座中鉴定出的可能作用,在躯干尾部区域的背腹侧模式中(与 Da 突变体的表型相关)。
DOI: --
发表时间: 2004
期刊: Mechanism of Development 121
影响因子: --
作者: [Otsuka, M., et al.]
通讯作者: et al.
CHOP : visualization of 'wobbling' and isolation of highly conserved regions from aligned DNA sequences
CHOP:“摆动”的可视化以及从比对的 DNA 序列中分离高度保守的区域
DOI: --
发表时间: 2004
期刊: Nucleic Acids Res. 32
影响因子: --
作者: [Ohmi Y., Sato M., Ohtsuka M, Ohtsuka M. et al.]
通讯作者: Ohtsuka M. et al.
遺伝子操作マウスを用いた神経障害エステラーゼの新規機能解明
  • 批准号:
    21K06847
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额:
    $2.66万
  • 财政年份:
    2021
  • 负责人:
    木村 穣
  • 依托单位:
受精後の初期発生プログラムに連動するポリA鎖伸長母性RNAの網羅的アプローチ
  • 批准号:
    13202059
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
  • 资助金额:
    $2.56万
  • 财政年份:
    2001
  • 负责人:
    木村 穣
  • 依托单位:
マウス初期胚母性RNAの時期特異的ポリ(A)鎖伸長の意義
  • 批准号:
    12029221
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
  • 资助金额:
    $1.34万
  • 财政年份:
    2000
  • 负责人:
    木村 穣
  • 依托单位:
マウス初期胚発生における母性RNAのStage-specificな構造的変化
  • 批准号:
    11155223
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
  • 资助金额:
    $1.28万
  • 财政年份:
    1999
  • 负责人:
    木村 穣
  • 依托单位: